 zzh
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85515ac06e
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添加了dupset信息，还不完善
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2024-08-29 16:40:52 +08:00 |
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7352a00f2c
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需要完善optical dup idx计算
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2024-08-28 12:00:23 +08:00 |
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zzh
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022be611cd
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检查optical duplication，用graph来检测，正在写这个
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2024-08-22 02:28:36 +08:00 |
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zzh
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38bc489004
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串行程序没有错误了，用vector代替set成功，时间减少了一半
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2023-12-08 03:57:30 +08:00 |
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zzh
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2d114058a1
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normal没问题了，tumor结果还不一样
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2023-12-04 18:02:07 +08:00 |
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zzh
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36b1430da5
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串行得到了正确的结果，但还需优化
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2023-11-28 10:45:40 +08:00 |
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zzh
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97d35a42e9
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并行处理框架搭建完成，基本完成了工作线程处理逻辑
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2023-11-09 21:07:58 +08:00 |
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zzh
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a3a0b64ef2
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重构，修改bambuf，支持清理某个read之前的缓存
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2023-11-06 12:38:30 +08:00 |
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zzh
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023836a047
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基本完成了参数的处理，帮助信息里有些参数需要删掉
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2023-11-01 10:48:02 +08:00 |
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zzh
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95b0f685ff
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配置了cmake和调试环境
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2023-10-23 23:07:00 +08:00 |
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zzh
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a2a9067ec5
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init stubs
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2023-10-23 21:48:31 +08:00 |