zzh - git server for zzh ICT

zzh pushed to main at zzh/twirls

1a02c97c66 计算了hs，还没验证，需要修改线程的参数，将结果直接写入对应的知识颗粒目录里，不需要在内存中合并

2023-09-21 15:24:20 +08:00

zzh pushed to main at zzh/twirls

ae3fbe017d 完成pubmed txt文件的处理，将cerr改成cout，因为这样在matlab里调用的时候，可以在命令行窗口显示错误信息

2023-09-19 23:36:09 +08:00

zzh pushed to main at zzh/twirls

efac589b58 重构代码，将公共使用的部分提取出来，完成了pubmed txt的处理逻辑，还没有完成写入mat文件部分

2023-09-19 11:17:54 +08:00

zzh pushed to main at zzh/twirls

7ced32b592 加入线程池

2023-09-18 02:38:34 +08:00

zzh pushed to main at zzh/twirls

f9e3d038c1 多线程处理给定的文件夹下的所有子目录，进行高斯混合模型拟合

2023-09-18 01:35:10 +08:00

zzh pushed to main at zzh/twirls

fb5fe032a4 将随机模拟加入项目中，创建了高斯混合模型的工程

2023-09-18 00:11:01 +08:00

zzh created repository zzh/twirls

2023-09-12 15:14:42 +08:00

zzh pushed to main at zzh/sw_perf

c04c6541ef 解决了读文件的bug，原因是target有些行是0，没有碱基，保留了测试代码

2023-09-03 23:59:28 +08:00

zzh pushed to main at zzh/sw_perf

395b2e598d 之前的内存崩溃可能是wsl 1.的问题，更新2版本之后，解决

2023-08-28 00:10:48 +08:00

zzh pushed to main at zzh/sw_perf

f81871eff5 运行大的数据会内存崩溃，还没解决

2023-08-27 16:43:23 +08:00

zzh pushed to main at zzh/sw_perf

78f791f3f2 解决了读数据的bug，和avx2的bug，保留了一些调试代码

2023-08-27 01:02:01 +08:00

zzh pushed to main at zzh/sw_perf

2aeb566bf7 添加了debug打印信息

2023-08-26 03:00:20 +08:00

zzh pushed to main at zzh/sw_perf

b53569db63 代码重构，总共7个kernel

2023-08-26 00:38:42 +08:00

zzh pushed to main at zzh/sw_perf

b95e622e7a 添加了内存对齐，性能提升5%，解决了对齐内存引入的bug

2023-08-25 14:47:36 +08:00

zzh pushed to main at zzh/bwa

aa31eac682 合并更改（run.sh）

79f174cc57 增加run.sh

Compare 2 commits »

2023-08-24 14:30:07 +08:00

zzh pushed to main at zzh/bwa

74ebd77ce2 增加时间统计，avx2实现的bsw

2023-08-24 14:26:08 +08:00

zzh created repository zzh/bwa_perf

2023-08-23 11:32:55 +08:00

zzh pushed to main at zzh/sw_perf

b58cc1f574 将sw动态开辟内存改成静态数组

2023-08-22 11:25:39 +08:00

zzh pushed to main at zzh/sw_perf

3f06d433e7 解决了avx2_u8，剪枝find_max的bug

2023-08-20 02:40:26 +08:00

zzh pushed to main at zzh/sw_perf

775297a813 加了对find_max剪枝的优化

2023-08-20 02:16:30 +08:00