chartl 8a0e813b04 A helper script that will take a list of bams, a list of case sample IDs, and a list of control sample IDs, and generate a sample meta data yaml (which includes the bamfiles) ... git-svn-id: file:///humgen/gsa-scr1/gsa-engineering/svn_contents/trunk@5482 348d0f76-0448-11de-a6fe-93d51630548a		2011-03-21 16:11:55 +00:00
..
genomicAnnotatorScripts	…
1kgStatsForCalls.py	…
AnnotateVCFwithMAF.py	…
JobDispatcher.py	…
JobDispatcherExample.py	…
MPGQueuePipelineStatus.py	…
ParseDCCSequenceData.py	…
RefseqLibrary.py	…
RunPilot2Pipeline.py	…
SyzygyCallsFileToVCF.py	…
VCFValidationAnalysis.py	…
Verify1KGArchiveBAMs.py	…
analyzeRunReports.py	…
collectCalls.py	…
countCoverageWithSamtools.py	…
createCaseControlMetaData.py	…
dataProcessingPaper.py	…
expandedSummaryToVCF.py	…
faiReader.py	…
farm_commands.py	…
farm_commands2.py	…
fasta.py	…
firehose_out_email.py	…
fixSoapSnp.py	…
gatherIndelsToVCF.py	…
gatherSampleSummaries.py	…
gatkConfigParser.py	…
generate1KGHapmapVCF.py	…
getBamFilesFromSpreadsheet.py	…
getLaneAndSequenceInfo.py	…
getTargetedGenes.py	…
igvController.py	…
indelVerboseStats.py	…
lsf_post_touch.py	…
madPipelineUtils.py	…
makeIndelMask.py	…
makeMetricsFilesForFirehose.py	…
memo.py	…
mergeVCFInfoFields.py	…
picard_utils.py	…
privateMutationRates.py	…
pushback_file.py	…
realignBamByChr.py	…
recalAssociation.py	…
sample_lister.py	…
setFilterGenotypesToRef.py	…
splitIntervalsByContig.py	…
theoPost.py	…
ucscRepeatMaskToIntervalList.py	…
updateTribbleToCorrectSVNVersion.py	…
validatePosterior.py	…
vcf2table.py	…
vcfGenotypeToSites.py	…
vcfReader.py	…
vcf_b36_to_hg18.py	…