gatk-3.8/PairHMM_JNI/define-float.h

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4.3 KiB
C++

#include <iostream>
#ifdef PRECISION
#undef PRECISION
#undef MAIN_TYPE
#undef MAIN_TYPE_SIZE
#undef UNION_TYPE
#undef IF_128
#undef IF_MAIN_TYPE
#undef SHIFT_CONST1
#undef SHIFT_CONST2
#undef SHIFT_CONST3
#undef _128_TYPE
#undef _256_TYPE
#undef AVX_LENGTH
#undef MAVX_COUNT
#undef HAP_TYPE
#undef MASK_TYPE
#undef MASK_ALL_ONES
#undef SET_VEC_ZERO(__vec)
#undef VEC_OR(__v1, __v2)
#undef VEC_ADD(__v1, __v2)
#undef VEC_SUB(__v1, __v2)
#undef VEC_MUL(__v1, __v2)
#undef VEC_DIV(__v1, __v2)
#undef VEC_BLEND(__v1, __v2, __mask)
#undef VEC_BLENDV(__v1, __v2, __maskV)
#undef VEC_CAST_256_128(__v1)
#undef VEC_EXTRACT_128(__v1, __im)
#undef VEC_EXTRACT_UNIT(__v1, __im)
#undef VEC_SET1_VAL128(__val)
#undef VEC_MOVE(__v1, __val)
#undef VEC_CAST_128_256(__v1)
#undef VEC_INSERT_VAL(__v1, __val, __pos)
#undef VEC_CVT_128_256(__v1)
#undef VEC_SET1_VAL(__val)
#undef VEC_POPCVT_CHAR(__ch)
#undef VEC_LDPOPCVT_CHAR(__addr)
#undef VEC_CMP_EQ(__v1, __v2)
#undef VEC_SET_LSE(__val)
#undef SHIFT_HAP(__v1, __val)
#undef print256b(__v1)
#undef MASK_VEC
#undef VEC_SSE_TO_AVX(__vsLow, __vsHigh, __vdst)
#undef VEC_SHIFT_LEFT_1BIT(__vs)
#undef MASK_ALL_ONES
#undef COMPARE_VECS(__v1, __v2)
#undef _256_INT_TYPE
#endif
#define PRECISION s
#define MAIN_TYPE float
#define MAIN_TYPE_SIZE 32
#define UNION_TYPE mix_F
#define IF_128 IF_128f
#define IF_MAIN_TYPE IF_32
#define SHIFT_CONST1 12
#define SHIFT_CONST2 3
#define SHIFT_CONST3 4
#define _128_TYPE __m128
#define _256_TYPE __m256
#define _256_INT_TYPE __m256i
#define AVX_LENGTH 8
#define MAVX_COUNT (MROWS+7)/AVX_LENGTH
#define HAP_TYPE UNION_TYPE
#define MASK_TYPE uint32_t
#define MASK_ALL_ONES 0xFFFFFFFF
#define MASK_VEC MaskVec_F
#define SET_VEC_ZERO(__vec) \
__vec= _mm256_setzero_ps()
#define VEC_OR(__v1, __v2) \
_mm256_or_ps(__v1, __v2)
#define VEC_ADD(__v1, __v2) \
_mm256_add_ps(__v1, __v2)
#define VEC_SUB(__v1, __v2) \
_mm256_sub_ps(__v1, __v2)
#define VEC_MUL(__v1, __v2) \
_mm256_mul_ps(__v1, __v2)
#define VEC_DIV(__v1, __v2) \
_mm256_div_ps(__v1, __v2)
#define VEC_BLEND(__v1, __v2, __mask) \
_mm256_blend_ps(__v1, __v2, __mask)
#define VEC_BLENDV(__v1, __v2, __maskV) \
_mm256_blendv_ps(__v1, __v2, __maskV)
#define VEC_CAST_256_128(__v1) \
_mm256_castps256_ps128 (__v1)
#define VEC_EXTRACT_128(__v1, __im) \
_mm256_extractf128_ps (__v1, __im)
#define VEC_EXTRACT_UNIT(__v1, __im) \
_mm_extract_epi32(__v1, __im)
#define VEC_SET1_VAL128(__val) \
_mm_set1_ps(__val)
#define VEC_MOVE(__v1, __val) \
_mm_move_ss(__v1, __val)
#define VEC_CAST_128_256(__v1) \
_mm256_castps128_ps256(__v1)
#define VEC_INSERT_VAL(__v1, __val, __pos) \
_mm256_insertf128_ps(__v1, __val, __pos)
#define VEC_CVT_128_256(__v1) \
_mm256_cvtepi32_ps(__v1.i)
#define VEC_SET1_VAL(__val) \
_mm256_set1_ps(__val)
#define VEC_POPCVT_CHAR(__ch) \
_mm256_cvtepi32_ps(_mm256_set1_epi32(__ch))
#define VEC_LDPOPCVT_CHAR(__addr) \
_mm256_cvtepi32_ps(_mm256_loadu_si256((__m256i const *)__addr))
#define VEC_CMP_EQ(__v1, __v2) \
_mm256_cmp_ps(__v1, __v2, _CMP_EQ_OQ)
#define VEC_SET_LSE(__val) \
_mm256_set_ps(zero, zero, zero, zero, zero, zero, zero, __val);
#define SHIFT_HAP(__v1, __val) \
_vector_shift_lastavxs(__v1, __val.f);
#define print256b(__v1) \
print256bFP(__v1)
#define VEC_SSE_TO_AVX(__vsLow, __vsHigh, __vdst) \
__vdst = _mm256_castps128_ps256(__vsLow) ; \
__vdst = _mm256_insertf128_ps(__vdst, __vsHigh, 1) ;
#define VEC_SHIFT_LEFT_1BIT(__vs) \
__vs = _mm_slli_epi32(__vs, 1)
#define COMPARE_VECS(__v1, __v2, __first, __last) { \
float* ptr1 = (float*) (&__v1) ; \
float* ptr2 = (float*) (&__v2) ; \
for (int ei=__first; ei <= __last; ++ei) { \
if (ptr1[ei] != ptr2[ei]) { \
std::cout << "Float Mismatch at " << ei << ": " \
<< ptr1[ei] << " vs. " << ptr2[ei] << std::endl ; \
exit(0) ; \
} \
} \
}