将bwa的sw extend代码部分抽出来，做benchmark

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zzh 3f06d433e7 解决了avx2_u8，剪枝find_max的bug		2023-08-20 02:40:22 +08:00
.vscode	加了对find_max剪枝的优化	2023-08-20 02:16:25 +08:00
.gitignore	初始化bsw文件	2023-08-15 22:19:39 +08:00
Makefile	对avx2实现的sw的各个部分运行时间进行了测试	2023-08-18 15:42:46 +08:00
README.md	更新readme	2023-08-10 15:30:39 +08:00
bsw_avx2.c	加了对find_max剪枝的优化	2023-08-20 02:16:25 +08:00
discrete_mem_main.c	测试不同内存开辟策略的影响	2023-08-11 00:35:43 +08:00
ksw_avx2.c	初始化bsw文件	2023-08-15 22:19:39 +08:00
ksw_avx2_u8.c	解决了avx2_u8，剪枝find_max的bug	2023-08-20 02:40:22 +08:00
ksw_cuda.c	初始化仓库，已经实现了normal和avx2的sw，并进行了性能测试	2023-08-10 15:28:45 +08:00
ksw_normal.c	解决了avx2_u8，剪枝find_max的bug	2023-08-20 02:40:22 +08:00
main.c	加了对find_max剪枝的优化	2023-08-20 02:16:25 +08:00

sw_perf