sw_perf/README.md

# sw_perf
- 对bwa的sw相关代码进行抽取和优化实现，做成benchmark
- bwa有三个部分包含sw算法，分别是seed-extension阶段，生成sam阶段的计算pair-end align分值，以及最后生成cigar的global
- 实现avx2和cuda版本，并进行性能对比
-												更新readme

											
										
										
											2023-08-10 15:30:39 +08:00
+								# sw_perf
-												sw benchmark，对extend部分做了全部的优化，去除target倒序，减少FIND_MAX次数

											
										
										
											2024-04-11 13:29:28 +08:00
+								- 对bwa的sw相关代码进行抽取和优化实现，做成benchmark
 								- bwa有三个部分包含sw算法，分别是seed-extension阶段，生成sam阶段的计算pair-end align分值，以及最后生成cigar的global
-												更新readme

											
										
										
											2023-08-10 15:30:39 +08:00
+								- 实现avx2和cuda版本，并进行性能对比