gatk-3.8/public/testdata/VQSR.mixedTest.recal

8 lines
404 B
Plaintext

##fileformat=VCFv4.1
#CHROM POS ID REF ALT QUAL FILTER INFO
20 1000177 . N <VQSR> . . END=1000177;VQSLOD=-1.2345;culprit=FS
20 1000177 . N <VQSR> . . END=1000178;VQSLOD=-1.2377;culprit=HaplotypeScore
20 1000382 . N <VQSR> . . END=1000386;VQSLOD=-0.5534;culprit=HaplotypeScore
20 1000382 . N <VQSR> . . END=1000382;VQSLOD=-0.5678;culprit=FS
20 1000442 . N <VQSR> . . END=1000446;VQSLOD=3.5923;culprit=QD