From a063e79597fd82ae15264ec07ae48bcdbc285593 Mon Sep 17 00:00:00 2001 From: Mauricio Carneiro Date: Sat, 13 Apr 2013 09:07:13 -0400 Subject: [PATCH] Updating the exampleGRP.grp test file It had been generated with an old version of BQSRv2 and wasn't compatible with exampleBAM anymore. --- public/testdata/exampleGRP.grp | 2612 ++++++++++++++------------------ 1 file changed, 1106 insertions(+), 1506 deletions(-) diff --git a/public/testdata/exampleGRP.grp b/public/testdata/exampleGRP.grp index 2ec55ec57..61a10ac4a 100644 --- a/public/testdata/exampleGRP.grp +++ b/public/testdata/exampleGRP.grp @@ -1,1518 +1,1118 @@ #:GATKReport.v1.1:5 -#:GATKTable:2:14::; +#:GATKTable:2:18:%s:%s:; #:GATKTable:Arguments:Recalibration argument collection values used in this run -Argument Value -covariate null -default_platform null -deletions_context_size 8 -force_platform null -insertions_context_size 8 -insertions_default_quality 45 -low_quality_tail 2 -mismatches_context_size 2 -mismatches_default_quality -1 -no_standard_covs false -quantizing_levels 16 -run_without_dbsnp false -solid_nocall_strategy THROW_EXCEPTION -solid_recal_mode SET_Q_ZERO +Argument Value +binary_tag_name null +covariate ReadGroupCovariate,QualityScoreCovariate,ContextCovariate,CycleCovariate +default_platform null +deletions_default_quality 45 +force_platform null +indels_context_size 3 +insertions_default_quality 45 +low_quality_tail 2 +maximum_cycle_value 500 +mismatches_context_size 2 +mismatches_default_quality -1 +no_standard_covs false +plot_pdf_file null +quantizing_levels 16 +recalibration_report null +run_without_dbsnp false +solid_nocall_strategy THROW_EXCEPTION +solid_recal_mode SET_Q_ZERO -#:GATKTable:3:94:::; +#:GATKTable:3:94:%s:%s:%s:; #:GATKTable:Quantized:Quality quantization map QualityScore Count QuantizedScore -0 20 3 -1 0 3 -2 6 3 -3 1041 3 -4 8 3 -5 190 3 -6 102 3 -7 28 7 -8 795 8 -9 0 93 -10 0 93 -11 0 93 -12 0 93 -13 0 93 -14 0 93 -15 0 93 -16 0 93 -17 0 93 -18 0 93 -19 0 93 -20 0 93 -21 0 93 -22 0 93 -23 0 93 -24 0 93 -25 0 93 -26 0 93 -27 0 93 -28 0 93 -29 0 93 -30 0 93 -31 0 93 -32 0 93 -33 0 93 -34 0 93 -35 0 93 -36 0 93 -37 0 93 -38 0 93 -39 0 93 -40 0 93 -41 0 93 -42 0 93 -43 0 93 -44 0 93 -45 0 93 -46 0 93 -47 0 93 -48 0 93 -49 0 93 -50 0 93 -51 0 93 -52 0 93 -53 0 93 -54 0 93 -55 0 93 -56 0 93 -57 0 93 -58 0 93 -59 0 93 -60 0 93 -61 0 93 -62 0 93 -63 0 93 -64 0 93 -65 0 93 -66 0 93 -67 0 93 -68 0 93 -69 0 93 -70 0 93 -71 0 93 -72 0 93 -73 0 93 -74 0 93 -75 0 93 -76 0 93 -77 0 93 -78 0 93 -79 0 93 -80 0 93 -81 0 93 -82 0 82 -83 0 83 -84 0 84 -85 0 85 -86 0 86 -87 0 87 -88 0 88 -89 0 89 -90 0 90 -91 0 91 -92 0 92 -93 0 93 + 0 0 8 + 1 0 8 + 2 0 8 + 3 0 8 + 4 0 8 + 5 0 8 + 6 11 8 + 7 0 8 + 8 7 8 + 9 4 8 + 10 1 8 + 11 2 8 + 12 4 19 + 13 3 19 + 14 1 19 + 15 5 19 + 16 10 19 + 17 6 19 + 18 7 19 + 19 15 19 + 20 5 19 + 21 17 19 + 22 9 19 + 23 15 23 + 24 20 24 + 25 15 13 + 26 6 13 + 27 22 27 + 28 15 28 + 29 20 29 + 30 20 30 + 31 25 31 + 32 32 32 + 33 35 33 + 34 36 34 + 35 0 93 + 36 0 93 + 37 0 93 + 38 0 93 + 39 0 93 + 40 0 93 + 41 0 93 + 42 0 93 + 43 0 93 + 44 0 93 + 45 736 45 + 46 0 93 + 47 0 93 + 48 0 93 + 49 0 93 + 50 0 93 + 51 0 93 + 52 0 93 + 53 0 93 + 54 0 93 + 55 0 93 + 56 0 93 + 57 0 93 + 58 0 93 + 59 0 93 + 60 0 93 + 61 0 93 + 62 0 93 + 63 0 93 + 64 0 93 + 65 0 93 + 66 0 93 + 67 0 93 + 68 0 93 + 69 0 93 + 70 0 93 + 71 0 93 + 72 0 93 + 73 0 93 + 74 0 93 + 75 0 93 + 76 0 93 + 77 0 93 + 78 0 93 + 79 0 93 + 80 0 93 + 81 0 93 + 82 0 93 + 83 0 93 + 84 0 93 + 85 0 93 + 86 0 93 + 87 0 93 + 88 0 93 + 89 0 93 + 90 0 93 + 91 0 93 + 92 0 93 + 93 0 93 -#:GATKTable:6:3:%s:%s:%.4f:%.4f:%d:%d:; +#:GATKTable:6:3:%s:%s:%.4f:%.4f:%d:%.2f:; #:GATKTable:RecalTable0: -ReadGroup EventType EmpiricalQuality EstimatedQReported Observations Errors -exampleBAM.bam.bam D 25.8092 45.0000 380 0 -exampleBAM.bam.bam M 14.0483 15.4820 380 14 -exampleBAM.bam.bam I 25.8092 45.0000 380 0 +ReadGroup EventType EmpiricalQuality EstimatedQReported Observations Errors +exampleBAM.bam M 17.0000 17.4959 368 11.00 +exampleBAM.bam I 45.0000 45.0000 368 0.00 +exampleBAM.bam D 45.0000 45.0000 368 0.00 -#:GATKTable:6:32:%s:%s:%s:%.4f:%d:%d:; +#:GATKTable:6:30:%s:%s:%s:%.4f:%d:%.2f:; #:GATKTable:RecalTable1: -ReadGroup QualityScore EventType EmpiricalQuality Observations Errors -exampleBAM.bam.bam 32 M 15.1851 32 0 -exampleBAM.bam.bam 19 M 9.0309 15 1 -exampleBAM.bam.bam 33 M 15.5630 35 0 -exampleBAM.bam.bam 18 M 6.0206 7 1 -exampleBAM.bam.bam 34 M 15.6820 36 0 -exampleBAM.bam.bam 17 M 5.4407 6 1 -exampleBAM.bam.bam 16 M 7.4036 10 1 -exampleBAM.bam.bam 23 M 12.0412 15 0 -exampleBAM.bam.bam 6 M 4.7712 11 3 -exampleBAM.bam.bam 45 I 25.8092 380 0 -exampleBAM.bam.bam 22 M 10.0000 9 0 -exampleBAM.bam.bam 4 M 4.7712 5 1 -exampleBAM.bam.bam 21 M 12.5527 17 0 -exampleBAM.bam.bam 5 M 4.2597 7 2 -exampleBAM.bam.bam 20 M 4.7712 5 1 -exampleBAM.bam.bam 27 M 13.6173 22 0 -exampleBAM.bam.bam 10 M 3.0103 1 0 -exampleBAM.bam.bam 26 M 8.4510 6 0 -exampleBAM.bam.bam 11 M 1.7609 2 1 -exampleBAM.bam.bam 8 M 6.0206 7 1 -exampleBAM.bam.bam 25 M 12.0412 15 0 -exampleBAM.bam.bam 9 M 6.9897 4 0 -exampleBAM.bam.bam 24 M 10.2119 20 1 -exampleBAM.bam.bam 31 M 14.1497 25 0 -exampleBAM.bam.bam 14 M 3.0103 1 0 -exampleBAM.bam.bam 30 M 13.2222 20 0 -exampleBAM.bam.bam 15 M 7.7815 5 0 -exampleBAM.bam.bam 12 M 6.9897 4 0 -exampleBAM.bam.bam 29 M 13.2222 20 0 -exampleBAM.bam.bam 45 D 25.8092 380 0 -exampleBAM.bam.bam 13 M 6.0206 3 0 -exampleBAM.bam.bam 28 M 12.0412 15 0 +ReadGroup QualityScore EventType EmpiricalQuality Observations Errors +exampleBAM.bam 6 M 6.0000 11 3.00 +exampleBAM.bam 8 M 8.0000 7 1.00 +exampleBAM.bam 9 M 9.0000 4 0.00 +exampleBAM.bam 10 M 10.0000 1 0.00 +exampleBAM.bam 11 M 11.0000 2 1.00 +exampleBAM.bam 12 M 12.0000 4 0.00 +exampleBAM.bam 13 M 13.0000 3 0.00 +exampleBAM.bam 14 M 14.0000 1 0.00 +exampleBAM.bam 15 M 15.0000 5 0.00 +exampleBAM.bam 16 M 16.0000 10 1.00 +exampleBAM.bam 17 M 17.0000 6 1.00 +exampleBAM.bam 18 M 18.0000 7 1.00 +exampleBAM.bam 19 M 19.0000 15 1.00 +exampleBAM.bam 20 M 20.0000 5 1.00 +exampleBAM.bam 21 M 21.0000 17 0.00 +exampleBAM.bam 22 M 22.0000 9 0.00 +exampleBAM.bam 23 M 23.0000 15 0.00 +exampleBAM.bam 24 M 24.0000 20 1.00 +exampleBAM.bam 25 M 25.0000 15 0.00 +exampleBAM.bam 26 M 26.0000 6 0.00 +exampleBAM.bam 27 M 27.0000 22 0.00 +exampleBAM.bam 28 M 28.0000 15 0.00 +exampleBAM.bam 29 M 29.0000 20 0.00 +exampleBAM.bam 30 M 30.0000 20 0.00 +exampleBAM.bam 31 M 31.0000 25 0.00 +exampleBAM.bam 32 M 32.0000 32 0.00 +exampleBAM.bam 33 M 33.0000 35 0.00 +exampleBAM.bam 34 M 34.0000 36 0.00 +exampleBAM.bam 45 I 45.0000 368 0.00 +exampleBAM.bam 45 D 45.0000 368 0.00 -#:GATKTable:8:1354:%s:%s:%s:%s:%s:%.4f:%d:%d:; +#:GATKTable:8:952:%s:%s:%s:%s:%s:%.4f:%d:%.2f:; #:GATKTable:RecalTable2: -ReadGroup QualityScore CovariateValue CovariateName EventType EmpiricalQuality Observations Errors -exampleBAM.bam.bam 45 TGAAAGTG Context D 3.0103 1 0 -exampleBAM.bam.bam 45 TGGTATTA Context D 3.0103 1 0 -exampleBAM.bam.bam 45 AGCCTCGT Context D 3.0103 1 0 -exampleBAM.bam.bam 45 CTGTGTCT Context D 3.0103 1 0 -exampleBAM.bam.bam 45 CTTTGTAT Context I 3.0103 1 0 -exampleBAM.bam.bam 45 CTTAAGTG Context D 3.0103 1 0 -exampleBAM.bam.bam 45 CTTTATTA Context D 3.0103 1 0 -exampleBAM.bam.bam 45 23 Cycle I 7.7815 5 0 -exampleBAM.bam.bam 45 27 Cycle D 7.7815 5 0 -exampleBAM.bam.bam 45 ATTCTATT Context I 3.0103 1 0 -exampleBAM.bam.bam 45 CTAATCTC Context I 3.0103 1 0 -exampleBAM.bam.bam 34 GC Context M 4.7712 2 0 -exampleBAM.bam.bam 8 TG Context M 6.0206 3 0 -exampleBAM.bam.bam 45 TAGAGTTT Context I 3.0103 1 0 -exampleBAM.bam.bam 9 TA Context M 3.0103 1 0 -exampleBAM.bam.bam 45 GGTTCGGG Context I 6.0206 3 0 -exampleBAM.bam.bam 45 AGTTTCAC Context I 3.0103 1 0 -exampleBAM.bam.bam 45 CATTTCAC Context I 3.0103 1 0 -exampleBAM.bam.bam 16 7 Cycle M 3.0103 1 0 -exampleBAM.bam.bam 5 76 Cycle M 3.0103 1 0 -exampleBAM.bam.bam 45 CATGATAA Context D 3.0103 1 0 -exampleBAM.bam.bam 45 53 Cycle I 7.7815 5 0 -exampleBAM.bam.bam 45 57 Cycle D 7.7815 5 0 -exampleBAM.bam.bam 25 52 Cycle M 3.0103 1 0 -exampleBAM.bam.bam 45 TGGCAGCC Context D 3.0103 1 0 -exampleBAM.bam.bam 33 CT Context M 8.4510 6 0 -exampleBAM.bam.bam 45 AAGTGACA Context I 3.0103 1 0 -exampleBAM.bam.bam 45 AGTGACAT Context I 3.0103 1 0 -exampleBAM.bam.bam 45 AGAGTTTC Context I 3.0103 1 0 -exampleBAM.bam.bam 45 CTCTTTGT Context D 3.0103 1 0 -exampleBAM.bam.bam 45 GCCTGAAA Context D 3.0103 1 0 -exampleBAM.bam.bam 12 25 Cycle M 3.0103 1 0 -exampleBAM.bam.bam 34 75 Cycle M 3.0103 1 0 -exampleBAM.bam.bam 32 41 Cycle M 4.7712 2 0 -exampleBAM.bam.bam 21 GG Context M 4.7712 2 0 -exampleBAM.bam.bam 26 50 Cycle M 3.0103 1 0 -exampleBAM.bam.bam 45 ACCTGGAG Context D 3.0103 1 0 -exampleBAM.bam.bam 45 CACAGCAA Context D 3.0103 1 0 -exampleBAM.bam.bam 20 GA Context M 3.0103 1 0 -exampleBAM.bam.bam 45 AGGTGGAG Context D 3.0103 1 0 -exampleBAM.bam.bam 45 GCAAAATC Context I 3.0103 1 0 -exampleBAM.bam.bam 27 TA Context M 6.9897 4 0 -exampleBAM.bam.bam 27 18 Cycle M 3.0103 1 0 -exampleBAM.bam.bam 32 CC Context M 3.0103 1 0 -exampleBAM.bam.bam 45 AAAATCTA Context I 3.0103 1 0 -exampleBAM.bam.bam 45 22 Cycle I 7.7815 5 0 -exampleBAM.bam.bam 45 26 Cycle D 7.7815 5 0 -exampleBAM.bam.bam 33 76 Cycle M 3.0103 1 0 -exampleBAM.bam.bam 30 24 Cycle M 3.0103 1 0 -exampleBAM.bam.bam 45 TTCTATTC Context D 3.0103 1 0 -exampleBAM.bam.bam 45 GTCAATGT Context I 3.0103 1 0 -exampleBAM.bam.bam 21 73 Cycle M 3.0103 1 0 -exampleBAM.bam.bam 17 4 Cycle M 3.0103 1 0 -exampleBAM.bam.bam 8 17 Cycle M 3.0103 1 0 -exampleBAM.bam.bam 34 GA Context M 3.0103 1 0 -exampleBAM.bam.bam 45 ATCGTGAG Context I 3.0103 1 0 -exampleBAM.bam.bam 45 CCAGATCC Context I 3.0103 1 0 -exampleBAM.bam.bam 45 GATCGTGA Context D 3.0103 1 0 -exampleBAM.bam.bam 45 52 Cycle I 7.7815 5 0 -exampleBAM.bam.bam 45 56 Cycle D 7.7815 5 0 -exampleBAM.bam.bam 9 TC Context M 3.0103 1 0 -exampleBAM.bam.bam 23 CT Context M 4.7712 2 0 -exampleBAM.bam.bam 31 26 Cycle M 4.7712 2 0 -exampleBAM.bam.bam 45 ATGTGAAC Context D 3.0103 1 0 -exampleBAM.bam.bam 45 ATTACTCT Context I 3.0103 1 0 -exampleBAM.bam.bam 45 ACACAGCA Context D 3.0103 1 0 -exampleBAM.bam.bam 26 TT Context M 3.0103 1 0 -exampleBAM.bam.bam 45 GGGTTTGG Context D 4.7712 2 0 -exampleBAM.bam.bam 33 8 Cycle M 3.0103 1 0 -exampleBAM.bam.bam 21 GT Context M 4.7712 2 0 -exampleBAM.bam.bam 34 74 Cycle M 3.0103 1 0 -exampleBAM.bam.bam 45 ATTCTTAA Context I 3.0103 1 0 -exampleBAM.bam.bam 45 GAGCCTTT Context D 3.0103 1 0 -exampleBAM.bam.bam 20 GC Context M 3.0103 1 0 -exampleBAM.bam.bam 45 GGTTAGGG Context D 4.7712 2 0 -exampleBAM.bam.bam 33 42 Cycle M 3.0103 1 0 -exampleBAM.bam.bam 45 GTGCAAAG Context I 3.0103 1 0 -exampleBAM.bam.bam 6 75 Cycle M 3.0103 1 0 -exampleBAM.bam.bam 27 TC Context M 3.0103 1 0 -exampleBAM.bam.bam 32 CA Context M 4.7712 2 0 -exampleBAM.bam.bam 29 60 Cycle M 3.0103 1 0 -exampleBAM.bam.bam 34 13 Cycle M 3.0103 1 0 -exampleBAM.bam.bam 34 GT Context M 4.7712 2 0 -exampleBAM.bam.bam 21 74 Cycle M 3.0103 1 0 -exampleBAM.bam.bam 45 GTTAATGA Context I 3.0103 1 0 -exampleBAM.bam.bam 45 TATTATTG Context D 3.0103 1 0 -exampleBAM.bam.bam 24 52 Cycle M 3.0103 1 0 -exampleBAM.bam.bam 45 CTTTCAGG Context I 3.0103 1 0 -exampleBAM.bam.bam 45 GACATGGT Context D 3.0103 1 0 -exampleBAM.bam.bam 45 ATCATGGT Context D 3.0103 1 0 -exampleBAM.bam.bam 45 21 Cycle I 7.7815 5 0 -exampleBAM.bam.bam 45 25 Cycle D 7.7815 5 0 -exampleBAM.bam.bam 34 47 Cycle M 3.0103 1 0 -exampleBAM.bam.bam 31 25 Cycle M 3.0103 1 0 -exampleBAM.bam.bam 19 71 Cycle M 3.0103 1 0 -exampleBAM.bam.bam 6 GG Context M 3.9794 4 1 -exampleBAM.bam.bam 9 16 Cycle M 3.0103 1 0 -exampleBAM.bam.bam 45 TCCAGTTC Context I 3.0103 1 0 -exampleBAM.bam.bam 45 TTCACATG Context D 3.0103 1 0 -exampleBAM.bam.bam 45 TAAGTGAC Context I 3.0103 1 0 -exampleBAM.bam.bam 45 GTGACATG Context D 3.0103 1 0 -exampleBAM.bam.bam 45 55 Cycle I 7.7815 5 0 -exampleBAM.bam.bam 45 59 Cycle D 7.7815 5 0 -exampleBAM.bam.bam 45 CATGATCG Context I 3.0103 1 0 -exampleBAM.bam.bam 16 AT Context M 3.0103 1 0 -exampleBAM.bam.bam 32 43 Cycle M 6.0206 3 0 -exampleBAM.bam.bam 19 33 Cycle M 3.0103 1 0 -exampleBAM.bam.bam 21 GA Context M 4.7712 2 0 -exampleBAM.bam.bam 45 GTATTTGC Context D 3.0103 1 0 -exampleBAM.bam.bam 26 TA Context M 3.0103 1 0 -exampleBAM.bam.bam 45 TCTTAAGT Context D 3.0103 1 0 -exampleBAM.bam.bam 33 CC Context M 3.0103 1 0 -exampleBAM.bam.bam 11 20 Cycle M 3.0103 1 0 -exampleBAM.bam.bam 28 61 Cycle M 3.0103 1 0 -exampleBAM.bam.bam 18 1 Cycle M 3.0103 1 0 -exampleBAM.bam.bam 45 ACCCAGAT Context I 3.0103 1 0 -exampleBAM.bam.bam 45 AAAGACAC Context I 3.0103 1 0 -exampleBAM.bam.bam 45 GCCTTTGC Context D 3.0103 1 0 -exampleBAM.bam.bam 27 16 Cycle M 3.0103 1 0 -exampleBAM.bam.bam 27 TG Context M 4.7712 2 0 -exampleBAM.bam.bam 32 CT Context M 3.0103 1 0 -exampleBAM.bam.bam 21 44 Cycle M 3.0103 1 0 -exampleBAM.bam.bam 45 TATTACTC Context I 3.0103 1 0 -exampleBAM.bam.bam 45 TGGGCTGG Context I 3.0103 1 0 -exampleBAM.bam.bam 16 65 Cycle M 3.0103 1 0 -exampleBAM.bam.bam 34 GG Context M 4.7712 2 0 -exampleBAM.bam.bam 25 21 Cycle M 3.0103 1 0 -exampleBAM.bam.bam 22 9 Cycle M 3.0103 1 0 -exampleBAM.bam.bam 45 CAGGCCAC Context D 3.0103 1 0 -exampleBAM.bam.bam 45 20 Cycle I 7.7815 5 0 -exampleBAM.bam.bam 45 24 Cycle D 7.7815 5 0 -exampleBAM.bam.bam 30 26 Cycle M 3.0103 1 0 -exampleBAM.bam.bam 45 TTGTATTT Context D 3.0103 1 0 -exampleBAM.bam.bam 24 53 Cycle M 3.0103 1 0 -exampleBAM.bam.bam 23 CC Context M 3.0103 1 0 -exampleBAM.bam.bam 19 70 Cycle M -0.0000 1 1 -exampleBAM.bam.bam 25 55 Cycle M 3.0103 1 0 -exampleBAM.bam.bam 45 AGGCCACC Context I 3.0103 1 0 -exampleBAM.bam.bam 45 54 Cycle I 7.7815 5 0 -exampleBAM.bam.bam 45 58 Cycle D 7.7815 5 0 -exampleBAM.bam.bam 45 ACTTTCAG Context I 3.0103 1 0 -exampleBAM.bam.bam 45 AAAGTGCA Context D 3.0103 1 0 -exampleBAM.bam.bam 45 ATTGATAT Context D 3.0103 1 0 -exampleBAM.bam.bam 45 AATGTGAA Context I 3.0103 1 0 -exampleBAM.bam.bam 9 TT Context M 3.0103 1 0 -exampleBAM.bam.bam 19 32 Cycle M 3.0103 1 0 -exampleBAM.bam.bam 29 28 Cycle M 3.0103 1 0 -exampleBAM.bam.bam 45 CGGGTTTG Context I 4.7712 2 0 -exampleBAM.bam.bam 45 TCTTTGTA Context I 3.0103 1 0 -exampleBAM.bam.bam 33 10 Cycle M 3.0103 1 0 -exampleBAM.bam.bam 33 CA Context M 4.7712 2 0 -exampleBAM.bam.bam 45 GTTCGGGT Context I 6.0206 3 0 -exampleBAM.bam.bam 27 TT Context M 4.7712 2 0 -exampleBAM.bam.bam 27 17 Cycle M 3.0103 1 0 -exampleBAM.bam.bam 45 CAGCAAAA Context I 3.0103 1 0 -exampleBAM.bam.bam 45 GGCAGCCT Context I 3.0103 1 0 -exampleBAM.bam.bam 20 GT Context M -0.0000 1 1 -exampleBAM.bam.bam 45 TGGAGCCT Context I 3.0103 1 0 -exampleBAM.bam.bam 45 TGGTGGCC Context I 3.0103 1 0 -exampleBAM.bam.bam 28 30 Cycle M 3.0103 1 0 -exampleBAM.bam.bam 33 40 Cycle M 3.0103 1 0 -exampleBAM.bam.bam 24 TG Context M 4.7712 2 0 -exampleBAM.bam.bam 45 TGTGTCTT Context I 3.0103 1 0 -exampleBAM.bam.bam 45 TCAATAAT Context I 3.0103 1 0 -exampleBAM.bam.bam 45 TCTCCAGG Context I 3.0103 1 0 -exampleBAM.bam.bam 45 49 Cycle I 7.7815 5 0 -exampleBAM.bam.bam 45 61 Cycle D 7.7815 5 0 -exampleBAM.bam.bam 45 CCTCGTCC Context D 3.0103 1 0 -exampleBAM.bam.bam 45 GGCACCCA Context I 3.0103 1 0 -exampleBAM.bam.bam 22 44 Cycle M 4.7712 2 0 -exampleBAM.bam.bam 45 AGGTTATC Context I 3.0103 1 0 -exampleBAM.bam.bam 34 41 Cycle M 3.0103 1 0 -exampleBAM.bam.bam 19 65 Cycle M 3.0103 1 0 -exampleBAM.bam.bam 23 12 Cycle M 3.0103 1 0 -exampleBAM.bam.bam 23 GG Context M 3.0103 1 0 -exampleBAM.bam.bam 45 TTGGGTTC Context I 3.0103 1 0 -exampleBAM.bam.bam 45 TTCTGTGT Context D 3.0103 1 0 -exampleBAM.bam.bam 45 TGTTGGTT Context I 3.0103 1 0 -exampleBAM.bam.bam 24 50 Cycle M 3.0103 1 0 -exampleBAM.bam.bam 45 GTTTCACA Context I 3.0103 1 0 -exampleBAM.bam.bam 45 TCGGGTTC Context I 3.0103 1 0 -exampleBAM.bam.bam 45 TAGGGTTC Context I 3.0103 1 0 -exampleBAM.bam.bam 33 73 Cycle M 3.0103 1 0 -exampleBAM.bam.bam 9 52 Cycle M 3.0103 1 0 -exampleBAM.bam.bam 45 19 Cycle I 7.7815 5 0 -exampleBAM.bam.bam 45 31 Cycle D 7.7815 5 0 -exampleBAM.bam.bam 25 TA Context M 6.0206 3 0 -exampleBAM.bam.bam 34 11 Cycle M 3.0103 1 0 -exampleBAM.bam.bam 34 CC Context M 3.0103 1 0 -exampleBAM.bam.bam 28 25 Cycle M 3.0103 1 0 -exampleBAM.bam.bam 45 TAGATTTT Context I 3.0103 1 0 -exampleBAM.bam.bam 45 GGTTGGGG Context I 4.7712 2 0 -exampleBAM.bam.bam 45 GGCTGGGG Context I 3.0103 1 0 -exampleBAM.bam.bam 45 GATTAGAT Context I 3.0103 1 0 -exampleBAM.bam.bam 5 GG Context M 3.0103 3 1 -exampleBAM.bam.bam 32 15 Cycle M 3.0103 1 0 -exampleBAM.bam.bam 27 22 Cycle M 3.0103 1 0 -exampleBAM.bam.bam 21 42 Cycle M 3.0103 1 0 -exampleBAM.bam.bam 19 5 Cycle M 3.0103 1 0 -exampleBAM.bam.bam 19 AT Context M 3.0103 1 0 -exampleBAM.bam.bam 45 TTTCAGGC Context D 3.0103 1 0 -exampleBAM.bam.bam 45 TGCCAGGC Context D 3.0103 1 0 -exampleBAM.bam.bam 45 GTCTTTAT Context I 3.0103 1 0 -exampleBAM.bam.bam 45 TGAACTGG Context I 3.0103 1 0 -exampleBAM.bam.bam 26 20 Cycle M 3.0103 1 0 -exampleBAM.bam.bam 45 TATTCTTA Context D 3.0103 1 0 -exampleBAM.bam.bam 45 TGATAACC Context D 3.0103 1 0 -exampleBAM.bam.bam 45 ATTTTTCT Context D 3.0103 1 0 -exampleBAM.bam.bam 45 GGCTTTAT Context I 3.0103 1 0 -exampleBAM.bam.bam 5 46 Cycle M -0.0000 1 1 -exampleBAM.bam.bam 29 27 Cycle M 3.0103 1 0 -exampleBAM.bam.bam 45 ATCCATTT Context D 3.0103 1 0 -exampleBAM.bam.bam 45 48 Cycle I 7.7815 5 0 -exampleBAM.bam.bam 45 60 Cycle D 7.7815 5 0 -exampleBAM.bam.bam 45 GATCCAGT Context I 3.0103 1 0 -exampleBAM.bam.bam 45 AATGAGTC Context D 3.0103 1 0 -exampleBAM.bam.bam 24 TT Context M 3.0103 3 1 -exampleBAM.bam.bam 45 TCTTTATA Context I 3.0103 1 0 -exampleBAM.bam.bam 6 CC Context M 3.0103 1 0 -exampleBAM.bam.bam 23 GT Context M 4.7712 2 0 -exampleBAM.bam.bam 34 40 Cycle M 3.0103 1 0 -exampleBAM.bam.bam 45 18 Cycle I 7.7815 5 0 -exampleBAM.bam.bam 45 30 Cycle D 7.7815 5 0 -exampleBAM.bam.bam 45 CAAAATCT Context I 3.0103 1 0 -exampleBAM.bam.bam 22 15 Cycle M 3.0103 1 0 -exampleBAM.bam.bam 45 CCAGGTTA Context I 3.0103 1 0 -exampleBAM.bam.bam 45 TCATGGTG Context I 3.0103 1 0 -exampleBAM.bam.bam 45 TCTAATCT Context I 3.0103 1 0 -exampleBAM.bam.bam 45 TTGGGTTA Context I 3.0103 1 0 -exampleBAM.bam.bam 45 TAGGGTTA Context I 3.0103 1 0 -exampleBAM.bam.bam 45 GTTGGTTA Context I 3.0103 1 0 -exampleBAM.bam.bam 33 72 Cycle M 3.0103 1 0 -exampleBAM.bam.bam 31 60 Cycle M 3.0103 1 0 -exampleBAM.bam.bam 34 CA Context M 6.9897 4 0 -exampleBAM.bam.bam 45 CCCAGATC Context D 3.0103 1 0 -exampleBAM.bam.bam 18 36 Cycle M 3.0103 1 0 -exampleBAM.bam.bam 16 70 Cycle M 3.0103 1 0 -exampleBAM.bam.bam 45 TGTATTTG Context I 3.0103 1 0 -exampleBAM.bam.bam 33 46 Cycle M 3.0103 1 0 -exampleBAM.bam.bam 45 GGTTGGGT Context I 3.0103 1 0 -exampleBAM.bam.bam 45 GTTTGGGT Context I 3.0103 1 0 -exampleBAM.bam.bam 45 TTCTAGAG Context I 3.0103 1 0 -exampleBAM.bam.bam 19 AG Context M 3.0103 1 0 -exampleBAM.bam.bam 32 GA Context M 4.7712 2 0 -exampleBAM.bam.bam 32 14 Cycle M 4.7712 2 0 -exampleBAM.bam.bam 12 62 Cycle M 3.0103 1 0 -exampleBAM.bam.bam 33 12 Cycle M 3.0103 1 0 -exampleBAM.bam.bam 45 GGTGGCCT Context I 3.0103 1 0 -exampleBAM.bam.bam 4 GC Context M 3.0103 1 0 -exampleBAM.bam.bam 27 53 Cycle M 4.7712 2 0 -exampleBAM.bam.bam 23 GA Context M 3.0103 1 0 -exampleBAM.bam.bam 45 TTATTATT Context I 3.0103 1 0 -exampleBAM.bam.bam 5 74 Cycle M 3.0103 1 0 -exampleBAM.bam.bam 45 ATGATAAC Context I 3.0103 1 0 -exampleBAM.bam.bam 45 51 Cycle I 7.7815 5 0 -exampleBAM.bam.bam 45 63 Cycle D 7.7815 5 0 -exampleBAM.bam.bam 45 CACCCAGA Context I 3.0103 1 0 -exampleBAM.bam.bam 45 CGTGAGTG Context D 3.0103 1 0 -exampleBAM.bam.bam 45 GCTTTATT Context I 3.0103 1 0 -exampleBAM.bam.bam 45 ATGGTGGC Context D 3.0103 1 0 -exampleBAM.bam.bam 34 CT Context M 4.7712 2 0 -exampleBAM.bam.bam 4 72 Cycle M 3.0103 1 0 -exampleBAM.bam.bam 45 TCGGGTTT Context I 4.7712 2 0 -exampleBAM.bam.bam 24 48 Cycle M 3.0103 1 0 -exampleBAM.bam.bam 45 TCCATGAT Context I 3.0103 1 0 -exampleBAM.bam.bam 45 CACATGAT Context I 3.0103 1 0 -exampleBAM.bam.bam 45 17 Cycle I 7.7815 5 0 -exampleBAM.bam.bam 45 29 Cycle D 7.7815 5 0 -exampleBAM.bam.bam 45 ATCAATAA Context D 3.0103 1 0 -exampleBAM.bam.bam 45 ACCATGAT Context I 3.0103 1 0 -exampleBAM.bam.bam 32 GT Context M 8.4510 6 0 -exampleBAM.bam.bam 19 7 Cycle M 3.0103 1 0 -exampleBAM.bam.bam 33 45 Cycle M 3.0103 1 0 -exampleBAM.bam.bam 28 27 Cycle M 3.0103 1 0 -exampleBAM.bam.bam 45 TCCATTTC Context I 3.0103 1 0 -exampleBAM.bam.bam 45 GATAACCT Context D 3.0103 1 0 -exampleBAM.bam.bam 45 AACTGGGA Context I 3.0103 1 0 -exampleBAM.bam.bam 4 GG Context M 3.0103 1 0 -exampleBAM.bam.bam 33 GC Context M 3.0103 1 0 -exampleBAM.bam.bam 45 TCAGGCCA Context I 3.0103 1 0 -exampleBAM.bam.bam 45 TTGCACTT Context I 3.0103 1 0 -exampleBAM.bam.bam 45 TTCACTGA Context I 3.0103 1 0 -exampleBAM.bam.bam 45 CTCCAGGT Context D 3.0103 1 0 -exampleBAM.bam.bam 6 CT Context M 3.0103 1 0 -exampleBAM.bam.bam 23 15 Cycle M 3.0103 1 0 -exampleBAM.bam.bam 25 51 Cycle M 3.0103 1 0 -exampleBAM.bam.bam 32 72 Cycle M 3.0103 1 0 -exampleBAM.bam.bam 34 42 Cycle M 3.0103 1 0 -exampleBAM.bam.bam 45 GATATAAA Context I 3.0103 1 0 -exampleBAM.bam.bam 45 CTAGAGTT Context D 3.0103 1 0 -exampleBAM.bam.bam 45 50 Cycle I 7.7815 5 0 -exampleBAM.bam.bam 45 62 Cycle D 7.7815 5 0 -exampleBAM.bam.bam 45 GCCACCAT Context D 3.0103 1 0 -exampleBAM.bam.bam 45 GGGTTCGG Context D 6.0206 3 0 -exampleBAM.bam.bam 24 TC Context M 6.0206 3 0 -exampleBAM.bam.bam 25 TT Context M 4.7712 2 0 -exampleBAM.bam.bam 45 16 Cycle I 7.7815 5 0 -exampleBAM.bam.bam 45 28 Cycle D 7.7815 5 0 -exampleBAM.bam.bam 45 ACATGGTA Context I 3.0103 1 0 -exampleBAM.bam.bam 16 34 Cycle M -0.0000 1 1 -exampleBAM.bam.bam 45 AATCTCCA Context D 3.0103 1 0 -exampleBAM.bam.bam 45 ATTTCACT Context I 3.0103 1 0 -exampleBAM.bam.bam 22 GT Context M 4.7712 2 0 -exampleBAM.bam.bam 45 ATATCAAT Context D 3.0103 1 0 -exampleBAM.bam.bam 45 CAATGTGA Context D 3.0103 1 0 -exampleBAM.bam.bam 45 GAGTCAAT Context D 3.0103 1 0 -exampleBAM.bam.bam 24 49 Cycle M 3.0103 1 0 -exampleBAM.bam.bam 45 GGGGGTTG Context I 3.0103 1 0 -exampleBAM.bam.bam 45 TAGGGTTG Context I 3.0103 1 0 -exampleBAM.bam.bam 45 TGCAATCC Context I 3.0103 1 0 -exampleBAM.bam.bam 45 TGGGGTTG Context I 3.0103 1 0 -exampleBAM.bam.bam 45 TTAATGAG Context I 3.0103 1 0 -exampleBAM.bam.bam 30 30 Cycle M 3.0103 1 0 -exampleBAM.bam.bam 23 75 Cycle M 3.0103 1 0 -exampleBAM.bam.bam 32 GG Context M 7.7815 5 0 -exampleBAM.bam.bam 20 9 Cycle M 3.0103 1 0 -exampleBAM.bam.bam 20 CT Context M 3.0103 1 0 -exampleBAM.bam.bam 45 ATTAGATT Context D 3.0103 1 0 -exampleBAM.bam.bam 33 44 Cycle M 3.0103 1 0 -exampleBAM.bam.bam 45 TTTCTGTG Context I 3.0103 1 0 -exampleBAM.bam.bam 45 TGGAGATT Context D 3.0103 1 0 -exampleBAM.bam.bam 45 GTTTGGGC Context I 3.0103 1 0 -exampleBAM.bam.bam 21 11 Cycle M 3.0103 1 0 -exampleBAM.bam.bam 29 24 Cycle M 3.0103 1 0 -exampleBAM.bam.bam 32 46 Cycle M 3.0103 1 0 -exampleBAM.bam.bam 27 55 Cycle M 3.0103 1 0 -exampleBAM.bam.bam 45 ATATAAAG Context I 3.0103 1 0 -exampleBAM.bam.bam 45 GAGTTTCA Context D 3.0103 1 0 -exampleBAM.bam.bam 45 CACTTTCA Context D 3.0103 1 0 -exampleBAM.bam.bam 45 CCATTTCA Context D 3.0103 1 0 -exampleBAM.bam.bam 45 CCAGGCAC Context D 3.0103 1 0 -exampleBAM.bam.bam 11 TT Context M -0.0000 1 1 -exampleBAM.bam.bam 45 TTTCACTG Context I 3.0103 1 0 -exampleBAM.bam.bam 33 GA Context M 3.0103 1 0 -exampleBAM.bam.bam 45 TCGTGAGT Context I 3.0103 1 0 -exampleBAM.bam.bam 45 TACTCTTT Context D 3.0103 1 0 -exampleBAM.bam.bam 45 TAATGAGT Context I 3.0103 1 0 -exampleBAM.bam.bam 45 GTGTCTTT Context D 3.0103 1 0 -exampleBAM.bam.bam 45 GGCTTTAT Context D 3.0103 1 0 -exampleBAM.bam.bam 22 70 Cycle M 3.0103 1 0 -exampleBAM.bam.bam 45 ATTTTTCT Context I 3.0103 1 0 -exampleBAM.bam.bam 45 TGCCAGGC Context I 3.0103 1 0 -exampleBAM.bam.bam 33 1 Cycle M 4.7712 2 0 -exampleBAM.bam.bam 45 TTTCAGGC Context I 3.0103 1 0 -exampleBAM.bam.bam 45 TATTCTTA Context I 3.0103 1 0 -exampleBAM.bam.bam 45 TGATAACC Context I 3.0103 1 0 -exampleBAM.bam.bam 45 GTCTTTAT Context D 3.0103 1 0 -exampleBAM.bam.bam 45 TGAACTGG Context D 3.0103 1 0 -exampleBAM.bam.bam 21 AG Context M 4.7712 2 0 -exampleBAM.bam.bam 32 33 Cycle M 4.7712 2 0 -exampleBAM.bam.bam 27 56 Cycle M 3.0103 1 0 -exampleBAM.bam.bam 45 GGCTGGGG Context D 3.0103 1 0 -exampleBAM.bam.bam 45 GATTAGAT Context D 3.0103 1 0 -exampleBAM.bam.bam 33 35 Cycle M 3.0103 1 0 -exampleBAM.bam.bam 45 TAGATTTT Context D 3.0103 1 0 -exampleBAM.bam.bam 45 GGTTGGGG Context D 4.7712 2 0 -exampleBAM.bam.bam 19 CT Context M 1.7609 2 1 -exampleBAM.bam.bam 45 19 Cycle D 7.7815 5 0 -exampleBAM.bam.bam 45 31 Cycle I 7.7815 5 0 -exampleBAM.bam.bam 45 TGTTGGTT Context D 3.0103 1 0 -exampleBAM.bam.bam 45 TTCTGTGT Context I 3.0103 1 0 -exampleBAM.bam.bam 24 62 Cycle M 3.0103 1 0 -exampleBAM.bam.bam 45 TCGGGTTC Context D 3.0103 1 0 -exampleBAM.bam.bam 45 GTTTCACA Context D 3.0103 1 0 -exampleBAM.bam.bam 45 TAGGGTTC Context D 3.0103 1 0 -exampleBAM.bam.bam 45 TTGGGTTC Context D 3.0103 1 0 -exampleBAM.bam.bam 30 TT Context M 4.7712 2 0 -exampleBAM.bam.bam 30 17 Cycle M 4.7712 2 0 -exampleBAM.bam.bam 33 69 Cycle M 3.0103 1 0 -exampleBAM.bam.bam 6 36 Cycle M 3.0103 1 0 -exampleBAM.bam.bam 17 GT Context M 3.0103 1 0 -exampleBAM.bam.bam 21 64 Cycle M 3.0103 1 0 -exampleBAM.bam.bam 34 AC Context M 3.0103 1 0 -exampleBAM.bam.bam 16 GC Context M 3.0103 1 0 -exampleBAM.bam.bam 45 CCTCGTCC Context I 3.0103 1 0 -exampleBAM.bam.bam 45 49 Cycle D 7.7815 5 0 -exampleBAM.bam.bam 45 61 Cycle I 7.7815 5 0 -exampleBAM.bam.bam 45 AGGTTATC Context D 3.0103 1 0 -exampleBAM.bam.bam 45 GGCACCCA Context D 3.0103 1 0 -exampleBAM.bam.bam 45 TGTGTCTT Context D 3.0103 1 0 -exampleBAM.bam.bam 45 TCAATAAT Context D 3.0103 1 0 -exampleBAM.bam.bam 45 TCTCCAGG Context D 3.0103 1 0 -exampleBAM.bam.bam 6 AA Context M 4.7712 2 0 -exampleBAM.bam.bam 31 TC Context M 3.0103 1 0 -exampleBAM.bam.bam 31 19 Cycle M 3.0103 1 0 -exampleBAM.bam.bam 8 58 Cycle M 3.0103 1 0 -exampleBAM.bam.bam 28 54 Cycle M 3.0103 1 0 -exampleBAM.bam.bam 45 GGTGGCCT Context D 3.0103 1 0 -exampleBAM.bam.bam 18 10 Cycle M 3.0103 1 0 -exampleBAM.bam.bam 18 CA Context M 4.7712 2 0 -exampleBAM.bam.bam 27 57 Cycle M 3.0103 1 0 -exampleBAM.bam.bam 21 AT Context M 3.0103 1 0 -exampleBAM.bam.bam 45 TGTATTTG Context D 3.0103 1 0 -exampleBAM.bam.bam 45 TTCTAGAG Context D 3.0103 1 0 -exampleBAM.bam.bam 45 GGTTGGGT Context D 3.0103 1 0 -exampleBAM.bam.bam 45 GTTTGGGT Context D 3.0103 1 0 -exampleBAM.bam.bam 13 TA Context M 3.0103 1 0 -exampleBAM.bam.bam 20 AC Context M 3.0103 1 0 -exampleBAM.bam.bam 45 CCCAGATC Context I 3.0103 1 0 -exampleBAM.bam.bam 32 2 Cycle M 4.7712 2 0 -exampleBAM.bam.bam 27 27 Cycle M 3.0103 1 0 -exampleBAM.bam.bam 6 67 Cycle M 3.0103 1 0 -exampleBAM.bam.bam 45 TAGGGTTA Context D 3.0103 1 0 -exampleBAM.bam.bam 45 GTTGGTTA Context D 3.0103 1 0 -exampleBAM.bam.bam 45 TCATGGTG Context D 3.0103 1 0 -exampleBAM.bam.bam 45 TCTAATCT Context D 3.0103 1 0 -exampleBAM.bam.bam 45 TTGGGTTA Context D 3.0103 1 0 -exampleBAM.bam.bam 30 TG Context M 3.0103 1 0 -exampleBAM.bam.bam 45 18 Cycle D 7.7815 5 0 -exampleBAM.bam.bam 45 30 Cycle I 7.7815 5 0 -exampleBAM.bam.bam 45 CCAGGTTA Context D 3.0103 1 0 -exampleBAM.bam.bam 45 CAAAATCT Context D 3.0103 1 0 -exampleBAM.bam.bam 25 31 Cycle M 3.0103 1 0 -exampleBAM.bam.bam 34 6 Cycle M 3.0103 1 0 -exampleBAM.bam.bam 34 AA Context M 3.0103 1 0 -exampleBAM.bam.bam 17 GG Context M 3.0103 1 0 -exampleBAM.bam.bam 23 35 Cycle M 3.0103 1 0 -exampleBAM.bam.bam 45 TCTTTATA Context D 3.0103 1 0 -exampleBAM.bam.bam 45 GATCCAGT Context D 3.0103 1 0 -exampleBAM.bam.bam 45 48 Cycle D 7.7815 5 0 -exampleBAM.bam.bam 45 60 Cycle I 7.7815 5 0 -exampleBAM.bam.bam 45 ATCCATTT Context I 3.0103 1 0 -exampleBAM.bam.bam 45 AATGAGTC Context I 3.0103 1 0 -exampleBAM.bam.bam 31 TA Context M 4.7712 2 0 -exampleBAM.bam.bam 21 AA Context M 3.0103 1 0 -exampleBAM.bam.bam 34 65 Cycle M 3.0103 1 0 -exampleBAM.bam.bam 45 CTCCAGGT Context I 3.0103 1 0 -exampleBAM.bam.bam 18 CT Context M 3.0103 1 0 -exampleBAM.bam.bam 33 3 Cycle M 3.0103 1 0 -exampleBAM.bam.bam 45 TCAGGCCA Context D 3.0103 1 0 -exampleBAM.bam.bam 45 TTGCACTT Context D 3.0103 1 0 -exampleBAM.bam.bam 28 53 Cycle M 3.0103 1 0 -exampleBAM.bam.bam 45 TTCACTGA Context D 3.0103 1 0 -exampleBAM.bam.bam 19 CC Context M 3.0103 1 0 -exampleBAM.bam.bam 32 1 Cycle M 3.0103 1 0 -exampleBAM.bam.bam 45 GATAACCT Context I 3.0103 1 0 -exampleBAM.bam.bam 45 AACTGGGA Context D 3.0103 1 0 -exampleBAM.bam.bam 16 73 Cycle M 3.0103 1 0 -exampleBAM.bam.bam 45 TCCATTTC Context D 3.0103 1 0 -exampleBAM.bam.bam 21 66 Cycle M 3.0103 1 0 -exampleBAM.bam.bam 34 5 Cycle M 3.0103 1 0 -exampleBAM.bam.bam 34 AT Context M 8.4510 6 0 -exampleBAM.bam.bam 16 47 Cycle M 3.0103 1 0 -exampleBAM.bam.bam 45 CACATGAT Context D 3.0103 1 0 -exampleBAM.bam.bam 45 17 Cycle D 7.7815 5 0 -exampleBAM.bam.bam 45 29 Cycle I 7.7815 5 0 -exampleBAM.bam.bam 45 ATCAATAA Context I 3.0103 1 0 -exampleBAM.bam.bam 45 ACCATGAT Context D 3.0103 1 0 -exampleBAM.bam.bam 45 TCGGGTTT Context D 4.7712 2 0 -exampleBAM.bam.bam 45 TCCATGAT Context D 3.0103 1 0 -exampleBAM.bam.bam 6 AG Context M -0.0000 1 1 -exampleBAM.bam.bam 6 4 Cycle M 3.0103 1 0 -exampleBAM.bam.bam 31 TT Context M 3.0103 1 0 -exampleBAM.bam.bam 45 ATGATAAC Context D 3.0103 1 0 -exampleBAM.bam.bam 45 51 Cycle D 7.7815 5 0 -exampleBAM.bam.bam 45 63 Cycle I 7.7815 5 0 -exampleBAM.bam.bam 45 CGTGAGTG Context I 3.0103 1 0 -exampleBAM.bam.bam 45 CACCCAGA Context D 3.0103 1 0 -exampleBAM.bam.bam 16 GT Context M 3.0103 1 0 -exampleBAM.bam.bam 5 70 Cycle M 3.0103 1 0 -exampleBAM.bam.bam 45 GCTTTATT Context D 3.0103 1 0 -exampleBAM.bam.bam 45 ATGGTGGC Context I 3.0103 1 0 -exampleBAM.bam.bam 45 TTATTATT Context D 3.0103 1 0 -exampleBAM.bam.bam 34 64 Cycle M 3.0103 1 0 -exampleBAM.bam.bam 21 AC Context M 6.0206 3 0 -exampleBAM.bam.bam 33 2 Cycle M 3.0103 1 0 -exampleBAM.bam.bam 45 TTTCACTG Context D 3.0103 1 0 -exampleBAM.bam.bam 45 TCGTGAGT Context D 3.0103 1 0 -exampleBAM.bam.bam 45 GTGTCTTT Context I 3.0103 1 0 -exampleBAM.bam.bam 45 TAATGAGT Context D 3.0103 1 0 -exampleBAM.bam.bam 45 TACTCTTT Context I 3.0103 1 0 -exampleBAM.bam.bam 45 CACTTTCA Context I 3.0103 1 0 -exampleBAM.bam.bam 45 CCATTTCA Context I 3.0103 1 0 -exampleBAM.bam.bam 45 ATATAAAG Context D 3.0103 1 0 -exampleBAM.bam.bam 45 GAGTTTCA Context I 3.0103 1 0 -exampleBAM.bam.bam 45 CCAGGCAC Context I 3.0103 1 0 -exampleBAM.bam.bam 29 54 Cycle M 3.0103 1 0 -exampleBAM.bam.bam 6 65 Cycle M 3.0103 1 0 -exampleBAM.bam.bam 19 10 Cycle M 3.0103 1 0 -exampleBAM.bam.bam 19 CA Context M 4.7712 2 0 -exampleBAM.bam.bam 45 TTTCTGTG Context D 3.0103 1 0 -exampleBAM.bam.bam 33 32 Cycle M 3.0103 1 0 -exampleBAM.bam.bam 45 GTTTGGGC Context D 3.0103 1 0 -exampleBAM.bam.bam 45 TGGAGATT Context I 3.0103 1 0 -exampleBAM.bam.bam 45 ATTAGATT Context I 3.0103 1 0 -exampleBAM.bam.bam 34 4 Cycle M 3.0103 1 0 -exampleBAM.bam.bam 21 67 Cycle M 3.0103 1 0 -exampleBAM.bam.bam 45 TGGGGTTG Context D 3.0103 1 0 -exampleBAM.bam.bam 45 TGCAATCC Context D 3.0103 1 0 -exampleBAM.bam.bam 45 GGGGGTTG Context D 3.0103 1 0 -exampleBAM.bam.bam 45 TAGGGTTG Context D 3.0103 1 0 -exampleBAM.bam.bam 45 TTAATGAG Context D 3.0103 1 0 -exampleBAM.bam.bam 30 18 Cycle M 3.0103 1 0 -exampleBAM.bam.bam 30 TA Context M 6.9897 4 0 -exampleBAM.bam.bam 45 16 Cycle D 7.7815 5 0 -exampleBAM.bam.bam 45 28 Cycle I 7.7815 5 0 -exampleBAM.bam.bam 45 ACATGGTA Context D 3.0103 1 0 -exampleBAM.bam.bam 45 GAGTCAAT Context I 3.0103 1 0 -exampleBAM.bam.bam 45 CAATGTGA Context I 3.0103 1 0 -exampleBAM.bam.bam 45 AATCTCCA Context I 3.0103 1 0 -exampleBAM.bam.bam 45 ATTTCACT Context D 3.0103 1 0 -exampleBAM.bam.bam 45 ATATCAAT Context I 3.0103 1 0 -exampleBAM.bam.bam 8 57 Cycle M -0.0000 1 1 -exampleBAM.bam.bam 34 38 Cycle M 3.0103 1 0 -exampleBAM.bam.bam 31 16 Cycle M 3.0103 1 0 -exampleBAM.bam.bam 31 TG Context M 6.0206 3 0 -exampleBAM.bam.bam 45 GGGTTCGG Context I 6.0206 3 0 -exampleBAM.bam.bam 45 CTAGAGTT Context I 3.0103 1 0 -exampleBAM.bam.bam 45 50 Cycle D 7.7815 5 0 -exampleBAM.bam.bam 45 62 Cycle I 7.7815 5 0 -exampleBAM.bam.bam 45 GATATAAA Context D 3.0103 1 0 -exampleBAM.bam.bam 45 GCCACCAT Context I 3.0103 1 0 -exampleBAM.bam.bam 45 ACCTGGAG Context I 3.0103 1 0 -exampleBAM.bam.bam 5 AG Context M 3.0103 1 0 -exampleBAM.bam.bam 45 AGGTGGAG Context I 3.0103 1 0 -exampleBAM.bam.bam 45 GCAAAATC Context D 3.0103 1 0 -exampleBAM.bam.bam 45 CACAGCAA Context I 3.0103 1 0 -exampleBAM.bam.bam 28 TT Context M 3.0103 1 0 -exampleBAM.bam.bam 33 39 Cycle M 3.0103 1 0 -exampleBAM.bam.bam 19 GT Context M 3.0103 1 0 -exampleBAM.bam.bam 23 64 Cycle M 4.7712 2 0 -exampleBAM.bam.bam 27 30 Cycle M 3.0103 1 0 -exampleBAM.bam.bam 32 AC Context M 3.0103 1 0 -exampleBAM.bam.bam 45 AAGTGACA Context D 3.0103 1 0 -exampleBAM.bam.bam 5 38 Cycle M 3.0103 1 0 -exampleBAM.bam.bam 45 AGAGTTTC Context D 3.0103 1 0 -exampleBAM.bam.bam 45 AGTGACAT Context D 3.0103 1 0 -exampleBAM.bam.bam 45 GCCTGAAA Context I 3.0103 1 0 -exampleBAM.bam.bam 45 CTCTTTGT Context I 3.0103 1 0 -exampleBAM.bam.bam 33 AT Context M 4.7712 2 0 -exampleBAM.bam.bam 45 TGGCAGCC Context I 3.0103 1 0 -exampleBAM.bam.bam 4 AA Context M 3.0103 1 0 -exampleBAM.bam.bam 29 TC Context M 3.0103 1 0 -exampleBAM.bam.bam 34 71 Cycle M 3.0103 1 0 -exampleBAM.bam.bam 45 AGTTTCAC Context D 3.0103 1 0 -exampleBAM.bam.bam 45 CATTTCAC Context D 3.0103 1 0 -exampleBAM.bam.bam 45 53 Cycle D 7.7815 5 0 -exampleBAM.bam.bam 45 57 Cycle I 7.7815 5 0 -exampleBAM.bam.bam 45 CATGATAA Context I 3.0103 1 0 -exampleBAM.bam.bam 45 TAGAGTTT Context D 3.0103 1 0 -exampleBAM.bam.bam 45 GGTTCGGG Context D 6.0206 3 0 -exampleBAM.bam.bam 45 CTTTATTA Context I 3.0103 1 0 -exampleBAM.bam.bam 45 CTTTGTAT Context D 3.0103 1 0 -exampleBAM.bam.bam 45 AGCCTCGT Context I 3.0103 1 0 -exampleBAM.bam.bam 45 CTGTGTCT Context I 3.0103 1 0 -exampleBAM.bam.bam 45 CTTAAGTG Context I 3.0103 1 0 -exampleBAM.bam.bam 45 ATTCTATT Context D 3.0103 1 0 -exampleBAM.bam.bam 45 CTAATCTC Context D 3.0103 1 0 -exampleBAM.bam.bam 45 23 Cycle D 7.7815 5 0 -exampleBAM.bam.bam 45 27 Cycle I 7.7815 5 0 -exampleBAM.bam.bam 30 21 Cycle M 3.0103 1 0 -exampleBAM.bam.bam 45 TGAAAGTG Context I 3.0103 1 0 -exampleBAM.bam.bam 45 TGGTATTA Context I 3.0103 1 0 -exampleBAM.bam.bam 23 38 Cycle M 3.0103 1 0 -exampleBAM.bam.bam 34 3 Cycle M 3.0103 1 0 -exampleBAM.bam.bam 45 GGTTAGGG Context I 4.7712 2 0 -exampleBAM.bam.bam 45 GTGCAAAG Context D 3.0103 1 0 -exampleBAM.bam.bam 28 TG Context M 6.0206 3 0 -exampleBAM.bam.bam 45 ATTCTTAA Context D 3.0103 1 0 -exampleBAM.bam.bam 45 GAGCCTTT Context I 3.0103 1 0 -exampleBAM.bam.bam 27 31 Cycle M 3.0103 1 0 -exampleBAM.bam.bam 29 48 Cycle M 3.0103 1 0 -exampleBAM.bam.bam 32 AA Context M 3.0103 1 0 -exampleBAM.bam.bam 19 GG Context M 4.7712 2 0 -exampleBAM.bam.bam 4 37 Cycle M 3.0103 1 0 -exampleBAM.bam.bam 45 GGGTTTGG Context I 4.7712 2 0 -exampleBAM.bam.bam 33 AG Context M 6.0206 3 0 -exampleBAM.bam.bam 28 50 Cycle M 3.0103 1 0 -exampleBAM.bam.bam 45 ATTACTCT Context D 3.0103 1 0 -exampleBAM.bam.bam 45 ACACAGCA Context I 3.0103 1 0 -exampleBAM.bam.bam 45 ATGTGAAC Context I 3.0103 1 0 -exampleBAM.bam.bam 32 36 Cycle M 4.7712 2 0 -exampleBAM.bam.bam 29 TA Context M 4.7712 2 0 -exampleBAM.bam.bam 34 70 Cycle M 3.0103 1 0 -exampleBAM.bam.bam 17 76 Cycle M -0.0000 1 1 -exampleBAM.bam.bam 30 54 Cycle M 3.0103 1 0 -exampleBAM.bam.bam 24 25 Cycle M 3.0103 1 0 -exampleBAM.bam.bam 45 ATCGTGAG Context D 3.0103 1 0 -exampleBAM.bam.bam 45 GATCGTGA Context I 3.0103 1 0 -exampleBAM.bam.bam 45 52 Cycle D 7.7815 5 0 -exampleBAM.bam.bam 45 56 Cycle I 7.7815 5 0 -exampleBAM.bam.bam 45 CCAGATCC Context D 3.0103 1 0 -exampleBAM.bam.bam 16 CA Context M 3.0103 1 0 -exampleBAM.bam.bam 8 63 Cycle M 3.0103 1 0 -exampleBAM.bam.bam 14 TG Context M 3.0103 1 0 -exampleBAM.bam.bam 23 AT Context M 6.0206 3 0 -exampleBAM.bam.bam 19 72 Cycle M 3.0103 1 0 -exampleBAM.bam.bam 30 20 Cycle M 3.0103 1 0 -exampleBAM.bam.bam 45 TTCTATTC Context I 3.0103 1 0 -exampleBAM.bam.bam 45 GTCAATGT Context D 3.0103 1 0 -exampleBAM.bam.bam 45 AAAATCTA Context D 3.0103 1 0 -exampleBAM.bam.bam 45 22 Cycle D 7.7815 5 0 -exampleBAM.bam.bam 45 26 Cycle I 7.7815 5 0 -exampleBAM.bam.bam 34 2 Cycle M 3.0103 1 0 -exampleBAM.bam.bam 19 GC Context M 3.0103 1 0 -exampleBAM.bam.bam 6 68 Cycle M -0.0000 1 1 -exampleBAM.bam.bam 23 66 Cycle M 3.0103 1 0 -exampleBAM.bam.bam 27 28 Cycle M 3.0103 1 0 -exampleBAM.bam.bam 32 AT Context M 4.7712 2 0 -exampleBAM.bam.bam 5 AA Context M 3.0103 1 0 -exampleBAM.bam.bam 45 TATTACTC Context D 3.0103 1 0 -exampleBAM.bam.bam 33 37 Cycle M 3.0103 1 0 -exampleBAM.bam.bam 45 TGGGCTGG Context D 3.0103 1 0 -exampleBAM.bam.bam 28 TC Context M 3.0103 1 0 -exampleBAM.bam.bam 4 AG Context M 3.0103 1 0 -exampleBAM.bam.bam 29 TT Context M 4.7712 2 0 -exampleBAM.bam.bam 18 GT Context M 3.0103 1 0 -exampleBAM.bam.bam 45 AAAGACAC Context D 3.0103 1 0 -exampleBAM.bam.bam 45 GCCTTTGC Context I 3.0103 1 0 -exampleBAM.bam.bam 45 ACCCAGAT Context D 3.0103 1 0 -exampleBAM.bam.bam 45 TCTTAAGT Context I 3.0103 1 0 -exampleBAM.bam.bam 13 55 Cycle M 3.0103 1 0 -exampleBAM.bam.bam 45 GTATTTGC Context I 3.0103 1 0 -exampleBAM.bam.bam 33 7 Cycle M 3.0103 1 0 -exampleBAM.bam.bam 33 AC Context M 3.0103 1 0 -exampleBAM.bam.bam 23 AA Context M 3.0103 1 0 -exampleBAM.bam.bam 8 60 Cycle M 3.0103 1 0 -exampleBAM.bam.bam 22 38 Cycle M 3.0103 1 0 -exampleBAM.bam.bam 45 CATGATCG Context D 3.0103 1 0 -exampleBAM.bam.bam 45 55 Cycle D 7.7815 5 0 -exampleBAM.bam.bam 45 59 Cycle I 7.7815 5 0 -exampleBAM.bam.bam 45 TCCAGTTC Context D 3.0103 1 0 -exampleBAM.bam.bam 45 GTGACATG Context I 3.0103 1 0 -exampleBAM.bam.bam 45 TTCACATG Context I 3.0103 1 0 -exampleBAM.bam.bam 45 TAAGTGAC Context D 3.0103 1 0 -exampleBAM.bam.bam 4 64 Cycle M -0.0000 1 1 -exampleBAM.bam.bam 25 24 Cycle M 3.0103 1 0 -exampleBAM.bam.bam 22 AG Context M 4.7712 2 0 -exampleBAM.bam.bam 45 CTTTCAGG Context D 3.0103 1 0 -exampleBAM.bam.bam 45 ATCATGGT Context I 3.0103 1 0 -exampleBAM.bam.bam 45 21 Cycle D 7.7815 5 0 -exampleBAM.bam.bam 45 25 Cycle I 7.7815 5 0 -exampleBAM.bam.bam 45 GACATGGT Context I 3.0103 1 0 -exampleBAM.bam.bam 30 23 Cycle M 3.0103 1 0 -exampleBAM.bam.bam 33 67 Cycle M 3.0103 1 0 -exampleBAM.bam.bam 24 56 Cycle M 3.0103 1 0 -exampleBAM.bam.bam 45 TATTATTG Context I 3.0103 1 0 -exampleBAM.bam.bam 45 GTTAATGA Context D 3.0103 1 0 -exampleBAM.bam.bam 32 AG Context M 3.0103 1 0 -exampleBAM.bam.bam 23 67 Cycle M 3.0103 1 0 -exampleBAM.bam.bam 45 TGGAGCCT Context D 3.0103 1 0 -exampleBAM.bam.bam 45 TGGTGGCC Context D 3.0103 1 0 -exampleBAM.bam.bam 28 TA Context M 3.0103 1 0 -exampleBAM.bam.bam 45 CAGCAAAA Context D 3.0103 1 0 -exampleBAM.bam.bam 45 GGCAGCCT Context D 3.0103 1 0 -exampleBAM.bam.bam 34 68 Cycle M 3.0103 1 0 -exampleBAM.bam.bam 21 3 Cycle M 3.0103 1 0 -exampleBAM.bam.bam 45 TCTTTGTA Context D 3.0103 1 0 -exampleBAM.bam.bam 45 GTTCGGGT Context D 6.0206 3 0 -exampleBAM.bam.bam 28 48 Cycle M 3.0103 1 0 -exampleBAM.bam.bam 33 AA Context M 3.0103 1 0 -exampleBAM.bam.bam 18 GG Context M 3.0103 1 0 -exampleBAM.bam.bam 45 CGGGTTTG Context D 4.7712 2 0 -exampleBAM.bam.bam 34 34 Cycle M 3.0103 1 0 -exampleBAM.bam.bam 23 AC Context M 3.0103 1 0 -exampleBAM.bam.bam 30 52 Cycle M 3.0103 1 0 -exampleBAM.bam.bam 24 27 Cycle M 3.0103 1 0 -exampleBAM.bam.bam 45 AGGCCACC Context D 3.0103 1 0 -exampleBAM.bam.bam 20 69 Cycle M 3.0103 1 0 -exampleBAM.bam.bam 45 AAAGTGCA Context I 3.0103 1 0 -exampleBAM.bam.bam 45 ATTGATAT Context I 3.0103 1 0 -exampleBAM.bam.bam 45 AATGTGAA Context D 3.0103 1 0 -exampleBAM.bam.bam 45 54 Cycle D 7.7815 5 0 -exampleBAM.bam.bam 45 58 Cycle I 7.7815 5 0 -exampleBAM.bam.bam 45 ACTTTCAG Context D 3.0103 1 0 -exampleBAM.bam.bam 23 37 Cycle M 3.0103 1 0 -exampleBAM.bam.bam 21 71 Cycle M 3.0103 1 0 -exampleBAM.bam.bam 33 66 Cycle M 3.0103 1 0 -exampleBAM.bam.bam 15 TG Context M 3.0103 1 0 -exampleBAM.bam.bam 45 TTGTATTT Context I 3.0103 1 0 -exampleBAM.bam.bam 45 20 Cycle D 7.7815 5 0 -exampleBAM.bam.bam 45 24 Cycle I 7.7815 5 0 -exampleBAM.bam.bam 45 CAGGCCAC Context I 3.0103 1 0 -exampleBAM.bam.bam 23 59 Cycle M 3.0103 1 0 -exampleBAM.bam.bam 17 20 Cycle M 3.0103 1 0 -exampleBAM.bam.bam 30 CG Context M 3.0103 1 0 -exampleBAM.bam.bam 45 TTGATATA Context I 3.0103 1 0 -exampleBAM.bam.bam 45 TTCTTAAG Context I 3.0103 1 0 -exampleBAM.bam.bam 15 14 Cycle M 3.0103 1 0 -exampleBAM.bam.bam 45 GAACTGGG Context D 3.0103 1 0 -exampleBAM.bam.bam 45 6 Cycle I 7.7815 5 0 -exampleBAM.bam.bam 45 10 Cycle D 7.7815 5 0 -exampleBAM.bam.bam 45 GGGCTGGG Context D 3.0103 1 0 -exampleBAM.bam.bam 31 10 Cycle M 3.0103 1 0 -exampleBAM.bam.bam 34 60 Cycle M 3.0103 1 0 -exampleBAM.bam.bam 25 37 Cycle M 3.0103 1 0 -exampleBAM.bam.bam 6 31 Cycle M -0.0000 1 1 -exampleBAM.bam.bam 30 42 Cycle M 3.0103 1 0 -exampleBAM.bam.bam 45 GTTCTAGA Context D 3.0103 1 0 -exampleBAM.bam.bam 45 TATTTGCA Context D 3.0103 1 0 -exampleBAM.bam.bam 24 5 Cycle M 3.0103 1 0 -exampleBAM.bam.bam 45 CCTTTGCA Context D 3.0103 1 0 -exampleBAM.bam.bam 45 CAGGCACC Context I 3.0103 1 0 -exampleBAM.bam.bam 45 36 Cycle I 7.7815 5 0 -exampleBAM.bam.bam 45 40 Cycle D 7.7815 5 0 -exampleBAM.bam.bam 29 GA Context M 4.7712 2 0 -exampleBAM.bam.bam 21 29 Cycle M 3.0103 1 0 -exampleBAM.bam.bam 45 TAATCTCC Context I 3.0103 1 0 -exampleBAM.bam.bam 15 74 Cycle M 3.0103 1 0 -exampleBAM.bam.bam 45 TTGGGGGT Context I 3.0103 1 0 -exampleBAM.bam.bam 33 24 Cycle M 3.0103 1 0 -exampleBAM.bam.bam 45 GTTGGGGT Context I 3.0103 1 0 -exampleBAM.bam.bam 45 GCTGGGGT Context I 3.0103 1 0 -exampleBAM.bam.bam 45 66 Cycle I 7.7815 5 0 -exampleBAM.bam.bam 45 CTTGGCTT Context D 3.0103 1 0 -exampleBAM.bam.bam 45 GGCCACCA Context D 3.0103 1 0 -exampleBAM.bam.bam 19 TG Context M 4.7712 2 0 -exampleBAM.bam.bam 45 TTCAGGCC Context I 3.0103 1 0 -exampleBAM.bam.bam 45 GGTTAATG Context I 3.0103 1 0 -exampleBAM.bam.bam 45 GGTGGAGC Context I 3.0103 1 0 -exampleBAM.bam.bam 28 GG Context M 6.0206 3 0 -exampleBAM.bam.bam 45 GAGATTAG Context I 3.0103 1 0 -exampleBAM.bam.bam 45 7 Cycle I 7.7815 5 0 -exampleBAM.bam.bam 45 11 Cycle D 7.7815 5 0 -exampleBAM.bam.bam 45 TTACTCTT Context I 3.0103 1 0 -exampleBAM.bam.bam 30 9 Cycle M 3.0103 1 0 -exampleBAM.bam.bam 45 TTTATATC Context I 3.0103 1 0 -exampleBAM.bam.bam 45 TGGTTAAT Context I 3.0103 1 0 -exampleBAM.bam.bam 45 GTATTACT Context D 3.0103 1 0 -exampleBAM.bam.bam 31 11 Cycle M 3.0103 1 0 -exampleBAM.bam.bam 31 CC Context M 3.0103 1 0 -exampleBAM.bam.bam 34 61 Cycle M 3.0103 1 0 -exampleBAM.bam.bam 25 36 Cycle M 3.0103 1 0 -exampleBAM.bam.bam 45 ACAGCAAA Context D 3.0103 1 0 -exampleBAM.bam.bam 45 AGTGCAAA Context D 3.0103 1 0 -exampleBAM.bam.bam 45 37 Cycle I 7.7815 5 0 -exampleBAM.bam.bam 45 41 Cycle D 7.7815 5 0 -exampleBAM.bam.bam 45 TCCAGGTT Context I 3.0103 1 0 -exampleBAM.bam.bam 45 GTGAGTGT Context D 3.0103 1 0 -exampleBAM.bam.bam 45 TTATCATG Context D 3.0103 1 0 -exampleBAM.bam.bam 24 AG Context M 4.7712 2 0 -exampleBAM.bam.bam 29 GC Context M 3.0103 1 0 -exampleBAM.bam.bam 32 57 Cycle M 3.0103 1 0 -exampleBAM.bam.bam 45 67 Cycle I 7.7815 5 0 -exampleBAM.bam.bam 18 19 Cycle M 3.0103 1 0 -exampleBAM.bam.bam 45 CTGGAGAT Context I 3.0103 1 0 -exampleBAM.bam.bam 45 AGATTTTT Context I 3.0103 1 0 -exampleBAM.bam.bam 45 AAATCTAA Context D 3.0103 1 0 -exampleBAM.bam.bam 45 CTGAAAGT Context D 3.0103 1 0 -exampleBAM.bam.bam 45 AGGCACCC Context D 3.0103 1 0 -exampleBAM.bam.bam 45 TCTGTGTC Context I 3.0103 1 0 -exampleBAM.bam.bam 45 TTGGGCTG Context D 3.0103 1 0 -exampleBAM.bam.bam 28 47 Cycle M 3.0103 1 0 -exampleBAM.bam.bam 45 GTTGGGGG Context I 3.0103 1 0 -exampleBAM.bam.bam 19 TT Context M 4.7712 2 0 -exampleBAM.bam.bam 29 45 Cycle M 3.0103 1 0 -exampleBAM.bam.bam 45 CCTGGAGA Context I 3.0103 1 0 -exampleBAM.bam.bam 45 ATGATTCT Context D 3.0103 1 0 -exampleBAM.bam.bam 45 GCCAGGCA Context I 3.0103 1 0 -exampleBAM.bam.bam 45 TTTATTAT Context I 3.0103 1 0 -exampleBAM.bam.bam 33 59 Cycle M 3.0103 1 0 -exampleBAM.bam.bam 45 TCTATTCT Context D 3.0103 1 0 -exampleBAM.bam.bam 45 TAACCTGG Context I 3.0103 1 0 -exampleBAM.bam.bam 30 CA Context M 6.0206 3 0 -exampleBAM.bam.bam 15 GG Context M 4.7712 2 0 -exampleBAM.bam.bam 45 GACACAGC Context I 3.0103 1 0 -exampleBAM.bam.bam 45 AACCTGGA Context D 3.0103 1 0 -exampleBAM.bam.bam 45 4 Cycle I 7.7815 5 0 -exampleBAM.bam.bam 45 8 Cycle D 7.7815 5 0 -exampleBAM.bam.bam 25 AT Context M 4.7712 2 0 -exampleBAM.bam.bam 6 63 Cycle M 4.7712 2 0 -exampleBAM.bam.bam 45 TTTGCAAT Context D 3.0103 1 0 -exampleBAM.bam.bam 45 TTTGCACT Context I 3.0103 1 0 -exampleBAM.bam.bam 45 TTAAGTGA Context D 3.0103 1 0 -exampleBAM.bam.bam 45 TGAGTCAA Context I 3.0103 1 0 -exampleBAM.bam.bam 22 59 Cycle M 3.0103 1 0 -exampleBAM.bam.bam 45 CTCGTCCA Context D 3.0103 1 0 -exampleBAM.bam.bam 45 38 Cycle I 7.7815 5 0 -exampleBAM.bam.bam 45 42 Cycle D 7.7815 5 0 -exampleBAM.bam.bam 34 62 Cycle M 3.0103 1 0 -exampleBAM.bam.bam 31 CG Context M 3.0103 1 0 -exampleBAM.bam.bam 31 8 Cycle M 4.7712 2 0 -exampleBAM.bam.bam 27 69 Cycle M 3.0103 1 0 -exampleBAM.bam.bam 26 3 Cycle M 3.0103 1 0 -exampleBAM.bam.bam 45 TATAAAGA Context D 3.0103 1 0 -exampleBAM.bam.bam 45 GGGGTTGG Context D 4.7712 2 0 -exampleBAM.bam.bam 45 64 Cycle I 7.7815 5 0 -exampleBAM.bam.bam 45 76 Cycle D 7.7815 5 0 -exampleBAM.bam.bam 45 GATTCTAT Context D 3.0103 1 0 -exampleBAM.bam.bam 45 AGACACAG Context I 3.0103 1 0 -exampleBAM.bam.bam 45 AGGGTTGG Context D 3.0103 1 0 -exampleBAM.bam.bam 45 AGTGTTGG Context D 3.0103 1 0 -exampleBAM.bam.bam 29 12 Cycle M 3.0103 1 0 -exampleBAM.bam.bam 29 GG Context M 6.9897 4 0 -exampleBAM.bam.bam 8 71 Cycle M 3.0103 1 0 -exampleBAM.bam.bam 45 GTGAACTG Context I 3.0103 1 0 -exampleBAM.bam.bam 45 TTGGCTTT Context D 3.0103 1 0 -exampleBAM.bam.bam 9 69 Cycle M 3.0103 1 0 -exampleBAM.bam.bam 45 CCTGAAAG Context I 3.0103 1 0 -exampleBAM.bam.bam 45 CTTTGCAC Context D 3.0103 1 0 -exampleBAM.bam.bam 20 29 Cycle M 3.0103 1 0 -exampleBAM.bam.bam 12 40 Cycle M 3.0103 1 0 -exampleBAM.bam.bam 32 24 Cycle M 3.0103 1 0 -exampleBAM.bam.bam 21 61 Cycle M 3.0103 1 0 -exampleBAM.bam.bam 45 CATGGTAT Context I 3.0103 1 0 -exampleBAM.bam.bam 45 GCACCCAG Context D 3.0103 1 0 -exampleBAM.bam.bam 16 55 Cycle M 3.0103 1 0 -exampleBAM.bam.bam 45 ATGATCGT Context D 3.0103 1 0 -exampleBAM.bam.bam 45 5 Cycle I 7.7815 5 0 -exampleBAM.bam.bam 45 9 Cycle D 7.7815 5 0 -exampleBAM.bam.bam 30 CC Context M 4.7712 2 0 -exampleBAM.bam.bam 23 56 Cycle M 3.0103 1 0 -exampleBAM.bam.bam 6 62 Cycle M 3.0103 1 0 -exampleBAM.bam.bam 31 43 Cycle M 3.0103 1 0 -exampleBAM.bam.bam 25 AG Context M 3.0103 1 0 -exampleBAM.bam.bam 45 ATAACCTG Context D 3.0103 1 0 -exampleBAM.bam.bam 45 39 Cycle I 7.7815 5 0 -exampleBAM.bam.bam 45 43 Cycle D 7.7815 5 0 -exampleBAM.bam.bam 45 GAAAGTGC Context D 3.0103 1 0 -exampleBAM.bam.bam 24 AA Context M 3.0103 1 0 -exampleBAM.bam.bam 24 6 Cycle M 4.7712 2 0 -exampleBAM.bam.bam 45 TTATTGAT Context I 3.0103 1 0 -exampleBAM.bam.bam 34 63 Cycle M 3.0103 1 0 -exampleBAM.bam.bam 31 CT Context M 3.0103 1 0 -exampleBAM.bam.bam 45 65 Cycle I 7.7815 5 0 -exampleBAM.bam.bam 18 TT Context M -0.0000 1 1 -exampleBAM.bam.bam 45 GATTTTTC Context I 3.0103 1 0 -exampleBAM.bam.bam 45 AGTTCTAG Context D 3.0103 1 0 -exampleBAM.bam.bam 45 TAAAGACA Context I 3.0103 1 0 -exampleBAM.bam.bam 45 TGAGTGTT Context I 3.0103 1 0 -exampleBAM.bam.bam 45 TTTCACAT Context I 3.0103 1 0 -exampleBAM.bam.bam 45 GTGGAGCC Context D 3.0103 1 0 -exampleBAM.bam.bam 19 49 Cycle M 3.0103 1 0 -exampleBAM.bam.bam 29 GT Context M 4.7712 2 0 -exampleBAM.bam.bam 5 26 Cycle M -0.0000 1 1 -exampleBAM.bam.bam 45 AAGTGCAA Context D 3.0103 1 0 -exampleBAM.bam.bam 45 ATTTGCAA Context D 3.0103 1 0 -exampleBAM.bam.bam 45 ATCTAATC Context I 3.0103 1 0 -exampleBAM.bam.bam 20 28 Cycle M -0.0000 1 1 -exampleBAM.bam.bam 45 GGTATTAC Context I 3.0103 1 0 -exampleBAM.bam.bam 45 TGTGAACT Context D 3.0103 1 0 -exampleBAM.bam.bam 45 TGGCCTGA Context I 3.0103 1 0 -exampleBAM.bam.bam 33 57 Cycle M 3.0103 1 0 -exampleBAM.bam.bam 21 60 Cycle M 3.0103 1 0 -exampleBAM.bam.bam 29 47 Cycle M 3.0103 1 0 -exampleBAM.bam.bam 34 56 Cycle M 3.0103 1 0 -exampleBAM.bam.bam 31 GA Context M 4.7712 2 0 -exampleBAM.bam.bam 45 TCGTCCAT Context D 3.0103 1 0 -exampleBAM.bam.bam 45 TGATTCTA Context I 3.0103 1 0 -exampleBAM.bam.bam 45 ATCCAGTT Context D 3.0103 1 0 -exampleBAM.bam.bam 45 32 Cycle I 7.7815 5 0 -exampleBAM.bam.bam 45 44 Cycle D 7.7815 5 0 -exampleBAM.bam.bam 45 CATGATTC Context D 3.0103 1 0 -exampleBAM.bam.bam 45 CAATCCAT Context D 3.0103 1 0 -exampleBAM.bam.bam 45 CAGTTCTA Context I 3.0103 1 0 -exampleBAM.bam.bam 34 26 Cycle M 3.0103 1 0 -exampleBAM.bam.bam 8 AT Context M -0.0000 1 1 -exampleBAM.bam.bam 45 GGGTTAGG Context D 4.7712 2 0 -exampleBAM.bam.bam 30 12 Cycle M 3.0103 1 0 -exampleBAM.bam.bam 45 TATATCAA Context I 3.0103 1 0 -exampleBAM.bam.bam 45 GCAATCCA Context D 3.0103 1 0 -exampleBAM.bam.bam 45 GGAGCCTT Context D 3.0103 1 0 -exampleBAM.bam.bam 45 CAGATCCA Context D 3.0103 1 0 -exampleBAM.bam.bam 45 2 Cycle I 7.7815 5 0 -exampleBAM.bam.bam 45 14 Cycle D 7.7815 5 0 -exampleBAM.bam.bam 45 GAGTGTTG Context I 3.0103 1 0 -exampleBAM.bam.bam 32 30 Cycle M 3.0103 1 0 -exampleBAM.bam.bam 27 AC Context M 3.0103 1 0 -exampleBAM.bam.bam 21 59 Cycle M 3.0103 1 0 -exampleBAM.bam.bam 45 TGTCTTTA Context I 3.0103 1 0 -exampleBAM.bam.bam 45 TCAATGTG Context I 3.0103 1 0 -exampleBAM.bam.bam 45 TGGCTTTA Context I 3.0103 1 0 -exampleBAM.bam.bam 13 GA Context M 3.0103 1 0 -exampleBAM.bam.bam 45 CCATGATT Context D 3.0103 1 0 -exampleBAM.bam.bam 29 CA Context M 3.0103 1 0 -exampleBAM.bam.bam 19 54 Cycle M 3.0103 1 0 -exampleBAM.bam.bam 45 TATCAATA Context I 3.0103 1 0 -exampleBAM.bam.bam 45 TTTGGGCT Context I 3.0103 1 0 -exampleBAM.bam.bam 45 TTGGTTAA Context I 3.0103 1 0 -exampleBAM.bam.bam 45 TGCACTTT Context D 3.0103 1 0 -exampleBAM.bam.bam 45 TCTAGAGT Context I 3.0103 1 0 -exampleBAM.bam.bam 26 AT Context M 3.0103 1 0 -exampleBAM.bam.bam 20 57 Cycle M 3.0103 1 0 -exampleBAM.bam.bam 45 GCCTCGTC Context D 3.0103 1 0 -exampleBAM.bam.bam 45 70 Cycle I 7.7815 5 0 -exampleBAM.bam.bam 45 74 Cycle D 7.7815 5 0 -exampleBAM.bam.bam 18 22 Cycle M 3.0103 1 0 -exampleBAM.bam.bam 25 32 Cycle M 3.0103 1 0 -exampleBAM.bam.bam 27 66 Cycle M 3.0103 1 0 -exampleBAM.bam.bam 31 15 Cycle M 4.7712 2 0 -exampleBAM.bam.bam 31 GC Context M 6.0206 3 0 -exampleBAM.bam.bam 45 33 Cycle I 7.7815 5 0 -exampleBAM.bam.bam 45 45 Cycle D 7.7815 5 0 -exampleBAM.bam.bam 45 GGAGATTA Context D 3.0103 1 0 -exampleBAM.bam.bam 45 AGATCCAG Context D 3.0103 1 0 -exampleBAM.bam.bam 16 19 Cycle M 3.0103 1 0 -exampleBAM.bam.bam 45 ATGGTATT Context I 3.0103 1 0 -exampleBAM.bam.bam 45 ATCTCCAG Context D 3.0103 1 0 -exampleBAM.bam.bam 13 75 Cycle M 3.0103 1 0 -exampleBAM.bam.bam 45 TTTGTATT Context I 3.0103 1 0 -exampleBAM.bam.bam 45 TATCATGG Context I 3.0103 1 0 -exampleBAM.bam.bam 45 TGACATGG Context I 3.0103 1 0 -exampleBAM.bam.bam 17 TT Context M 3.0103 3 1 -exampleBAM.bam.bam 31 45 Cycle M 3.0103 1 0 -exampleBAM.bam.bam 8 AG Context M 4.7712 2 0 -exampleBAM.bam.bam 34 27 Cycle M 3.0103 1 0 -exampleBAM.bam.bam 45 3 Cycle I 7.7815 5 0 -exampleBAM.bam.bam 45 15 Cycle D 7.7815 5 0 -exampleBAM.bam.bam 45 TTATATCA Context I 3.0103 1 0 -exampleBAM.bam.bam 45 TGATATAA Context D 3.0103 1 0 -exampleBAM.bam.bam 45 GGTTATCA Context I 3.0103 1 0 -exampleBAM.bam.bam 45 TCACTGAT Context I 3.0103 1 0 -exampleBAM.bam.bam 45 GTGGCCTG Context D 3.0103 1 0 -exampleBAM.bam.bam 19 21 Cycle M 4.7712 2 0 -exampleBAM.bam.bam 32 31 Cycle M 3.0103 1 0 -exampleBAM.bam.bam 27 AA Context M 3.0103 1 0 -exampleBAM.bam.bam 45 CACTGATG Context D 3.0103 1 0 -exampleBAM.bam.bam 45 ATAAAGAC Context I 3.0103 1 0 -exampleBAM.bam.bam 45 GCACTTTC Context I 3.0103 1 0 -exampleBAM.bam.bam 45 CAGCCTCG Context I 3.0103 1 0 -exampleBAM.bam.bam 28 CT Context M 4.7712 2 0 -exampleBAM.bam.bam 45 71 Cycle I 7.7815 5 0 -exampleBAM.bam.bam 45 75 Cycle D 7.7815 5 0 -exampleBAM.bam.bam 45 AGCAAAAT Context I 3.0103 1 0 -exampleBAM.bam.bam 45 TTGCAATC Context I 3.0103 1 0 -exampleBAM.bam.bam 33 29 Cycle M 4.7712 2 0 -exampleBAM.bam.bam 26 AG Context M 3.0103 1 0 -exampleBAM.bam.bam 45 GGTTTGGG Context D 4.7712 2 0 -exampleBAM.bam.bam 45 GGGTTGGG Context D 6.0206 3 0 -exampleBAM.bam.bam 24 3 Cycle M 3.0103 1 0 -exampleBAM.bam.bam 45 TTTTTCTG Context I 3.0103 1 0 -exampleBAM.bam.bam 45 TTAGATTT Context D 3.0103 1 0 -exampleBAM.bam.bam 16 TG Context M 4.7712 2 0 -exampleBAM.bam.bam 45 34 Cycle I 7.7815 5 0 -exampleBAM.bam.bam 45 46 Cycle D 7.7815 5 0 -exampleBAM.bam.bam 45 ATGAGTCA Context D 3.0103 1 0 -exampleBAM.bam.bam 27 65 Cycle M 3.0103 1 0 -exampleBAM.bam.bam 31 12 Cycle M 3.0103 1 0 -exampleBAM.bam.bam 31 GG Context M 6.9897 4 0 -exampleBAM.bam.bam 34 58 Cycle M 3.0103 1 0 -exampleBAM.bam.bam 24 33 Cycle M 3.0103 1 0 -exampleBAM.bam.bam 15 8 Cycle M 3.0103 1 0 -exampleBAM.bam.bam 26 67 Cycle M 3.0103 1 0 -exampleBAM.bam.bam 30 GA Context M 4.7712 2 0 -exampleBAM.bam.bam 45 12 Cycle D 7.7815 5 0 -exampleBAM.bam.bam 45 GGCCTGAA Context I 3.0103 1 0 -exampleBAM.bam.bam 45 AGATTAGA Context D 3.0103 1 0 -exampleBAM.bam.bam 45 GCAGCCTC Context D 3.0103 1 0 -exampleBAM.bam.bam 45 CATGGTGG Context D 3.0103 1 0 -exampleBAM.bam.bam 45 AATCCATT Context D 3.0103 1 0 -exampleBAM.bam.bam 45 CTTTATAT Context D 3.0103 1 0 -exampleBAM.bam.bam 29 76 Cycle M 3.0103 1 0 -exampleBAM.bam.bam 23 61 Cycle M 3.0103 1 0 -exampleBAM.bam.bam 28 CA Context M 4.7712 2 0 -exampleBAM.bam.bam 45 GTTAGGGT Context I 6.0206 3 0 -exampleBAM.bam.bam 45 ACTCTTTG Context I 3.0103 1 0 -exampleBAM.bam.bam 45 AGCCTTTG Context I 3.0103 1 0 -exampleBAM.bam.bam 45 ACATGATC Context D 3.0103 1 0 -exampleBAM.bam.bam 45 ATTATTGA Context D 3.0103 1 0 -exampleBAM.bam.bam 32 28 Cycle M 4.7712 2 0 -exampleBAM.bam.bam 29 42 Cycle M 3.0103 1 0 -exampleBAM.bam.bam 27 AT Context M 6.9897 4 0 -exampleBAM.bam.bam 45 TGGGTTAG Context I 3.0103 1 0 -exampleBAM.bam.bam 45 TGGGTTCG Context D 3.0103 1 0 -exampleBAM.bam.bam 26 7 Cycle M 3.0103 1 0 -exampleBAM.bam.bam 45 TTTTCTGT Context I 3.0103 1 0 -exampleBAM.bam.bam 45 AGGGTTAG Context I 3.0103 1 0 -exampleBAM.bam.bam 45 AGGGTTCG Context D 3.0103 1 0 -exampleBAM.bam.bam 45 CGGGTTCG Context D 3.0103 1 0 -exampleBAM.bam.bam 45 68 Cycle I 7.7815 5 0 -exampleBAM.bam.bam 45 72 Cycle D 7.7815 5 0 -exampleBAM.bam.bam 45 AGTCAATG Context I 3.0103 1 0 -exampleBAM.bam.bam 29 8 Cycle M 3.0103 1 0 -exampleBAM.bam.bam 29 CG Context M 4.7712 2 0 -exampleBAM.bam.bam 4 29 Cycle M 3.0103 1 0 -exampleBAM.bam.bam 16 TT Context M 3.9794 4 1 -exampleBAM.bam.bam 45 CACCATGA Context I 3.0103 1 0 -exampleBAM.bam.bam 45 35 Cycle I 7.7815 5 0 -exampleBAM.bam.bam 45 47 Cycle D 7.7815 5 0 -exampleBAM.bam.bam 45 CTATTCTT Context I 3.0103 1 0 -exampleBAM.bam.bam 45 AATCTAAT Context I 3.0103 1 0 -exampleBAM.bam.bam 45 GTGTTGGT Context D 3.0103 1 0 -exampleBAM.bam.bam 30 45 Cycle M 3.0103 1 0 -exampleBAM.bam.bam 45 TCACATGA Context I 3.0103 1 0 -exampleBAM.bam.bam 9 AG Context M 3.0103 1 0 -exampleBAM.bam.bam 45 GTCCATGA Context I 3.0103 1 0 -exampleBAM.bam.bam 31 13 Cycle M 3.0103 1 0 -exampleBAM.bam.bam 31 GT Context M 3.0103 1 0 -exampleBAM.bam.bam 34 59 Cycle M 3.0103 1 0 -exampleBAM.bam.bam 45 AAGACACA Context I 3.0103 1 0 -exampleBAM.bam.bam 45 CCACCATG Context D 3.0103 1 0 -exampleBAM.bam.bam 45 1 Cycle I 7.7815 5 0 -exampleBAM.bam.bam 45 13 Cycle D 7.7815 5 0 -exampleBAM.bam.bam 16 51 Cycle M 3.0103 1 0 -exampleBAM.bam.bam 45 CGTCCATG Context D 3.0103 1 0 -exampleBAM.bam.bam 45 CTGGGGTT Context I 3.0103 1 0 -exampleBAM.bam.bam 45 GTTGGGTT Context I 3.0103 1 0 -exampleBAM.bam.bam 45 TTCGGGTT Context I 6.0206 3 0 -exampleBAM.bam.bam 45 TTAGGGTT Context I 6.0206 3 0 -exampleBAM.bam.bam 45 TGGGGGTT Context I 3.0103 1 0 -exampleBAM.bam.bam 45 TTTGGGTT Context I 3.0103 1 0 -exampleBAM.bam.bam 45 TTGGGGTT Context I 3.0103 1 0 -exampleBAM.bam.bam 9 38 Cycle M 3.0103 1 0 -exampleBAM.bam.bam 45 GTTATCAT Context I 3.0103 1 0 -exampleBAM.bam.bam 30 GC Context M 3.0103 1 0 -exampleBAM.bam.bam 17 TC Context M 3.0103 1 0 -exampleBAM.bam.bam 34 25 Cycle M 3.0103 1 0 -exampleBAM.bam.bam 45 CCATGATA Context D 3.0103 1 0 -exampleBAM.bam.bam 28 11 Cycle M 3.0103 1 0 -exampleBAM.bam.bam 45 TATTGATA Context D 3.0103 1 0 -exampleBAM.bam.bam 29 43 Cycle M 3.0103 1 0 -exampleBAM.bam.bam 45 CCAGTTCT Context D 3.0103 1 0 -exampleBAM.bam.bam 45 CAGGTTAT Context I 3.0103 1 0 -exampleBAM.bam.bam 45 69 Cycle I 7.7815 5 0 -exampleBAM.bam.bam 45 73 Cycle D 7.7815 5 0 -exampleBAM.bam.bam 28 41 Cycle M 3.0103 1 0 -exampleBAM.bam.bam 33 31 Cycle M 3.0103 1 0 -exampleBAM.bam.bam 45 TGATCGTG Context D 3.0103 1 0 -exampleBAM.bam.bam 29 9 Cycle M 3.0103 1 0 -exampleBAM.bam.bam 12 GC Context M 3.0103 1 0 -exampleBAM.bam.bam 29 6 Cycle M 3.0103 1 0 -exampleBAM.bam.bam 45 GCCTCGTC Context I 3.0103 1 0 -exampleBAM.bam.bam 45 70 Cycle D 7.7815 5 0 -exampleBAM.bam.bam 45 74 Cycle I 7.7815 5 0 -exampleBAM.bam.bam 45 TTTGGGCT Context D 3.0103 1 0 -exampleBAM.bam.bam 45 TATCAATA Context D 3.0103 1 0 -exampleBAM.bam.bam 33 TG Context M 6.0206 3 0 -exampleBAM.bam.bam 45 TTGGTTAA Context D 3.0103 1 0 -exampleBAM.bam.bam 45 TCTAGAGT Context D 3.0103 1 0 -exampleBAM.bam.bam 45 TGCACTTT Context I 3.0103 1 0 -exampleBAM.bam.bam 4 49 Cycle M 3.0103 1 0 -exampleBAM.bam.bam 32 18 Cycle M 3.0103 1 0 -exampleBAM.bam.bam 10 GT Context M 3.0103 1 0 -exampleBAM.bam.bam 27 11 Cycle M 3.0103 1 0 -exampleBAM.bam.bam 27 CC Context M 3.0103 1 0 -exampleBAM.bam.bam 45 CCATGATT Context I 3.0103 1 0 -exampleBAM.bam.bam 5 TT Context M 1.7609 2 1 -exampleBAM.bam.bam 18 56 Cycle M 3.0103 1 0 -exampleBAM.bam.bam 45 TGGCTTTA Context D 3.0103 1 0 -exampleBAM.bam.bam 45 TGTCTTTA Context D 3.0103 1 0 -exampleBAM.bam.bam 45 TCAATGTG Context D 3.0103 1 0 -exampleBAM.bam.bam 12 68 Cycle M 3.0103 1 0 -exampleBAM.bam.bam 31 32 Cycle M 3.0103 1 0 -exampleBAM.bam.bam 45 GGAGCCTT Context I 3.0103 1 0 -exampleBAM.bam.bam 45 CAGATCCA Context I 3.0103 1 0 -exampleBAM.bam.bam 45 2 Cycle D 7.7815 5 0 -exampleBAM.bam.bam 45 14 Cycle I 7.7815 5 0 -exampleBAM.bam.bam 45 GCAATCCA Context I 3.0103 1 0 -exampleBAM.bam.bam 22 TC Context M 3.0103 1 0 -exampleBAM.bam.bam 45 GAGTGTTG Context D 3.0103 1 0 -exampleBAM.bam.bam 15 AA Context M 4.7712 2 0 -exampleBAM.bam.bam 45 GGGTTAGG Context I 4.7712 2 0 -exampleBAM.bam.bam 45 TATATCAA Context D 3.0103 1 0 -exampleBAM.bam.bam 17 62 Cycle M 3.0103 1 0 -exampleBAM.bam.bam 23 TT Context M 3.0103 1 0 -exampleBAM.bam.bam 45 CATGATTC Context I 3.0103 1 0 -exampleBAM.bam.bam 45 32 Cycle D 7.7815 5 0 -exampleBAM.bam.bam 45 44 Cycle I 7.7815 5 0 -exampleBAM.bam.bam 45 ATCCAGTT Context I 3.0103 1 0 -exampleBAM.bam.bam 45 CAGTTCTA Context D 3.0103 1 0 -exampleBAM.bam.bam 45 CAATCCAT Context I 3.0103 1 0 -exampleBAM.bam.bam 45 TGATTCTA Context D 3.0103 1 0 -exampleBAM.bam.bam 45 TCGTCCAT Context I 3.0103 1 0 -exampleBAM.bam.bam 24 GT Context M 4.7712 2 0 -exampleBAM.bam.bam 24 13 Cycle M 6.0206 3 0 -exampleBAM.bam.bam 30 34 Cycle M 3.0103 1 0 -exampleBAM.bam.bam 29 AC Context M 3.0103 1 0 -exampleBAM.bam.bam 29 7 Cycle M 3.0103 1 0 -exampleBAM.bam.bam 32 49 Cycle M 3.0103 1 0 -exampleBAM.bam.bam 25 74 Cycle M 3.0103 1 0 -exampleBAM.bam.bam 27 40 Cycle M 3.0103 1 0 -exampleBAM.bam.bam 28 39 Cycle M 3.0103 1 0 -exampleBAM.bam.bam 45 TTGCAATC Context D 3.0103 1 0 -exampleBAM.bam.bam 33 TT Context M 6.9897 4 0 -exampleBAM.bam.bam 30 69 Cycle M 3.0103 1 0 -exampleBAM.bam.bam 45 71 Cycle D 7.7815 5 0 -exampleBAM.bam.bam 45 75 Cycle I 7.7815 5 0 -exampleBAM.bam.bam 45 AGCAAAAT Context D 3.0103 1 0 -exampleBAM.bam.bam 32 19 Cycle M 3.0103 1 0 -exampleBAM.bam.bam 32 TC Context M 6.0206 3 0 -exampleBAM.bam.bam 29 37 Cycle M 3.0103 1 0 -exampleBAM.bam.bam 27 CA Context M 4.7712 2 0 -exampleBAM.bam.bam 45 ATAAAGAC Context D 3.0103 1 0 -exampleBAM.bam.bam 45 CACTGATG Context I 3.0103 1 0 -exampleBAM.bam.bam 45 CAGCCTCG Context D 3.0103 1 0 -exampleBAM.bam.bam 45 GCACTTTC Context D 3.0103 1 0 -exampleBAM.bam.bam 25 14 Cycle M 3.0103 1 0 -exampleBAM.bam.bam 34 23 Cycle M 3.0103 1 0 -exampleBAM.bam.bam 6 52 Cycle M -0.0000 1 1 -exampleBAM.bam.bam 45 TGATATAA Context I 3.0103 1 0 -exampleBAM.bam.bam 45 GGTTATCA Context D 3.0103 1 0 -exampleBAM.bam.bam 45 TTATATCA Context D 3.0103 1 0 -exampleBAM.bam.bam 45 TCACTGAT Context D 3.0103 1 0 -exampleBAM.bam.bam 45 GTGGCCTG Context I 3.0103 1 0 -exampleBAM.bam.bam 45 3 Cycle D 7.7815 5 0 -exampleBAM.bam.bam 45 15 Cycle I 7.7815 5 0 -exampleBAM.bam.bam 17 63 Cycle M 3.0103 1 0 -exampleBAM.bam.bam 23 TG Context M 3.0103 1 0 -exampleBAM.bam.bam 45 TTTGTATT Context D 3.0103 1 0 -exampleBAM.bam.bam 24 GG Context M 4.7712 2 0 -exampleBAM.bam.bam 30 35 Cycle M 4.7712 2 0 -exampleBAM.bam.bam 45 TATCATGG Context D 3.0103 1 0 -exampleBAM.bam.bam 45 TGACATGG Context D 3.0103 1 0 -exampleBAM.bam.bam 45 AGATCCAG Context I 3.0103 1 0 -exampleBAM.bam.bam 45 33 Cycle D 7.7815 5 0 -exampleBAM.bam.bam 45 45 Cycle I 7.7815 5 0 -exampleBAM.bam.bam 45 GGAGATTA Context I 3.0103 1 0 -exampleBAM.bam.bam 45 ATGGTATT Context D 3.0103 1 0 -exampleBAM.bam.bam 45 ATCTCCAG Context I 3.0103 1 0 -exampleBAM.bam.bam 45 CGGGTTCG Context I 3.0103 1 0 -exampleBAM.bam.bam 45 AGGGTTAG Context D 3.0103 1 0 -exampleBAM.bam.bam 45 AGGGTTCG Context I 3.0103 1 0 -exampleBAM.bam.bam 45 68 Cycle D 7.7815 5 0 -exampleBAM.bam.bam 45 72 Cycle I 7.7815 5 0 -exampleBAM.bam.bam 45 AGTCAATG Context D 3.0103 1 0 -exampleBAM.bam.bam 33 18 Cycle M 3.0103 1 0 -exampleBAM.bam.bam 33 TA Context M 3.0103 1 0 -exampleBAM.bam.bam 45 TGGGTTAG Context D 3.0103 1 0 -exampleBAM.bam.bam 45 TGGGTTCG Context I 3.0103 1 0 -exampleBAM.bam.bam 45 TTTTCTGT Context D 3.0103 1 0 -exampleBAM.bam.bam 4 TT Context M -0.0000 1 1 -exampleBAM.bam.bam 29 4 Cycle M 3.0103 1 0 -exampleBAM.bam.bam 25 73 Cycle M 3.0103 1 0 -exampleBAM.bam.bam 45 AGCCTTTG Context D 3.0103 1 0 -exampleBAM.bam.bam 45 ACTCTTTG Context D 3.0103 1 0 -exampleBAM.bam.bam 18 58 Cycle M -0.0000 1 1 -exampleBAM.bam.bam 45 ATTATTGA Context I 3.0103 1 0 -exampleBAM.bam.bam 45 ACATGATC Context I 3.0103 1 0 -exampleBAM.bam.bam 28 AA Context M 3.0103 1 0 -exampleBAM.bam.bam 33 48 Cycle M 3.0103 1 0 -exampleBAM.bam.bam 45 GTTAGGGT Context D 6.0206 3 0 -exampleBAM.bam.bam 32 16 Cycle M 4.7712 2 0 -exampleBAM.bam.bam 32 TG Context M 4.7712 2 0 -exampleBAM.bam.bam 45 GGCCTGAA Context D 3.0103 1 0 -exampleBAM.bam.bam 45 12 Cycle I 7.7815 5 0 -exampleBAM.bam.bam 45 AGATTAGA Context I 3.0103 1 0 -exampleBAM.bam.bam 45 GCAGCCTC Context I 3.0103 1 0 -exampleBAM.bam.bam 45 AATCCATT Context I 3.0103 1 0 -exampleBAM.bam.bam 45 CTTTATAT Context I 3.0103 1 0 -exampleBAM.bam.bam 45 CATGGTGG Context I 3.0103 1 0 -exampleBAM.bam.bam 22 TT Context M 3.0103 1 0 -exampleBAM.bam.bam 24 45 Cycle M 3.0103 1 0 -exampleBAM.bam.bam 25 GT Context M 6.0206 3 0 -exampleBAM.bam.bam 31 34 Cycle M 3.0103 1 0 -exampleBAM.bam.bam 34 20 Cycle M 3.0103 1 0 -exampleBAM.bam.bam 45 34 Cycle D 7.7815 5 0 -exampleBAM.bam.bam 45 46 Cycle I 7.7815 5 0 -exampleBAM.bam.bam 45 ATGAGTCA Context I 3.0103 1 0 -exampleBAM.bam.bam 22 51 Cycle M 3.0103 1 0 -exampleBAM.bam.bam 45 TTTTTCTG Context D 3.0103 1 0 -exampleBAM.bam.bam 45 GGGTTGGG Context I 6.0206 3 0 -exampleBAM.bam.bam 45 GGTTTGGG Context I 4.7712 2 0 -exampleBAM.bam.bam 45 TTAGATTT Context I 3.0103 1 0 -exampleBAM.bam.bam 30 32 Cycle M 3.0103 1 0 -exampleBAM.bam.bam 23 19 Cycle M 3.0103 1 0 -exampleBAM.bam.bam 23 TC Context M 3.0103 1 0 -exampleBAM.bam.bam 25 47 Cycle M 3.0103 1 0 -exampleBAM.bam.bam 10 75 Cycle M 3.0103 1 0 -exampleBAM.bam.bam 11 GG Context M 3.0103 1 0 -exampleBAM.bam.bam 33 TC Context M 8.4510 6 0 -exampleBAM.bam.bam 45 TGATCGTG Context I 3.0103 1 0 -exampleBAM.bam.bam 45 CAGGTTAT Context D 3.0103 1 0 -exampleBAM.bam.bam 45 CCAGTTCT Context I 3.0103 1 0 -exampleBAM.bam.bam 45 69 Cycle D 7.7815 5 0 -exampleBAM.bam.bam 45 73 Cycle I 7.7815 5 0 -exampleBAM.bam.bam 32 51 Cycle M 3.0103 1 0 -exampleBAM.bam.bam 29 AT Context M 4.7712 2 0 -exampleBAM.bam.bam 29 5 Cycle M 3.0103 1 0 -exampleBAM.bam.bam 33 49 Cycle M 3.0103 1 0 -exampleBAM.bam.bam 45 TATTGATA Context I 3.0103 1 0 -exampleBAM.bam.bam 45 CCATGATA Context I 3.0103 1 0 -exampleBAM.bam.bam 32 TT Context M 4.7712 2 0 -exampleBAM.bam.bam 45 TGGGGGTT Context D 3.0103 1 0 -exampleBAM.bam.bam 45 TTAGGGTT Context D 6.0206 3 0 -exampleBAM.bam.bam 45 TTCGGGTT Context D 6.0206 3 0 -exampleBAM.bam.bam 45 TTGGGGTT Context D 3.0103 1 0 -exampleBAM.bam.bam 45 TTTGGGTT Context D 3.0103 1 0 -exampleBAM.bam.bam 45 GTTGGGTT Context D 3.0103 1 0 -exampleBAM.bam.bam 45 GTTATCAT Context D 3.0103 1 0 -exampleBAM.bam.bam 45 CGTCCATG Context I 3.0103 1 0 -exampleBAM.bam.bam 45 CCACCATG Context I 3.0103 1 0 -exampleBAM.bam.bam 45 AAGACACA Context D 3.0103 1 0 -exampleBAM.bam.bam 45 1 Cycle D 7.7815 5 0 -exampleBAM.bam.bam 45 13 Cycle I 7.7815 5 0 -exampleBAM.bam.bam 45 CTGGGGTT Context D 3.0103 1 0 -exampleBAM.bam.bam 22 TG Context M 6.0206 3 0 -exampleBAM.bam.bam 25 GG Context M 4.7712 2 0 -exampleBAM.bam.bam 8 CA Context M 3.0103 1 0 -exampleBAM.bam.bam 34 21 Cycle M 3.0103 1 0 -exampleBAM.bam.bam 24 GA Context M 3.0103 1 0 -exampleBAM.bam.bam 45 GTGTTGGT Context I 3.0103 1 0 -exampleBAM.bam.bam 45 TCACATGA Context D 3.0103 1 0 -exampleBAM.bam.bam 45 GTCCATGA Context D 3.0103 1 0 -exampleBAM.bam.bam 45 CACCATGA Context D 3.0103 1 0 -exampleBAM.bam.bam 45 35 Cycle D 7.7815 5 0 -exampleBAM.bam.bam 45 47 Cycle I 7.7815 5 0 -exampleBAM.bam.bam 45 CTATTCTT Context D 3.0103 1 0 -exampleBAM.bam.bam 45 AATCTAAT Context D 3.0103 1 0 -exampleBAM.bam.bam 25 46 Cycle M 3.0103 1 0 -exampleBAM.bam.bam 27 76 Cycle M 3.0103 1 0 -exampleBAM.bam.bam 34 55 Cycle M 3.0103 1 0 -exampleBAM.bam.bam 31 1 Cycle M 3.0103 1 0 -exampleBAM.bam.bam 23 18 Cycle M 3.0103 1 0 -exampleBAM.bam.bam 31 66 Cycle M 3.0103 1 0 -exampleBAM.bam.bam 45 GAGATTAG Context D 3.0103 1 0 -exampleBAM.bam.bam 45 TTCAGGCC Context D 3.0103 1 0 -exampleBAM.bam.bam 13 AA Context M 3.0103 1 0 -exampleBAM.bam.bam 45 GGTTAATG Context D 3.0103 1 0 -exampleBAM.bam.bam 45 GGTGGAGC Context D 3.0103 1 0 -exampleBAM.bam.bam 21 TT Context M 3.0103 1 0 -exampleBAM.bam.bam 21 17 Cycle M 3.0103 1 0 -exampleBAM.bam.bam 12 AG Context M 3.0103 1 0 -exampleBAM.bam.bam 45 GGCCACCA Context I 3.0103 1 0 -exampleBAM.bam.bam 45 GCTGGGGT Context D 3.0103 1 0 -exampleBAM.bam.bam 45 CTTGGCTT Context I 3.0103 1 0 -exampleBAM.bam.bam 45 66 Cycle D 7.7815 5 0 -exampleBAM.bam.bam 26 GT Context M 3.0103 1 0 -exampleBAM.bam.bam 45 TAATCTCC Context D 3.0103 1 0 -exampleBAM.bam.bam 45 GTTGGGGT Context D 3.0103 1 0 -exampleBAM.bam.bam 28 34 Cycle M 3.0103 1 0 -exampleBAM.bam.bam 45 TTGGGGGT Context D 3.0103 1 0 -exampleBAM.bam.bam 17 58 Cycle M 3.0103 1 0 -exampleBAM.bam.bam 31 6 Cycle M 3.0103 1 0 -exampleBAM.bam.bam 45 CCTTTGCA Context I 3.0103 1 0 -exampleBAM.bam.bam 45 36 Cycle D 7.7815 5 0 -exampleBAM.bam.bam 45 40 Cycle I 7.7815 5 0 -exampleBAM.bam.bam 45 CAGGCACC Context D 3.0103 1 0 -exampleBAM.bam.bam 45 GTTCTAGA Context I 3.0103 1 0 -exampleBAM.bam.bam 45 TATTTGCA Context I 3.0103 1 0 -exampleBAM.bam.bam 34 TA Context M 3.0103 1 0 -exampleBAM.bam.bam 25 CC Context M 3.0103 1 0 -exampleBAM.bam.bam 22 23 Cycle M 3.0103 1 0 -exampleBAM.bam.bam 45 GAACTGGG Context I 3.0103 1 0 -exampleBAM.bam.bam 45 6 Cycle D 7.7815 5 0 -exampleBAM.bam.bam 45 10 Cycle I 7.7815 5 0 -exampleBAM.bam.bam 45 GGGCTGGG Context I 3.0103 1 0 -exampleBAM.bam.bam 45 TTGATATA Context D 3.0103 1 0 -exampleBAM.bam.bam 45 TTCTTAAG Context D 3.0103 1 0 -exampleBAM.bam.bam 27 GA Context M 4.7712 2 0 -exampleBAM.bam.bam 27 14 Cycle M 3.0103 1 0 -exampleBAM.bam.bam 32 23 Cycle M 3.0103 1 0 -exampleBAM.bam.bam 21 50 Cycle M 3.0103 1 0 -exampleBAM.bam.bam 45 TAACCTGG Context D 3.0103 1 0 -exampleBAM.bam.bam 45 TCTATTCT Context I 3.0103 1 0 -exampleBAM.bam.bam 11 40 Cycle M -0.0000 1 1 -exampleBAM.bam.bam 45 TTTATTAT Context D 3.0103 1 0 -exampleBAM.bam.bam 45 ATGATTCT Context I 3.0103 1 0 -exampleBAM.bam.bam 45 CCTGGAGA Context D 3.0103 1 0 -exampleBAM.bam.bam 45 GCCAGGCA Context D 3.0103 1 0 -exampleBAM.bam.bam 12 AT Context M 3.0103 1 0 -exampleBAM.bam.bam 32 53 Cycle M 3.0103 1 0 -exampleBAM.bam.bam 21 TG Context M 6.0206 3 0 -exampleBAM.bam.bam 26 GG Context M 3.0103 1 0 -exampleBAM.bam.bam 45 TCTGTGTC Context D 3.0103 1 0 -exampleBAM.bam.bam 45 GTTGGGGG Context D 3.0103 1 0 -exampleBAM.bam.bam 45 TTGGGCTG Context I 3.0103 1 0 -exampleBAM.bam.bam 45 AAATCTAA Context I 3.0103 1 0 -exampleBAM.bam.bam 45 67 Cycle D 7.7815 5 0 -exampleBAM.bam.bam 45 CTGGAGAT Context D 3.0103 1 0 -exampleBAM.bam.bam 45 AGATTTTT Context D 3.0103 1 0 -exampleBAM.bam.bam 45 AGGCACCC Context I 3.0103 1 0 -exampleBAM.bam.bam 45 CTGAAAGT Context I 3.0103 1 0 -exampleBAM.bam.bam 8 46 Cycle M 3.0103 1 0 -exampleBAM.bam.bam 45 TCCAGGTT Context D 3.0103 1 0 -exampleBAM.bam.bam 45 GTGAGTGT Context I 3.0103 1 0 -exampleBAM.bam.bam 24 CG Context M 3.0103 1 0 -exampleBAM.bam.bam 45 TTATCATG Context I 3.0103 1 0 -exampleBAM.bam.bam 45 ACAGCAAA Context I 3.0103 1 0 -exampleBAM.bam.bam 45 37 Cycle D 7.7815 5 0 -exampleBAM.bam.bam 45 41 Cycle I 7.7815 5 0 -exampleBAM.bam.bam 45 AGTGCAAA Context I 3.0103 1 0 -exampleBAM.bam.bam 34 TC Context M 6.0206 3 0 -exampleBAM.bam.bam 25 CA Context M 3.0103 1 0 -exampleBAM.bam.bam 30 AT Context M 3.0103 1 0 -exampleBAM.bam.bam 45 TTTATATC Context D 3.0103 1 0 -exampleBAM.bam.bam 45 TTACTCTT Context D 3.0103 1 0 -exampleBAM.bam.bam 45 GTATTACT Context I 3.0103 1 0 -exampleBAM.bam.bam 45 TGGTTAAT Context D 3.0103 1 0 -exampleBAM.bam.bam 45 7 Cycle D 7.7815 5 0 -exampleBAM.bam.bam 45 11 Cycle I 7.7815 5 0 -exampleBAM.bam.bam 45 CCTGAAAG Context D 3.0103 1 0 -exampleBAM.bam.bam 45 CTTTGCAC Context I 3.0103 1 0 -exampleBAM.bam.bam 45 GTGAACTG Context D 3.0103 1 0 -exampleBAM.bam.bam 45 TTGGCTTT Context I 3.0103 1 0 -exampleBAM.bam.bam 28 2 Cycle M 3.0103 1 0 -exampleBAM.bam.bam 19 30 Cycle M 3.0103 1 0 -exampleBAM.bam.bam 27 GT Context M 3.0103 1 0 -exampleBAM.bam.bam 45 64 Cycle D 7.7815 5 0 -exampleBAM.bam.bam 45 76 Cycle I 7.7815 5 0 -exampleBAM.bam.bam 45 AGTGTTGG Context I 3.0103 1 0 -exampleBAM.bam.bam 45 AGGGTTGG Context I 3.0103 1 0 -exampleBAM.bam.bam 45 GATTCTAT Context I 3.0103 1 0 -exampleBAM.bam.bam 45 AGACACAG Context D 3.0103 1 0 -exampleBAM.bam.bam 45 GGGGTTGG Context I 4.7712 2 0 -exampleBAM.bam.bam 15 68 Cycle M 3.0103 1 0 -exampleBAM.bam.bam 45 TATAAAGA Context I 3.0103 1 0 -exampleBAM.bam.bam 33 22 Cycle M 4.7712 2 0 -exampleBAM.bam.bam 12 AA Context M 3.0103 1 0 -exampleBAM.bam.bam 32 54 Cycle M 3.0103 1 0 -exampleBAM.bam.bam 45 CTCGTCCA Context I 3.0103 1 0 -exampleBAM.bam.bam 45 38 Cycle D 7.7815 5 0 -exampleBAM.bam.bam 45 42 Cycle I 7.7815 5 0 -exampleBAM.bam.bam 45 TTAAGTGA Context I 3.0103 1 0 -exampleBAM.bam.bam 45 TTTGCAAT Context I 3.0103 1 0 -exampleBAM.bam.bam 45 TTTGCACT Context D 3.0103 1 0 -exampleBAM.bam.bam 24 CC Context M 4.7712 2 0 -exampleBAM.bam.bam 45 TGAGTCAA Context D 3.0103 1 0 -exampleBAM.bam.bam 6 TT Context M 1.7609 2 1 -exampleBAM.bam.bam 31 4 Cycle M 3.0103 1 0 -exampleBAM.bam.bam 31 AG Context M 4.7712 2 0 -exampleBAM.bam.bam 34 50 Cycle M 3.0103 1 0 -exampleBAM.bam.bam 27 73 Cycle M 3.0103 1 0 -exampleBAM.bam.bam 45 GACACAGC Context D 3.0103 1 0 -exampleBAM.bam.bam 45 AACCTGGA Context I 3.0103 1 0 -exampleBAM.bam.bam 45 4 Cycle D 7.7815 5 0 -exampleBAM.bam.bam 45 8 Cycle I 7.7815 5 0 -exampleBAM.bam.bam 16 58 Cycle M 3.0103 1 0 -exampleBAM.bam.bam 30 AA Context M 4.7712 2 0 -exampleBAM.bam.bam 24 41 Cycle M 3.0103 1 0 -exampleBAM.bam.bam 34 TG Context M 6.0206 3 0 -exampleBAM.bam.bam 29 68 Cycle M 3.0103 1 0 -exampleBAM.bam.bam 25 9 Cycle M 3.0103 1 0 -exampleBAM.bam.bam 26 44 Cycle M 3.0103 1 0 -exampleBAM.bam.bam 45 GGTATTAC Context D 3.0103 1 0 -exampleBAM.bam.bam 45 TGTGAACT Context I 3.0103 1 0 -exampleBAM.bam.bam 45 TGGCCTGA Context D 3.0103 1 0 -exampleBAM.bam.bam 5 22 Cycle M 3.0103 1 0 -exampleBAM.bam.bam 45 AAGTGCAA Context I 3.0103 1 0 -exampleBAM.bam.bam 45 ATTTGCAA Context I 3.0103 1 0 -exampleBAM.bam.bam 45 ATCTAATC Context D 3.0103 1 0 -exampleBAM.bam.bam 27 GG Context M 3.0103 1 0 -exampleBAM.bam.bam 21 48 Cycle M 3.0103 1 0 -exampleBAM.bam.bam 45 TGAGTGTT Context D 3.0103 1 0 -exampleBAM.bam.bam 13 39 Cycle M 3.0103 1 0 -exampleBAM.bam.bam 45 TAAAGACA Context D 3.0103 1 0 -exampleBAM.bam.bam 33 23 Cycle M 3.0103 1 0 -exampleBAM.bam.bam 45 GTGGAGCC Context I 3.0103 1 0 -exampleBAM.bam.bam 45 TTTCACAT Context D 3.0103 1 0 -exampleBAM.bam.bam 45 65 Cycle D 7.7815 5 0 -exampleBAM.bam.bam 45 GATTTTTC Context D 3.0103 1 0 -exampleBAM.bam.bam 45 AGTTCTAG Context I 3.0103 1 0 -exampleBAM.bam.bam 19 61 Cycle M 3.0103 1 0 -exampleBAM.bam.bam 28 71 Cycle M 3.0103 1 0 -exampleBAM.bam.bam 15 35 Cycle M 3.0103 1 0 -exampleBAM.bam.bam 24 CA Context M 3.0103 1 0 -exampleBAM.bam.bam 24 10 Cycle M -0.0000 1 1 -exampleBAM.bam.bam 45 TTATTGAT Context D 3.0103 1 0 -exampleBAM.bam.bam 45 ATAACCTG Context I 3.0103 1 0 -exampleBAM.bam.bam 45 GAAAGTGC Context I 3.0103 1 0 -exampleBAM.bam.bam 45 39 Cycle D 7.7815 5 0 -exampleBAM.bam.bam 45 43 Cycle I 7.7815 5 0 -exampleBAM.bam.bam 31 AT Context M 4.7712 2 0 -exampleBAM.bam.bam 31 5 Cycle M 3.0103 1 0 -exampleBAM.bam.bam 34 51 Cycle M 3.0103 1 0 -exampleBAM.bam.bam 27 72 Cycle M 3.0103 1 0 -exampleBAM.bam.bam 30 AC Context M 3.0103 1 0 -exampleBAM.bam.bam 45 CATGGTAT Context D 3.0103 1 0 -exampleBAM.bam.bam 45 ATGATCGT Context I 3.0103 1 0 -exampleBAM.bam.bam 45 5 Cycle D 7.7815 5 0 -exampleBAM.bam.bam 45 9 Cycle I 7.7815 5 0 -exampleBAM.bam.bam 45 GCACCCAG Context I 3.0103 1 0 -exampleBAM.bam.bam 34 TT Context M 8.4510 6 0 -exampleBAM.bam.bam 31 39 Cycle M 4.7712 2 0 -exampleBAM.bam.bam 14 33 Cycle M 3.0103 1 0 +ReadGroup QualityScore CovariateValue CovariateName EventType EmpiricalQuality Observations Errors +exampleBAM.bam 6 AA Context M 6.0000 1 0.00 +exampleBAM.bam 6 GA Context M 6.0000 1 0.00 +exampleBAM.bam 6 GC Context M 6.0000 2 2.00 +exampleBAM.bam 6 TG Context M 6.0000 1 0.00 +exampleBAM.bam 6 AT Context M 6.0000 1 0.00 +exampleBAM.bam 6 CT Context M 6.0000 1 0.00 +exampleBAM.bam 6 GT Context M 6.0000 2 0.00 +exampleBAM.bam 6 TT Context M 6.0000 2 1.00 +exampleBAM.bam 8 AA Context M 8.0000 1 0.00 +exampleBAM.bam 8 GA Context M 8.0000 2 0.00 +exampleBAM.bam 8 GC Context M 8.0000 1 0.00 +exampleBAM.bam 8 TG Context M 8.0000 1 1.00 +exampleBAM.bam 8 GT Context M 8.0000 2 0.00 +exampleBAM.bam 9 TG Context M 9.0000 1 0.00 +exampleBAM.bam 9 AT Context M 9.0000 1 0.00 +exampleBAM.bam 9 CT Context M 9.0000 1 0.00 +exampleBAM.bam 9 GT Context M 9.0000 1 0.00 +exampleBAM.bam 10 TT Context M 10.0000 1 0.00 +exampleBAM.bam 11 TC Context M 11.0000 1 1.00 +exampleBAM.bam 11 GT Context M 11.0000 1 0.00 +exampleBAM.bam 12 GA Context M 12.0000 1 0.00 +exampleBAM.bam 12 CC Context M 12.0000 1 0.00 +exampleBAM.bam 12 TC Context M 12.0000 1 0.00 +exampleBAM.bam 12 AG Context M 12.0000 1 0.00 +exampleBAM.bam 13 AA Context M 13.0000 1 0.00 +exampleBAM.bam 13 AG Context M 13.0000 1 0.00 +exampleBAM.bam 13 AT Context M 13.0000 1 0.00 +exampleBAM.bam 14 GA Context M 14.0000 1 0.00 +exampleBAM.bam 15 AA Context M 15.0000 2 0.00 +exampleBAM.bam 15 GA Context M 15.0000 1 0.00 +exampleBAM.bam 15 GT Context M 15.0000 2 0.00 +exampleBAM.bam 16 AA Context M 16.0000 1 0.00 +exampleBAM.bam 16 TA Context M 16.0000 4 1.00 +exampleBAM.bam 16 TC Context M 16.0000 1 0.00 +exampleBAM.bam 16 GG Context M 16.0000 1 0.00 +exampleBAM.bam 16 TG Context M 16.0000 1 0.00 +exampleBAM.bam 16 CT Context M 16.0000 1 0.00 +exampleBAM.bam 16 GT Context M 16.0000 1 0.00 +exampleBAM.bam 17 CA Context M 17.0000 1 0.00 +exampleBAM.bam 17 TA Context M 17.0000 1 0.00 +exampleBAM.bam 17 TG Context M 17.0000 1 1.00 +exampleBAM.bam 17 GT Context M 17.0000 1 0.00 +exampleBAM.bam 17 TT Context M 17.0000 2 0.00 +exampleBAM.bam 18 AC Context M 18.0000 1 0.00 +exampleBAM.bam 18 TC Context M 18.0000 1 1.00 +exampleBAM.bam 18 AT Context M 18.0000 1 0.00 +exampleBAM.bam 18 GT Context M 18.0000 1 0.00 +exampleBAM.bam 18 TT Context M 18.0000 2 0.00 +exampleBAM.bam 19 AA Context M 19.0000 2 0.00 +exampleBAM.bam 19 CA Context M 19.0000 2 0.00 +exampleBAM.bam 19 GA Context M 19.0000 2 0.00 +exampleBAM.bam 19 TA Context M 19.0000 3 0.00 +exampleBAM.bam 19 GC Context M 19.0000 1 0.00 +exampleBAM.bam 19 GG Context M 19.0000 1 0.00 +exampleBAM.bam 19 TG Context M 19.0000 2 1.00 +exampleBAM.bam 19 GT Context M 19.0000 1 0.00 +exampleBAM.bam 19 TT Context M 19.0000 1 0.00 +exampleBAM.bam 20 AA Context M 20.0000 1 0.00 +exampleBAM.bam 20 CA Context M 20.0000 1 0.00 +exampleBAM.bam 20 CC Context M 20.0000 1 0.00 +exampleBAM.bam 20 TG Context M 20.0000 1 0.00 +exampleBAM.bam 20 TT Context M 20.0000 1 1.00 +exampleBAM.bam 21 CA Context M 21.0000 1 0.00 +exampleBAM.bam 21 GA Context M 21.0000 1 0.00 +exampleBAM.bam 21 TA Context M 21.0000 1 0.00 +exampleBAM.bam 21 CC Context M 21.0000 1 0.00 +exampleBAM.bam 21 TC Context M 21.0000 2 0.00 +exampleBAM.bam 21 AG Context M 21.0000 1 0.00 +exampleBAM.bam 21 GG Context M 21.0000 4 0.00 +exampleBAM.bam 21 TG Context M 21.0000 1 0.00 +exampleBAM.bam 21 AT Context M 21.0000 2 0.00 +exampleBAM.bam 21 CT Context M 21.0000 1 0.00 +exampleBAM.bam 21 GT Context M 21.0000 2 0.00 +exampleBAM.bam 22 CA Context M 22.0000 1 0.00 +exampleBAM.bam 22 GA Context M 22.0000 3 0.00 +exampleBAM.bam 22 TA Context M 22.0000 1 0.00 +exampleBAM.bam 22 GC Context M 22.0000 1 0.00 +exampleBAM.bam 22 GG Context M 22.0000 1 0.00 +exampleBAM.bam 22 TG Context M 22.0000 1 0.00 +exampleBAM.bam 22 TT Context M 22.0000 1 0.00 +exampleBAM.bam 23 AA Context M 23.0000 1 0.00 +exampleBAM.bam 23 CA Context M 23.0000 1 0.00 +exampleBAM.bam 23 TA Context M 23.0000 1 0.00 +exampleBAM.bam 23 CC Context M 23.0000 2 0.00 +exampleBAM.bam 23 GC Context M 23.0000 1 0.00 +exampleBAM.bam 23 TC Context M 23.0000 2 0.00 +exampleBAM.bam 23 GG Context M 23.0000 1 0.00 +exampleBAM.bam 23 TG Context M 23.0000 3 0.00 +exampleBAM.bam 23 AT Context M 23.0000 1 0.00 +exampleBAM.bam 23 TT Context M 23.0000 2 0.00 +exampleBAM.bam 24 CA Context M 24.0000 3 0.00 +exampleBAM.bam 24 GA Context M 24.0000 2 0.00 +exampleBAM.bam 24 TA Context M 24.0000 2 1.00 +exampleBAM.bam 24 GC Context M 24.0000 1 0.00 +exampleBAM.bam 24 AG Context M 24.0000 2 0.00 +exampleBAM.bam 24 CG Context M 24.0000 1 0.00 +exampleBAM.bam 24 GG Context M 24.0000 3 0.00 +exampleBAM.bam 24 AT Context M 24.0000 1 0.00 +exampleBAM.bam 24 CT Context M 24.0000 1 0.00 +exampleBAM.bam 24 GT Context M 24.0000 1 0.00 +exampleBAM.bam 24 TT Context M 24.0000 3 0.00 +exampleBAM.bam 25 AA Context M 25.0000 2 0.00 +exampleBAM.bam 25 CA Context M 25.0000 1 0.00 +exampleBAM.bam 25 GG Context M 25.0000 2 0.00 +exampleBAM.bam 25 TG Context M 25.0000 2 0.00 +exampleBAM.bam 25 AT Context M 25.0000 2 0.00 +exampleBAM.bam 25 GT Context M 25.0000 1 0.00 +exampleBAM.bam 25 TT Context M 25.0000 5 0.00 +exampleBAM.bam 26 TA Context M 26.0000 1 0.00 +exampleBAM.bam 26 GG Context M 26.0000 1 0.00 +exampleBAM.bam 26 TG Context M 26.0000 1 0.00 +exampleBAM.bam 26 AT Context M 26.0000 1 0.00 +exampleBAM.bam 26 GT Context M 26.0000 1 0.00 +exampleBAM.bam 26 TT Context M 26.0000 1 0.00 +exampleBAM.bam 27 AA Context M 27.0000 2 0.00 +exampleBAM.bam 27 CA Context M 27.0000 1 0.00 +exampleBAM.bam 27 TA Context M 27.0000 1 0.00 +exampleBAM.bam 27 TC Context M 27.0000 2 0.00 +exampleBAM.bam 27 AG Context M 27.0000 3 0.00 +exampleBAM.bam 27 GG Context M 27.0000 3 0.00 +exampleBAM.bam 27 TG Context M 27.0000 2 0.00 +exampleBAM.bam 27 AT Context M 27.0000 4 0.00 +exampleBAM.bam 27 CT Context M 27.0000 2 0.00 +exampleBAM.bam 27 TT Context M 27.0000 2 0.00 +exampleBAM.bam 28 AA Context M 28.0000 1 0.00 +exampleBAM.bam 28 CA Context M 28.0000 1 0.00 +exampleBAM.bam 28 TA Context M 28.0000 2 0.00 +exampleBAM.bam 28 AG Context M 28.0000 3 0.00 +exampleBAM.bam 28 GG Context M 28.0000 3 0.00 +exampleBAM.bam 28 TG Context M 28.0000 1 0.00 +exampleBAM.bam 28 GT Context M 28.0000 4 0.00 +exampleBAM.bam 29 CA Context M 29.0000 1 0.00 +exampleBAM.bam 29 TA Context M 29.0000 1 0.00 +exampleBAM.bam 29 AC Context M 29.0000 1 0.00 +exampleBAM.bam 29 CC Context M 29.0000 1 0.00 +exampleBAM.bam 29 GC Context M 29.0000 1 0.00 +exampleBAM.bam 29 AG Context M 29.0000 3 0.00 +exampleBAM.bam 29 CG Context M 29.0000 1 0.00 +exampleBAM.bam 29 GG Context M 29.0000 4 0.00 +exampleBAM.bam 29 TG Context M 29.0000 1 0.00 +exampleBAM.bam 29 AT Context M 29.0000 1 0.00 +exampleBAM.bam 29 GT Context M 29.0000 1 0.00 +exampleBAM.bam 29 TT Context M 29.0000 4 0.00 +exampleBAM.bam 30 AA Context M 30.0000 2 0.00 +exampleBAM.bam 30 CA Context M 30.0000 1 0.00 +exampleBAM.bam 30 AC Context M 30.0000 4 0.00 +exampleBAM.bam 30 CC Context M 30.0000 1 0.00 +exampleBAM.bam 30 TC Context M 30.0000 2 0.00 +exampleBAM.bam 30 AG Context M 30.0000 3 0.00 +exampleBAM.bam 30 GG Context M 30.0000 1 0.00 +exampleBAM.bam 30 TG Context M 30.0000 1 0.00 +exampleBAM.bam 30 AT Context M 30.0000 2 0.00 +exampleBAM.bam 30 CT Context M 30.0000 2 0.00 +exampleBAM.bam 30 GT Context M 30.0000 1 0.00 +exampleBAM.bam 31 CA Context M 31.0000 1 0.00 +exampleBAM.bam 31 GA Context M 31.0000 1 0.00 +exampleBAM.bam 31 CC Context M 31.0000 2 0.00 +exampleBAM.bam 31 GC Context M 31.0000 2 0.00 +exampleBAM.bam 31 AG Context M 31.0000 2 0.00 +exampleBAM.bam 31 GG Context M 31.0000 6 0.00 +exampleBAM.bam 31 TG Context M 31.0000 2 0.00 +exampleBAM.bam 31 AT Context M 31.0000 2 0.00 +exampleBAM.bam 31 CT Context M 31.0000 2 0.00 +exampleBAM.bam 31 GT Context M 31.0000 1 0.00 +exampleBAM.bam 31 TT Context M 31.0000 3 0.00 +exampleBAM.bam 32 CA Context M 32.0000 2 0.00 +exampleBAM.bam 32 TA Context M 32.0000 1 0.00 +exampleBAM.bam 32 AC Context M 32.0000 1 0.00 +exampleBAM.bam 32 CC Context M 32.0000 1 0.00 +exampleBAM.bam 32 TC Context M 32.0000 1 0.00 +exampleBAM.bam 32 AG Context M 32.0000 1 0.00 +exampleBAM.bam 32 CG Context M 32.0000 1 0.00 +exampleBAM.bam 32 GG Context M 32.0000 8 0.00 +exampleBAM.bam 32 TG Context M 32.0000 3 0.00 +exampleBAM.bam 32 AT Context M 32.0000 4 0.00 +exampleBAM.bam 32 CT Context M 32.0000 2 0.00 +exampleBAM.bam 32 TT Context M 32.0000 6 0.00 +exampleBAM.bam 33 CA Context M 33.0000 2 0.00 +exampleBAM.bam 33 GA Context M 33.0000 2 0.00 +exampleBAM.bam 33 TA Context M 33.0000 1 0.00 +exampleBAM.bam 33 AC Context M 33.0000 1 0.00 +exampleBAM.bam 33 CC Context M 33.0000 2 0.00 +exampleBAM.bam 33 GC Context M 33.0000 1 0.00 +exampleBAM.bam 33 TC Context M 33.0000 3 0.00 +exampleBAM.bam 33 AG Context M 33.0000 2 0.00 +exampleBAM.bam 33 CG Context M 33.0000 1 0.00 +exampleBAM.bam 33 GG Context M 33.0000 2 0.00 +exampleBAM.bam 33 TG Context M 33.0000 5 0.00 +exampleBAM.bam 33 AT Context M 33.0000 2 0.00 +exampleBAM.bam 33 CT Context M 33.0000 4 0.00 +exampleBAM.bam 33 GT Context M 33.0000 1 0.00 +exampleBAM.bam 33 TT Context M 33.0000 4 0.00 +exampleBAM.bam 34 AA Context M 34.0000 1 0.00 +exampleBAM.bam 34 CA Context M 34.0000 3 0.00 +exampleBAM.bam 34 GA Context M 34.0000 1 0.00 +exampleBAM.bam 34 TA Context M 34.0000 2 0.00 +exampleBAM.bam 34 AC Context M 34.0000 1 0.00 +exampleBAM.bam 34 CC Context M 34.0000 1 0.00 +exampleBAM.bam 34 GC Context M 34.0000 2 0.00 +exampleBAM.bam 34 TC Context M 34.0000 6 0.00 +exampleBAM.bam 34 AG Context M 34.0000 1 0.00 +exampleBAM.bam 34 CG Context M 34.0000 1 0.00 +exampleBAM.bam 34 GG Context M 34.0000 1 0.00 +exampleBAM.bam 34 TG Context M 34.0000 4 0.00 +exampleBAM.bam 34 AT Context M 34.0000 4 0.00 +exampleBAM.bam 34 CT Context M 34.0000 2 0.00 +exampleBAM.bam 34 GT Context M 34.0000 1 0.00 +exampleBAM.bam 34 TT Context M 34.0000 5 0.00 +exampleBAM.bam 45 AAA Context I 45.0000 5 0.00 +exampleBAM.bam 45 AAA Context D 45.0000 5 0.00 +exampleBAM.bam 45 CAA Context I 45.0000 5 0.00 +exampleBAM.bam 45 CAA Context D 45.0000 5 0.00 +exampleBAM.bam 45 GAA Context I 45.0000 2 0.00 +exampleBAM.bam 45 GAA Context D 45.0000 2 0.00 +exampleBAM.bam 45 TAA Context I 45.0000 6 0.00 +exampleBAM.bam 45 TAA Context D 45.0000 6 0.00 +exampleBAM.bam 45 ACA Context I 45.0000 4 0.00 +exampleBAM.bam 45 ACA Context D 45.0000 4 0.00 +exampleBAM.bam 45 CCA Context I 45.0000 8 0.00 +exampleBAM.bam 45 CCA Context D 45.0000 8 0.00 +exampleBAM.bam 45 GCA Context I 45.0000 5 0.00 +exampleBAM.bam 45 GCA Context D 45.0000 5 0.00 +exampleBAM.bam 45 TCA Context I 45.0000 6 0.00 +exampleBAM.bam 45 TCA Context D 45.0000 6 0.00 +exampleBAM.bam 45 AGA Context I 45.0000 5 0.00 +exampleBAM.bam 45 AGA Context D 45.0000 5 0.00 +exampleBAM.bam 45 GGA Context I 45.0000 3 0.00 +exampleBAM.bam 45 GGA Context D 45.0000 3 0.00 +exampleBAM.bam 45 TGA Context I 45.0000 10 0.00 +exampleBAM.bam 45 TGA Context D 45.0000 10 0.00 +exampleBAM.bam 45 ATA Context I 45.0000 6 0.00 +exampleBAM.bam 45 ATA Context D 45.0000 6 0.00 +exampleBAM.bam 45 CTA Context I 45.0000 3 0.00 +exampleBAM.bam 45 CTA Context D 45.0000 3 0.00 +exampleBAM.bam 45 GTA Context I 45.0000 2 0.00 +exampleBAM.bam 45 GTA Context D 45.0000 2 0.00 +exampleBAM.bam 45 TTA Context I 45.0000 11 0.00 +exampleBAM.bam 45 TTA Context D 45.0000 11 0.00 +exampleBAM.bam 45 CAC Context I 45.0000 6 0.00 +exampleBAM.bam 45 CAC Context D 45.0000 6 0.00 +exampleBAM.bam 45 GAC Context I 45.0000 2 0.00 +exampleBAM.bam 45 GAC Context D 45.0000 2 0.00 +exampleBAM.bam 45 TAC Context I 45.0000 1 0.00 +exampleBAM.bam 45 TAC Context D 45.0000 1 0.00 +exampleBAM.bam 45 ACC Context I 45.0000 3 0.00 +exampleBAM.bam 45 ACC Context D 45.0000 3 0.00 +exampleBAM.bam 45 CCC Context I 45.0000 1 0.00 +exampleBAM.bam 45 CCC Context D 45.0000 1 0.00 +exampleBAM.bam 45 GCC Context I 45.0000 5 0.00 +exampleBAM.bam 45 GCC Context D 45.0000 5 0.00 +exampleBAM.bam 45 TCC Context I 45.0000 4 0.00 +exampleBAM.bam 45 TCC Context D 45.0000 4 0.00 +exampleBAM.bam 45 AGC Context I 45.0000 3 0.00 +exampleBAM.bam 45 AGC Context D 45.0000 3 0.00 +exampleBAM.bam 45 GGC Context I 45.0000 6 0.00 +exampleBAM.bam 45 GGC Context D 45.0000 6 0.00 +exampleBAM.bam 45 TGC Context I 45.0000 4 0.00 +exampleBAM.bam 45 TGC Context D 45.0000 4 0.00 +exampleBAM.bam 45 ATC Context I 45.0000 7 0.00 +exampleBAM.bam 45 ATC Context D 45.0000 7 0.00 +exampleBAM.bam 45 CTC Context I 45.0000 3 0.00 +exampleBAM.bam 45 CTC Context D 45.0000 3 0.00 +exampleBAM.bam 45 GTC Context I 45.0000 3 0.00 +exampleBAM.bam 45 GTC Context D 45.0000 3 0.00 +exampleBAM.bam 45 TTC Context I 45.0000 9 0.00 +exampleBAM.bam 45 TTC Context D 45.0000 9 0.00 +exampleBAM.bam 45 AAG Context I 45.0000 4 0.00 +exampleBAM.bam 45 AAG Context D 45.0000 4 0.00 +exampleBAM.bam 45 CAG Context I 45.0000 7 0.00 +exampleBAM.bam 45 CAG Context D 45.0000 7 0.00 +exampleBAM.bam 45 GAG Context I 45.0000 6 0.00 +exampleBAM.bam 45 GAG Context D 45.0000 6 0.00 +exampleBAM.bam 45 TAG Context I 45.0000 5 0.00 +exampleBAM.bam 45 TAG Context D 45.0000 5 0.00 +exampleBAM.bam 45 TCG Context I 45.0000 5 0.00 +exampleBAM.bam 45 TCG Context D 45.0000 5 0.00 +exampleBAM.bam 45 AGG Context I 45.0000 7 0.00 +exampleBAM.bam 45 AGG Context D 45.0000 7 0.00 +exampleBAM.bam 45 CGG Context I 45.0000 3 0.00 +exampleBAM.bam 45 CGG Context D 45.0000 3 0.00 +exampleBAM.bam 45 GGG Context I 45.0000 16 0.00 +exampleBAM.bam 45 GGG Context D 45.0000 16 0.00 +exampleBAM.bam 45 TGG Context I 45.0000 16 0.00 +exampleBAM.bam 45 TGG Context D 45.0000 16 0.00 +exampleBAM.bam 45 ATG Context I 45.0000 8 0.00 +exampleBAM.bam 45 ATG Context D 45.0000 8 0.00 +exampleBAM.bam 45 CTG Context I 45.0000 6 0.00 +exampleBAM.bam 45 CTG Context D 45.0000 6 0.00 +exampleBAM.bam 45 GTG Context I 45.0000 8 0.00 +exampleBAM.bam 45 GTG Context D 45.0000 8 0.00 +exampleBAM.bam 45 TTG Context I 45.0000 11 0.00 +exampleBAM.bam 45 TTG Context D 45.0000 11 0.00 +exampleBAM.bam 45 AAT Context I 45.0000 7 0.00 +exampleBAM.bam 45 AAT Context D 45.0000 7 0.00 +exampleBAM.bam 45 CAT Context I 45.0000 6 0.00 +exampleBAM.bam 45 CAT Context D 45.0000 6 0.00 +exampleBAM.bam 45 GAT Context I 45.0000 8 0.00 +exampleBAM.bam 45 GAT Context D 45.0000 8 0.00 +exampleBAM.bam 45 TAT Context I 45.0000 9 0.00 +exampleBAM.bam 45 TAT Context D 45.0000 9 0.00 +exampleBAM.bam 45 ACT Context I 45.0000 4 0.00 +exampleBAM.bam 45 ACT Context D 45.0000 4 0.00 +exampleBAM.bam 45 CCT Context I 45.0000 4 0.00 +exampleBAM.bam 45 CCT Context D 45.0000 4 0.00 +exampleBAM.bam 45 GCT Context I 45.0000 2 0.00 +exampleBAM.bam 45 GCT Context D 45.0000 2 0.00 +exampleBAM.bam 45 TCT Context I 45.0000 8 0.00 +exampleBAM.bam 45 TCT Context D 45.0000 8 0.00 +exampleBAM.bam 45 AGT Context I 45.0000 5 0.00 +exampleBAM.bam 45 AGT Context D 45.0000 5 0.00 +exampleBAM.bam 45 CGT Context I 45.0000 2 0.00 +exampleBAM.bam 45 CGT Context D 45.0000 2 0.00 +exampleBAM.bam 45 GGT Context I 45.0000 13 0.00 +exampleBAM.bam 45 GGT Context D 45.0000 13 0.00 +exampleBAM.bam 45 TGT Context I 45.0000 5 0.00 +exampleBAM.bam 45 TGT Context D 45.0000 5 0.00 +exampleBAM.bam 45 ATT Context I 45.0000 9 0.00 +exampleBAM.bam 45 ATT Context D 45.0000 9 0.00 +exampleBAM.bam 45 CTT Context I 45.0000 7 0.00 +exampleBAM.bam 45 CTT Context D 45.0000 7 0.00 +exampleBAM.bam 45 GTT Context I 45.0000 17 0.00 +exampleBAM.bam 45 GTT Context D 45.0000 17 0.00 +exampleBAM.bam 45 TTT Context I 45.0000 12 0.00 +exampleBAM.bam 45 TTT Context D 45.0000 12 0.00 +exampleBAM.bam 6 -4 Cycle M 6.0000 1 0.00 +exampleBAM.bam 6 31 Cycle M 6.0000 1 1.00 +exampleBAM.bam 6 36 Cycle M 6.0000 1 0.00 +exampleBAM.bam 6 -52 Cycle M 6.0000 1 1.00 +exampleBAM.bam 6 -62 Cycle M 6.0000 1 0.00 +exampleBAM.bam 6 63 Cycle M 6.0000 1 0.00 +exampleBAM.bam 6 -63 Cycle M 6.0000 1 0.00 +exampleBAM.bam 6 -65 Cycle M 6.0000 1 0.00 +exampleBAM.bam 6 67 Cycle M 6.0000 1 0.00 +exampleBAM.bam 6 -68 Cycle M 6.0000 1 1.00 +exampleBAM.bam 6 75 Cycle M 6.0000 1 0.00 +exampleBAM.bam 8 17 Cycle M 8.0000 1 0.00 +exampleBAM.bam 8 46 Cycle M 8.0000 1 0.00 +exampleBAM.bam 8 57 Cycle M 8.0000 1 1.00 +exampleBAM.bam 8 58 Cycle M 8.0000 1 0.00 +exampleBAM.bam 8 60 Cycle M 8.0000 1 0.00 +exampleBAM.bam 8 63 Cycle M 8.0000 1 0.00 +exampleBAM.bam 8 71 Cycle M 8.0000 1 0.00 +exampleBAM.bam 9 -16 Cycle M 9.0000 1 0.00 +exampleBAM.bam 9 38 Cycle M 9.0000 1 0.00 +exampleBAM.bam 9 52 Cycle M 9.0000 1 0.00 +exampleBAM.bam 9 69 Cycle M 9.0000 1 0.00 +exampleBAM.bam 10 -75 Cycle M 10.0000 1 0.00 +exampleBAM.bam 11 -20 Cycle M 11.0000 1 0.00 +exampleBAM.bam 11 -40 Cycle M 11.0000 1 1.00 +exampleBAM.bam 12 25 Cycle M 12.0000 1 0.00 +exampleBAM.bam 12 40 Cycle M 12.0000 1 0.00 +exampleBAM.bam 12 62 Cycle M 12.0000 1 0.00 +exampleBAM.bam 12 68 Cycle M 12.0000 1 0.00 +exampleBAM.bam 13 39 Cycle M 13.0000 1 0.00 +exampleBAM.bam 13 55 Cycle M 13.0000 1 0.00 +exampleBAM.bam 13 75 Cycle M 13.0000 1 0.00 +exampleBAM.bam 14 -33 Cycle M 14.0000 1 0.00 +exampleBAM.bam 15 -8 Cycle M 15.0000 1 0.00 +exampleBAM.bam 15 -14 Cycle M 15.0000 1 0.00 +exampleBAM.bam 15 35 Cycle M 15.0000 1 0.00 +exampleBAM.bam 15 68 Cycle M 15.0000 1 0.00 +exampleBAM.bam 15 74 Cycle M 15.0000 1 0.00 +exampleBAM.bam 16 7 Cycle M 16.0000 1 0.00 +exampleBAM.bam 16 19 Cycle M 16.0000 1 0.00 +exampleBAM.bam 16 -34 Cycle M 16.0000 1 1.00 +exampleBAM.bam 16 -47 Cycle M 16.0000 1 0.00 +exampleBAM.bam 16 51 Cycle M 16.0000 1 0.00 +exampleBAM.bam 16 -55 Cycle M 16.0000 1 0.00 +exampleBAM.bam 16 -58 Cycle M 16.0000 1 0.00 +exampleBAM.bam 16 -65 Cycle M 16.0000 1 0.00 +exampleBAM.bam 16 70 Cycle M 16.0000 1 0.00 +exampleBAM.bam 16 73 Cycle M 16.0000 1 0.00 +exampleBAM.bam 17 -4 Cycle M 17.0000 1 0.00 +exampleBAM.bam 17 -20 Cycle M 17.0000 1 0.00 +exampleBAM.bam 17 58 Cycle M 17.0000 1 0.00 +exampleBAM.bam 17 62 Cycle M 17.0000 1 0.00 +exampleBAM.bam 17 -63 Cycle M 17.0000 1 0.00 +exampleBAM.bam 17 -76 Cycle M 17.0000 1 1.00 +exampleBAM.bam 18 -1 Cycle M 18.0000 1 0.00 +exampleBAM.bam 18 10 Cycle M 18.0000 1 0.00 +exampleBAM.bam 18 -19 Cycle M 18.0000 1 0.00 +exampleBAM.bam 18 22 Cycle M 18.0000 1 0.00 +exampleBAM.bam 18 36 Cycle M 18.0000 1 0.00 +exampleBAM.bam 18 -56 Cycle M 18.0000 1 0.00 +exampleBAM.bam 18 -58 Cycle M 18.0000 1 1.00 +exampleBAM.bam 19 5 Cycle M 19.0000 1 0.00 +exampleBAM.bam 19 -7 Cycle M 19.0000 1 0.00 +exampleBAM.bam 19 10 Cycle M 19.0000 1 0.00 +exampleBAM.bam 19 21 Cycle M 19.0000 2 0.00 +exampleBAM.bam 19 -30 Cycle M 19.0000 1 0.00 +exampleBAM.bam 19 32 Cycle M 19.0000 1 0.00 +exampleBAM.bam 19 33 Cycle M 19.0000 1 0.00 +exampleBAM.bam 19 49 Cycle M 19.0000 1 0.00 +exampleBAM.bam 19 54 Cycle M 19.0000 1 0.00 +exampleBAM.bam 19 61 Cycle M 19.0000 1 0.00 +exampleBAM.bam 19 65 Cycle M 19.0000 1 0.00 +exampleBAM.bam 19 -70 Cycle M 19.0000 1 1.00 +exampleBAM.bam 19 -71 Cycle M 19.0000 1 0.00 +exampleBAM.bam 19 72 Cycle M 19.0000 1 0.00 +exampleBAM.bam 20 9 Cycle M 20.0000 1 0.00 +exampleBAM.bam 20 -28 Cycle M 20.0000 1 1.00 +exampleBAM.bam 20 -29 Cycle M 20.0000 1 0.00 +exampleBAM.bam 20 -57 Cycle M 20.0000 1 0.00 +exampleBAM.bam 20 69 Cycle M 20.0000 1 0.00 +exampleBAM.bam 21 -3 Cycle M 21.0000 1 0.00 +exampleBAM.bam 21 11 Cycle M 21.0000 1 0.00 +exampleBAM.bam 21 17 Cycle M 21.0000 1 0.00 +exampleBAM.bam 21 29 Cycle M 21.0000 1 0.00 +exampleBAM.bam 21 -42 Cycle M 21.0000 1 0.00 +exampleBAM.bam 21 -44 Cycle M 21.0000 1 0.00 +exampleBAM.bam 21 48 Cycle M 21.0000 1 0.00 +exampleBAM.bam 21 -50 Cycle M 21.0000 1 0.00 +exampleBAM.bam 21 59 Cycle M 21.0000 1 0.00 +exampleBAM.bam 21 -60 Cycle M 21.0000 1 0.00 +exampleBAM.bam 21 -61 Cycle M 21.0000 1 0.00 +exampleBAM.bam 21 64 Cycle M 21.0000 1 0.00 +exampleBAM.bam 21 66 Cycle M 21.0000 1 0.00 +exampleBAM.bam 21 67 Cycle M 21.0000 1 0.00 +exampleBAM.bam 21 71 Cycle M 21.0000 1 0.00 +exampleBAM.bam 21 73 Cycle M 21.0000 1 0.00 +exampleBAM.bam 21 74 Cycle M 21.0000 1 0.00 +exampleBAM.bam 22 -9 Cycle M 22.0000 1 0.00 +exampleBAM.bam 22 -15 Cycle M 22.0000 1 0.00 +exampleBAM.bam 22 -23 Cycle M 22.0000 1 0.00 +exampleBAM.bam 22 38 Cycle M 22.0000 1 0.00 +exampleBAM.bam 22 44 Cycle M 22.0000 1 0.00 +exampleBAM.bam 22 -44 Cycle M 22.0000 1 0.00 +exampleBAM.bam 22 51 Cycle M 22.0000 1 0.00 +exampleBAM.bam 22 -59 Cycle M 22.0000 1 0.00 +exampleBAM.bam 22 -70 Cycle M 22.0000 1 0.00 +exampleBAM.bam 23 -12 Cycle M 23.0000 1 0.00 +exampleBAM.bam 23 -15 Cycle M 23.0000 1 0.00 +exampleBAM.bam 23 18 Cycle M 23.0000 1 0.00 +exampleBAM.bam 23 19 Cycle M 23.0000 1 0.00 +exampleBAM.bam 23 -35 Cycle M 23.0000 1 0.00 +exampleBAM.bam 23 37 Cycle M 23.0000 1 0.00 +exampleBAM.bam 23 -38 Cycle M 23.0000 1 0.00 +exampleBAM.bam 23 56 Cycle M 23.0000 1 0.00 +exampleBAM.bam 23 59 Cycle M 23.0000 1 0.00 +exampleBAM.bam 23 61 Cycle M 23.0000 1 0.00 +exampleBAM.bam 23 64 Cycle M 23.0000 1 0.00 +exampleBAM.bam 23 -64 Cycle M 23.0000 1 0.00 +exampleBAM.bam 23 66 Cycle M 23.0000 1 0.00 +exampleBAM.bam 23 -67 Cycle M 23.0000 1 0.00 +exampleBAM.bam 23 -75 Cycle M 23.0000 1 0.00 +exampleBAM.bam 24 3 Cycle M 24.0000 1 0.00 +exampleBAM.bam 24 5 Cycle M 24.0000 1 0.00 +exampleBAM.bam 24 6 Cycle M 24.0000 1 0.00 +exampleBAM.bam 24 -6 Cycle M 24.0000 1 0.00 +exampleBAM.bam 24 -10 Cycle M 24.0000 1 1.00 +exampleBAM.bam 24 13 Cycle M 24.0000 2 0.00 +exampleBAM.bam 24 -13 Cycle M 24.0000 1 0.00 +exampleBAM.bam 24 -25 Cycle M 24.0000 1 0.00 +exampleBAM.bam 24 27 Cycle M 24.0000 1 0.00 +exampleBAM.bam 24 33 Cycle M 24.0000 1 0.00 +exampleBAM.bam 24 41 Cycle M 24.0000 1 0.00 +exampleBAM.bam 24 45 Cycle M 24.0000 1 0.00 +exampleBAM.bam 24 -48 Cycle M 24.0000 1 0.00 +exampleBAM.bam 24 -49 Cycle M 24.0000 1 0.00 +exampleBAM.bam 24 50 Cycle M 24.0000 1 0.00 +exampleBAM.bam 24 52 Cycle M 24.0000 1 0.00 +exampleBAM.bam 24 53 Cycle M 24.0000 1 0.00 +exampleBAM.bam 24 56 Cycle M 24.0000 1 0.00 +exampleBAM.bam 24 -62 Cycle M 24.0000 1 0.00 +exampleBAM.bam 25 -9 Cycle M 25.0000 1 0.00 +exampleBAM.bam 25 14 Cycle M 25.0000 1 0.00 +exampleBAM.bam 25 -21 Cycle M 25.0000 1 0.00 +exampleBAM.bam 25 -24 Cycle M 25.0000 1 0.00 +exampleBAM.bam 25 31 Cycle M 25.0000 1 0.00 +exampleBAM.bam 25 -32 Cycle M 25.0000 1 0.00 +exampleBAM.bam 25 -36 Cycle M 25.0000 1 0.00 +exampleBAM.bam 25 37 Cycle M 25.0000 1 0.00 +exampleBAM.bam 25 46 Cycle M 25.0000 1 0.00 +exampleBAM.bam 25 47 Cycle M 25.0000 1 0.00 +exampleBAM.bam 25 -51 Cycle M 25.0000 1 0.00 +exampleBAM.bam 25 -52 Cycle M 25.0000 1 0.00 +exampleBAM.bam 25 55 Cycle M 25.0000 1 0.00 +exampleBAM.bam 25 -73 Cycle M 25.0000 1 0.00 +exampleBAM.bam 25 -74 Cycle M 25.0000 1 0.00 +exampleBAM.bam 26 -3 Cycle M 26.0000 1 0.00 +exampleBAM.bam 26 7 Cycle M 26.0000 1 0.00 +exampleBAM.bam 26 20 Cycle M 26.0000 1 0.00 +exampleBAM.bam 26 -44 Cycle M 26.0000 1 0.00 +exampleBAM.bam 26 50 Cycle M 26.0000 1 0.00 +exampleBAM.bam 26 -67 Cycle M 26.0000 1 0.00 +exampleBAM.bam 27 11 Cycle M 27.0000 1 0.00 +exampleBAM.bam 27 14 Cycle M 27.0000 1 0.00 +exampleBAM.bam 27 16 Cycle M 27.0000 1 0.00 +exampleBAM.bam 27 -17 Cycle M 27.0000 1 0.00 +exampleBAM.bam 27 -18 Cycle M 27.0000 1 0.00 +exampleBAM.bam 27 22 Cycle M 27.0000 1 0.00 +exampleBAM.bam 27 -27 Cycle M 27.0000 1 0.00 +exampleBAM.bam 27 28 Cycle M 27.0000 1 0.00 +exampleBAM.bam 27 30 Cycle M 27.0000 1 0.00 +exampleBAM.bam 27 -31 Cycle M 27.0000 1 0.00 +exampleBAM.bam 27 40 Cycle M 27.0000 1 0.00 +exampleBAM.bam 27 53 Cycle M 27.0000 1 0.00 +exampleBAM.bam 27 -53 Cycle M 27.0000 1 0.00 +exampleBAM.bam 27 -55 Cycle M 27.0000 1 0.00 +exampleBAM.bam 27 -56 Cycle M 27.0000 1 0.00 +exampleBAM.bam 27 57 Cycle M 27.0000 1 0.00 +exampleBAM.bam 27 65 Cycle M 27.0000 1 0.00 +exampleBAM.bam 27 -66 Cycle M 27.0000 1 0.00 +exampleBAM.bam 27 -69 Cycle M 27.0000 1 0.00 +exampleBAM.bam 27 -72 Cycle M 27.0000 1 0.00 +exampleBAM.bam 27 -73 Cycle M 27.0000 1 0.00 +exampleBAM.bam 27 76 Cycle M 27.0000 1 0.00 +exampleBAM.bam 28 -2 Cycle M 28.0000 1 0.00 +exampleBAM.bam 28 -11 Cycle M 28.0000 1 0.00 +exampleBAM.bam 28 25 Cycle M 28.0000 1 0.00 +exampleBAM.bam 28 -27 Cycle M 28.0000 1 0.00 +exampleBAM.bam 28 30 Cycle M 28.0000 1 0.00 +exampleBAM.bam 28 34 Cycle M 28.0000 1 0.00 +exampleBAM.bam 28 39 Cycle M 28.0000 1 0.00 +exampleBAM.bam 28 -41 Cycle M 28.0000 1 0.00 +exampleBAM.bam 28 47 Cycle M 28.0000 1 0.00 +exampleBAM.bam 28 48 Cycle M 28.0000 1 0.00 +exampleBAM.bam 28 -50 Cycle M 28.0000 1 0.00 +exampleBAM.bam 28 -53 Cycle M 28.0000 1 0.00 +exampleBAM.bam 28 54 Cycle M 28.0000 1 0.00 +exampleBAM.bam 28 -61 Cycle M 28.0000 1 0.00 +exampleBAM.bam 28 -71 Cycle M 28.0000 1 0.00 +exampleBAM.bam 29 4 Cycle M 29.0000 1 0.00 +exampleBAM.bam 29 -5 Cycle M 29.0000 1 0.00 +exampleBAM.bam 29 6 Cycle M 29.0000 1 0.00 +exampleBAM.bam 29 -7 Cycle M 29.0000 1 0.00 +exampleBAM.bam 29 -8 Cycle M 29.0000 1 0.00 +exampleBAM.bam 29 9 Cycle M 29.0000 1 0.00 +exampleBAM.bam 29 12 Cycle M 29.0000 1 0.00 +exampleBAM.bam 29 -24 Cycle M 29.0000 1 0.00 +exampleBAM.bam 29 27 Cycle M 29.0000 1 0.00 +exampleBAM.bam 29 -28 Cycle M 29.0000 1 0.00 +exampleBAM.bam 29 -37 Cycle M 29.0000 1 0.00 +exampleBAM.bam 29 42 Cycle M 29.0000 1 0.00 +exampleBAM.bam 29 -43 Cycle M 29.0000 1 0.00 +exampleBAM.bam 29 -45 Cycle M 29.0000 1 0.00 +exampleBAM.bam 29 -47 Cycle M 29.0000 1 0.00 +exampleBAM.bam 29 -48 Cycle M 29.0000 1 0.00 +exampleBAM.bam 29 -54 Cycle M 29.0000 1 0.00 +exampleBAM.bam 29 -60 Cycle M 29.0000 1 0.00 +exampleBAM.bam 29 -68 Cycle M 29.0000 1 0.00 +exampleBAM.bam 29 -76 Cycle M 29.0000 1 0.00 +exampleBAM.bam 30 -9 Cycle M 30.0000 1 0.00 +exampleBAM.bam 30 12 Cycle M 30.0000 1 0.00 +exampleBAM.bam 30 -17 Cycle M 30.0000 2 0.00 +exampleBAM.bam 30 18 Cycle M 30.0000 1 0.00 +exampleBAM.bam 30 20 Cycle M 30.0000 1 0.00 +exampleBAM.bam 30 -21 Cycle M 30.0000 1 0.00 +exampleBAM.bam 30 23 Cycle M 30.0000 1 0.00 +exampleBAM.bam 30 24 Cycle M 30.0000 1 0.00 +exampleBAM.bam 30 26 Cycle M 30.0000 1 0.00 +exampleBAM.bam 30 -30 Cycle M 30.0000 1 0.00 +exampleBAM.bam 30 32 Cycle M 30.0000 1 0.00 +exampleBAM.bam 30 34 Cycle M 30.0000 1 0.00 +exampleBAM.bam 30 35 Cycle M 30.0000 1 0.00 +exampleBAM.bam 30 -35 Cycle M 30.0000 1 0.00 +exampleBAM.bam 30 -42 Cycle M 30.0000 1 0.00 +exampleBAM.bam 30 -45 Cycle M 30.0000 1 0.00 +exampleBAM.bam 30 -52 Cycle M 30.0000 1 0.00 +exampleBAM.bam 30 -54 Cycle M 30.0000 1 0.00 +exampleBAM.bam 30 -69 Cycle M 30.0000 1 0.00 +exampleBAM.bam 31 -1 Cycle M 31.0000 1 0.00 +exampleBAM.bam 31 4 Cycle M 31.0000 1 0.00 +exampleBAM.bam 31 -5 Cycle M 31.0000 1 0.00 +exampleBAM.bam 31 -6 Cycle M 31.0000 1 0.00 +exampleBAM.bam 31 8 Cycle M 31.0000 2 0.00 +exampleBAM.bam 31 -10 Cycle M 31.0000 1 0.00 +exampleBAM.bam 31 -11 Cycle M 31.0000 1 0.00 +exampleBAM.bam 31 -12 Cycle M 31.0000 1 0.00 +exampleBAM.bam 31 -13 Cycle M 31.0000 1 0.00 +exampleBAM.bam 31 15 Cycle M 31.0000 2 0.00 +exampleBAM.bam 31 -16 Cycle M 31.0000 1 0.00 +exampleBAM.bam 31 -19 Cycle M 31.0000 1 0.00 +exampleBAM.bam 31 -25 Cycle M 31.0000 1 0.00 +exampleBAM.bam 31 26 Cycle M 31.0000 1 0.00 +exampleBAM.bam 31 -26 Cycle M 31.0000 1 0.00 +exampleBAM.bam 31 -32 Cycle M 31.0000 1 0.00 +exampleBAM.bam 31 -34 Cycle M 31.0000 1 0.00 +exampleBAM.bam 31 -39 Cycle M 31.0000 2 0.00 +exampleBAM.bam 31 43 Cycle M 31.0000 1 0.00 +exampleBAM.bam 31 -45 Cycle M 31.0000 1 0.00 +exampleBAM.bam 31 60 Cycle M 31.0000 1 0.00 +exampleBAM.bam 31 -66 Cycle M 31.0000 1 0.00 +exampleBAM.bam 32 1 Cycle M 32.0000 1 0.00 +exampleBAM.bam 32 2 Cycle M 32.0000 1 0.00 +exampleBAM.bam 32 -2 Cycle M 32.0000 1 0.00 +exampleBAM.bam 32 -14 Cycle M 32.0000 2 0.00 +exampleBAM.bam 32 -15 Cycle M 32.0000 1 0.00 +exampleBAM.bam 32 16 Cycle M 32.0000 1 0.00 +exampleBAM.bam 32 -16 Cycle M 32.0000 1 0.00 +exampleBAM.bam 32 -18 Cycle M 32.0000 1 0.00 +exampleBAM.bam 32 -19 Cycle M 32.0000 1 0.00 +exampleBAM.bam 32 23 Cycle M 32.0000 1 0.00 +exampleBAM.bam 32 24 Cycle M 32.0000 1 0.00 +exampleBAM.bam 32 28 Cycle M 32.0000 1 0.00 +exampleBAM.bam 32 -28 Cycle M 32.0000 1 0.00 +exampleBAM.bam 32 -30 Cycle M 32.0000 1 0.00 +exampleBAM.bam 32 -31 Cycle M 32.0000 1 0.00 +exampleBAM.bam 32 -33 Cycle M 32.0000 2 0.00 +exampleBAM.bam 32 -36 Cycle M 32.0000 2 0.00 +exampleBAM.bam 32 41 Cycle M 32.0000 1 0.00 +exampleBAM.bam 32 -41 Cycle M 32.0000 1 0.00 +exampleBAM.bam 32 43 Cycle M 32.0000 1 0.00 +exampleBAM.bam 32 -43 Cycle M 32.0000 2 0.00 +exampleBAM.bam 32 -46 Cycle M 32.0000 1 0.00 +exampleBAM.bam 32 -49 Cycle M 32.0000 1 0.00 +exampleBAM.bam 32 -51 Cycle M 32.0000 1 0.00 +exampleBAM.bam 32 -53 Cycle M 32.0000 1 0.00 +exampleBAM.bam 32 -54 Cycle M 32.0000 1 0.00 +exampleBAM.bam 32 -57 Cycle M 32.0000 1 0.00 +exampleBAM.bam 32 -72 Cycle M 32.0000 1 0.00 +exampleBAM.bam 33 1 Cycle M 33.0000 1 0.00 +exampleBAM.bam 33 -1 Cycle M 33.0000 1 0.00 +exampleBAM.bam 33 2 Cycle M 33.0000 1 0.00 +exampleBAM.bam 33 3 Cycle M 33.0000 1 0.00 +exampleBAM.bam 33 -7 Cycle M 33.0000 1 0.00 +exampleBAM.bam 33 -8 Cycle M 33.0000 1 0.00 +exampleBAM.bam 33 -10 Cycle M 33.0000 1 0.00 +exampleBAM.bam 33 -12 Cycle M 33.0000 1 0.00 +exampleBAM.bam 33 -18 Cycle M 33.0000 1 0.00 +exampleBAM.bam 33 -22 Cycle M 33.0000 2 0.00 +exampleBAM.bam 33 -23 Cycle M 33.0000 1 0.00 +exampleBAM.bam 33 -24 Cycle M 33.0000 1 0.00 +exampleBAM.bam 33 -29 Cycle M 33.0000 2 0.00 +exampleBAM.bam 33 -31 Cycle M 33.0000 1 0.00 +exampleBAM.bam 33 -32 Cycle M 33.0000 1 0.00 +exampleBAM.bam 33 -35 Cycle M 33.0000 1 0.00 +exampleBAM.bam 33 -37 Cycle M 33.0000 1 0.00 +exampleBAM.bam 33 -39 Cycle M 33.0000 1 0.00 +exampleBAM.bam 33 -40 Cycle M 33.0000 1 0.00 +exampleBAM.bam 33 42 Cycle M 33.0000 1 0.00 +exampleBAM.bam 33 44 Cycle M 33.0000 1 0.00 +exampleBAM.bam 33 45 Cycle M 33.0000 1 0.00 +exampleBAM.bam 33 -46 Cycle M 33.0000 1 0.00 +exampleBAM.bam 33 -48 Cycle M 33.0000 1 0.00 +exampleBAM.bam 33 -49 Cycle M 33.0000 1 0.00 +exampleBAM.bam 33 -57 Cycle M 33.0000 1 0.00 +exampleBAM.bam 33 -59 Cycle M 33.0000 1 0.00 +exampleBAM.bam 33 -66 Cycle M 33.0000 1 0.00 +exampleBAM.bam 33 -67 Cycle M 33.0000 1 0.00 +exampleBAM.bam 33 -69 Cycle M 33.0000 1 0.00 +exampleBAM.bam 33 -72 Cycle M 33.0000 1 0.00 +exampleBAM.bam 33 -73 Cycle M 33.0000 1 0.00 +exampleBAM.bam 33 -76 Cycle M 33.0000 1 0.00 +exampleBAM.bam 34 -2 Cycle M 34.0000 1 0.00 +exampleBAM.bam 34 -3 Cycle M 34.0000 1 0.00 +exampleBAM.bam 34 -4 Cycle M 34.0000 1 0.00 +exampleBAM.bam 34 -5 Cycle M 34.0000 1 0.00 +exampleBAM.bam 34 -6 Cycle M 34.0000 1 0.00 +exampleBAM.bam 34 -11 Cycle M 34.0000 1 0.00 +exampleBAM.bam 34 -13 Cycle M 34.0000 1 0.00 +exampleBAM.bam 34 -20 Cycle M 34.0000 1 0.00 +exampleBAM.bam 34 -21 Cycle M 34.0000 1 0.00 +exampleBAM.bam 34 -23 Cycle M 34.0000 1 0.00 +exampleBAM.bam 34 -25 Cycle M 34.0000 1 0.00 +exampleBAM.bam 34 -26 Cycle M 34.0000 1 0.00 +exampleBAM.bam 34 -27 Cycle M 34.0000 1 0.00 +exampleBAM.bam 34 -34 Cycle M 34.0000 1 0.00 +exampleBAM.bam 34 -38 Cycle M 34.0000 1 0.00 +exampleBAM.bam 34 -40 Cycle M 34.0000 1 0.00 +exampleBAM.bam 34 -41 Cycle M 34.0000 1 0.00 +exampleBAM.bam 34 -42 Cycle M 34.0000 1 0.00 +exampleBAM.bam 34 -47 Cycle M 34.0000 1 0.00 +exampleBAM.bam 34 -50 Cycle M 34.0000 1 0.00 +exampleBAM.bam 34 -51 Cycle M 34.0000 1 0.00 +exampleBAM.bam 34 -55 Cycle M 34.0000 1 0.00 +exampleBAM.bam 34 -56 Cycle M 34.0000 1 0.00 +exampleBAM.bam 34 -58 Cycle M 34.0000 1 0.00 +exampleBAM.bam 34 -59 Cycle M 34.0000 1 0.00 +exampleBAM.bam 34 -60 Cycle M 34.0000 1 0.00 +exampleBAM.bam 34 -61 Cycle M 34.0000 1 0.00 +exampleBAM.bam 34 -62 Cycle M 34.0000 1 0.00 +exampleBAM.bam 34 -63 Cycle M 34.0000 1 0.00 +exampleBAM.bam 34 -64 Cycle M 34.0000 1 0.00 +exampleBAM.bam 34 -65 Cycle M 34.0000 1 0.00 +exampleBAM.bam 34 -68 Cycle M 34.0000 1 0.00 +exampleBAM.bam 34 -70 Cycle M 34.0000 1 0.00 +exampleBAM.bam 34 -71 Cycle M 34.0000 1 0.00 +exampleBAM.bam 34 -74 Cycle M 34.0000 1 0.00 +exampleBAM.bam 34 -75 Cycle M 34.0000 1 0.00 +exampleBAM.bam 45 5 Cycle I 45.0000 2 0.00 +exampleBAM.bam 45 5 Cycle D 45.0000 2 0.00 +exampleBAM.bam 45 -5 Cycle I 45.0000 3 0.00 +exampleBAM.bam 45 -5 Cycle D 45.0000 3 0.00 +exampleBAM.bam 45 6 Cycle I 45.0000 2 0.00 +exampleBAM.bam 45 6 Cycle D 45.0000 2 0.00 +exampleBAM.bam 45 -6 Cycle I 45.0000 3 0.00 +exampleBAM.bam 45 -6 Cycle D 45.0000 3 0.00 +exampleBAM.bam 45 7 Cycle I 45.0000 2 0.00 +exampleBAM.bam 45 7 Cycle D 45.0000 2 0.00 +exampleBAM.bam 45 -7 Cycle I 45.0000 3 0.00 +exampleBAM.bam 45 -7 Cycle D 45.0000 3 0.00 +exampleBAM.bam 45 8 Cycle I 45.0000 2 0.00 +exampleBAM.bam 45 8 Cycle D 45.0000 2 0.00 +exampleBAM.bam 45 -8 Cycle I 45.0000 3 0.00 +exampleBAM.bam 45 -8 Cycle D 45.0000 3 0.00 +exampleBAM.bam 45 9 Cycle I 45.0000 2 0.00 +exampleBAM.bam 45 9 Cycle D 45.0000 2 0.00 +exampleBAM.bam 45 -9 Cycle I 45.0000 3 0.00 +exampleBAM.bam 45 -9 Cycle D 45.0000 3 0.00 +exampleBAM.bam 45 10 Cycle I 45.0000 2 0.00 +exampleBAM.bam 45 10 Cycle D 45.0000 2 0.00 +exampleBAM.bam 45 -10 Cycle I 45.0000 3 0.00 +exampleBAM.bam 45 -10 Cycle D 45.0000 3 0.00 +exampleBAM.bam 45 11 Cycle I 45.0000 2 0.00 +exampleBAM.bam 45 11 Cycle D 45.0000 2 0.00 +exampleBAM.bam 45 -11 Cycle I 45.0000 3 0.00 +exampleBAM.bam 45 -11 Cycle D 45.0000 3 0.00 +exampleBAM.bam 45 12 Cycle I 45.0000 2 0.00 +exampleBAM.bam 45 12 Cycle D 45.0000 2 0.00 +exampleBAM.bam 45 -12 Cycle I 45.0000 3 0.00 +exampleBAM.bam 45 -12 Cycle D 45.0000 3 0.00 +exampleBAM.bam 45 13 Cycle I 45.0000 2 0.00 +exampleBAM.bam 45 13 Cycle D 45.0000 2 0.00 +exampleBAM.bam 45 -13 Cycle I 45.0000 3 0.00 +exampleBAM.bam 45 -13 Cycle D 45.0000 3 0.00 +exampleBAM.bam 45 14 Cycle I 45.0000 2 0.00 +exampleBAM.bam 45 14 Cycle D 45.0000 2 0.00 +exampleBAM.bam 45 -14 Cycle I 45.0000 3 0.00 +exampleBAM.bam 45 -14 Cycle D 45.0000 3 0.00 +exampleBAM.bam 45 15 Cycle I 45.0000 2 0.00 +exampleBAM.bam 45 15 Cycle D 45.0000 2 0.00 +exampleBAM.bam 45 -15 Cycle I 45.0000 3 0.00 +exampleBAM.bam 45 -15 Cycle D 45.0000 3 0.00 +exampleBAM.bam 45 16 Cycle I 45.0000 2 0.00 +exampleBAM.bam 45 16 Cycle D 45.0000 2 0.00 +exampleBAM.bam 45 -16 Cycle I 45.0000 3 0.00 +exampleBAM.bam 45 -16 Cycle D 45.0000 3 0.00 +exampleBAM.bam 45 17 Cycle I 45.0000 2 0.00 +exampleBAM.bam 45 17 Cycle D 45.0000 2 0.00 +exampleBAM.bam 45 -17 Cycle I 45.0000 3 0.00 +exampleBAM.bam 45 -17 Cycle D 45.0000 3 0.00 +exampleBAM.bam 45 18 Cycle I 45.0000 2 0.00 +exampleBAM.bam 45 18 Cycle D 45.0000 2 0.00 +exampleBAM.bam 45 -18 Cycle I 45.0000 3 0.00 +exampleBAM.bam 45 -18 Cycle D 45.0000 3 0.00 +exampleBAM.bam 45 19 Cycle I 45.0000 2 0.00 +exampleBAM.bam 45 19 Cycle D 45.0000 2 0.00 +exampleBAM.bam 45 -19 Cycle I 45.0000 3 0.00 +exampleBAM.bam 45 -19 Cycle D 45.0000 3 0.00 +exampleBAM.bam 45 20 Cycle I 45.0000 2 0.00 +exampleBAM.bam 45 20 Cycle D 45.0000 2 0.00 +exampleBAM.bam 45 -20 Cycle I 45.0000 3 0.00 +exampleBAM.bam 45 -20 Cycle D 45.0000 3 0.00 +exampleBAM.bam 45 21 Cycle I 45.0000 2 0.00 +exampleBAM.bam 45 21 Cycle D 45.0000 2 0.00 +exampleBAM.bam 45 -21 Cycle I 45.0000 3 0.00 +exampleBAM.bam 45 -21 Cycle D 45.0000 3 0.00 +exampleBAM.bam 45 22 Cycle I 45.0000 2 0.00 +exampleBAM.bam 45 22 Cycle D 45.0000 2 0.00 +exampleBAM.bam 45 -22 Cycle I 45.0000 2 0.00 +exampleBAM.bam 45 -22 Cycle D 45.0000 2 0.00 +exampleBAM.bam 45 23 Cycle I 45.0000 2 0.00 +exampleBAM.bam 45 23 Cycle D 45.0000 2 0.00 +exampleBAM.bam 45 -23 Cycle I 45.0000 3 0.00 +exampleBAM.bam 45 -23 Cycle D 45.0000 3 0.00 +exampleBAM.bam 45 24 Cycle I 45.0000 2 0.00 +exampleBAM.bam 45 24 Cycle D 45.0000 2 0.00 +exampleBAM.bam 45 -24 Cycle I 45.0000 3 0.00 +exampleBAM.bam 45 -24 Cycle D 45.0000 3 0.00 +exampleBAM.bam 45 25 Cycle I 45.0000 2 0.00 +exampleBAM.bam 45 25 Cycle D 45.0000 2 0.00 +exampleBAM.bam 45 -25 Cycle I 45.0000 3 0.00 +exampleBAM.bam 45 -25 Cycle D 45.0000 3 0.00 +exampleBAM.bam 45 26 Cycle I 45.0000 2 0.00 +exampleBAM.bam 45 26 Cycle D 45.0000 2 0.00 +exampleBAM.bam 45 -26 Cycle I 45.0000 2 0.00 +exampleBAM.bam 45 -26 Cycle D 45.0000 2 0.00 +exampleBAM.bam 45 27 Cycle I 45.0000 2 0.00 +exampleBAM.bam 45 27 Cycle D 45.0000 2 0.00 +exampleBAM.bam 45 -27 Cycle I 45.0000 3 0.00 +exampleBAM.bam 45 -27 Cycle D 45.0000 3 0.00 +exampleBAM.bam 45 28 Cycle I 45.0000 2 0.00 +exampleBAM.bam 45 28 Cycle D 45.0000 2 0.00 +exampleBAM.bam 45 -28 Cycle I 45.0000 3 0.00 +exampleBAM.bam 45 -28 Cycle D 45.0000 3 0.00 +exampleBAM.bam 45 29 Cycle I 45.0000 1 0.00 +exampleBAM.bam 45 29 Cycle D 45.0000 1 0.00 +exampleBAM.bam 45 -29 Cycle I 45.0000 3 0.00 +exampleBAM.bam 45 -29 Cycle D 45.0000 3 0.00 +exampleBAM.bam 45 30 Cycle I 45.0000 2 0.00 +exampleBAM.bam 45 30 Cycle D 45.0000 2 0.00 +exampleBAM.bam 45 -30 Cycle I 45.0000 3 0.00 +exampleBAM.bam 45 -30 Cycle D 45.0000 3 0.00 +exampleBAM.bam 45 31 Cycle I 45.0000 2 0.00 +exampleBAM.bam 45 31 Cycle D 45.0000 2 0.00 +exampleBAM.bam 45 -31 Cycle I 45.0000 3 0.00 +exampleBAM.bam 45 -31 Cycle D 45.0000 3 0.00 +exampleBAM.bam 45 32 Cycle I 45.0000 2 0.00 +exampleBAM.bam 45 32 Cycle D 45.0000 2 0.00 +exampleBAM.bam 45 -32 Cycle I 45.0000 3 0.00 +exampleBAM.bam 45 -32 Cycle D 45.0000 3 0.00 +exampleBAM.bam 45 33 Cycle I 45.0000 2 0.00 +exampleBAM.bam 45 33 Cycle D 45.0000 2 0.00 +exampleBAM.bam 45 -33 Cycle I 45.0000 3 0.00 +exampleBAM.bam 45 -33 Cycle D 45.0000 3 0.00 +exampleBAM.bam 45 34 Cycle I 45.0000 2 0.00 +exampleBAM.bam 45 34 Cycle D 45.0000 2 0.00 +exampleBAM.bam 45 -34 Cycle I 45.0000 3 0.00 +exampleBAM.bam 45 -34 Cycle D 45.0000 3 0.00 +exampleBAM.bam 45 35 Cycle I 45.0000 2 0.00 +exampleBAM.bam 45 35 Cycle D 45.0000 2 0.00 +exampleBAM.bam 45 -35 Cycle I 45.0000 3 0.00 +exampleBAM.bam 45 -35 Cycle D 45.0000 3 0.00 +exampleBAM.bam 45 36 Cycle I 45.0000 2 0.00 +exampleBAM.bam 45 36 Cycle D 45.0000 2 0.00 +exampleBAM.bam 45 -36 Cycle I 45.0000 3 0.00 +exampleBAM.bam 45 -36 Cycle D 45.0000 3 0.00 +exampleBAM.bam 45 37 Cycle I 45.0000 2 0.00 +exampleBAM.bam 45 37 Cycle D 45.0000 2 0.00 +exampleBAM.bam 45 -37 Cycle I 45.0000 2 0.00 +exampleBAM.bam 45 -37 Cycle D 45.0000 2 0.00 +exampleBAM.bam 45 38 Cycle I 45.0000 2 0.00 +exampleBAM.bam 45 38 Cycle D 45.0000 2 0.00 +exampleBAM.bam 45 -38 Cycle I 45.0000 2 0.00 +exampleBAM.bam 45 -38 Cycle D 45.0000 2 0.00 +exampleBAM.bam 45 39 Cycle I 45.0000 2 0.00 +exampleBAM.bam 45 39 Cycle D 45.0000 2 0.00 +exampleBAM.bam 45 -39 Cycle I 45.0000 3 0.00 +exampleBAM.bam 45 -39 Cycle D 45.0000 3 0.00 +exampleBAM.bam 45 40 Cycle I 45.0000 2 0.00 +exampleBAM.bam 45 40 Cycle D 45.0000 2 0.00 +exampleBAM.bam 45 -40 Cycle I 45.0000 3 0.00 +exampleBAM.bam 45 -40 Cycle D 45.0000 3 0.00 +exampleBAM.bam 45 41 Cycle I 45.0000 2 0.00 +exampleBAM.bam 45 41 Cycle D 45.0000 2 0.00 +exampleBAM.bam 45 -41 Cycle I 45.0000 3 0.00 +exampleBAM.bam 45 -41 Cycle D 45.0000 3 0.00 +exampleBAM.bam 45 42 Cycle I 45.0000 2 0.00 +exampleBAM.bam 45 42 Cycle D 45.0000 2 0.00 +exampleBAM.bam 45 -42 Cycle I 45.0000 3 0.00 +exampleBAM.bam 45 -42 Cycle D 45.0000 3 0.00 +exampleBAM.bam 45 43 Cycle I 45.0000 2 0.00 +exampleBAM.bam 45 43 Cycle D 45.0000 2 0.00 +exampleBAM.bam 45 -43 Cycle I 45.0000 3 0.00 +exampleBAM.bam 45 -43 Cycle D 45.0000 3 0.00 +exampleBAM.bam 45 44 Cycle I 45.0000 2 0.00 +exampleBAM.bam 45 44 Cycle D 45.0000 2 0.00 +exampleBAM.bam 45 -44 Cycle I 45.0000 3 0.00 +exampleBAM.bam 45 -44 Cycle D 45.0000 3 0.00 +exampleBAM.bam 45 45 Cycle I 45.0000 2 0.00 +exampleBAM.bam 45 45 Cycle D 45.0000 2 0.00 +exampleBAM.bam 45 -45 Cycle I 45.0000 3 0.00 +exampleBAM.bam 45 -45 Cycle D 45.0000 3 0.00 +exampleBAM.bam 45 46 Cycle I 45.0000 2 0.00 +exampleBAM.bam 45 46 Cycle D 45.0000 2 0.00 +exampleBAM.bam 45 -46 Cycle I 45.0000 2 0.00 +exampleBAM.bam 45 -46 Cycle D 45.0000 2 0.00 +exampleBAM.bam 45 47 Cycle I 45.0000 2 0.00 +exampleBAM.bam 45 47 Cycle D 45.0000 2 0.00 +exampleBAM.bam 45 -47 Cycle I 45.0000 3 0.00 +exampleBAM.bam 45 -47 Cycle D 45.0000 3 0.00 +exampleBAM.bam 45 48 Cycle I 45.0000 2 0.00 +exampleBAM.bam 45 48 Cycle D 45.0000 2 0.00 +exampleBAM.bam 45 -48 Cycle I 45.0000 3 0.00 +exampleBAM.bam 45 -48 Cycle D 45.0000 3 0.00 +exampleBAM.bam 45 49 Cycle I 45.0000 1 0.00 +exampleBAM.bam 45 49 Cycle D 45.0000 1 0.00 +exampleBAM.bam 45 -49 Cycle I 45.0000 3 0.00 +exampleBAM.bam 45 -49 Cycle D 45.0000 3 0.00 +exampleBAM.bam 45 50 Cycle I 45.0000 2 0.00 +exampleBAM.bam 45 50 Cycle D 45.0000 2 0.00 +exampleBAM.bam 45 -50 Cycle I 45.0000 3 0.00 +exampleBAM.bam 45 -50 Cycle D 45.0000 3 0.00 +exampleBAM.bam 45 51 Cycle I 45.0000 2 0.00 +exampleBAM.bam 45 51 Cycle D 45.0000 2 0.00 +exampleBAM.bam 45 -51 Cycle I 45.0000 3 0.00 +exampleBAM.bam 45 -51 Cycle D 45.0000 3 0.00 +exampleBAM.bam 45 52 Cycle I 45.0000 2 0.00 +exampleBAM.bam 45 52 Cycle D 45.0000 2 0.00 +exampleBAM.bam 45 -52 Cycle I 45.0000 3 0.00 +exampleBAM.bam 45 -52 Cycle D 45.0000 3 0.00 +exampleBAM.bam 45 53 Cycle I 45.0000 2 0.00 +exampleBAM.bam 45 53 Cycle D 45.0000 2 0.00 +exampleBAM.bam 45 -53 Cycle I 45.0000 3 0.00 +exampleBAM.bam 45 -53 Cycle D 45.0000 3 0.00 +exampleBAM.bam 45 54 Cycle I 45.0000 2 0.00 +exampleBAM.bam 45 54 Cycle D 45.0000 2 0.00 +exampleBAM.bam 45 -54 Cycle I 45.0000 3 0.00 +exampleBAM.bam 45 -54 Cycle D 45.0000 3 0.00 +exampleBAM.bam 45 55 Cycle I 45.0000 2 0.00 +exampleBAM.bam 45 55 Cycle D 45.0000 2 0.00 +exampleBAM.bam 45 -55 Cycle I 45.0000 3 0.00 +exampleBAM.bam 45 -55 Cycle D 45.0000 3 0.00 +exampleBAM.bam 45 56 Cycle I 45.0000 2 0.00 +exampleBAM.bam 45 56 Cycle D 45.0000 2 0.00 +exampleBAM.bam 45 -56 Cycle I 45.0000 3 0.00 +exampleBAM.bam 45 -56 Cycle D 45.0000 3 0.00 +exampleBAM.bam 45 57 Cycle I 45.0000 2 0.00 +exampleBAM.bam 45 57 Cycle D 45.0000 2 0.00 +exampleBAM.bam 45 -57 Cycle I 45.0000 3 0.00 +exampleBAM.bam 45 -57 Cycle D 45.0000 3 0.00 +exampleBAM.bam 45 58 Cycle I 45.0000 2 0.00 +exampleBAM.bam 45 58 Cycle D 45.0000 2 0.00 +exampleBAM.bam 45 -58 Cycle I 45.0000 3 0.00 +exampleBAM.bam 45 -58 Cycle D 45.0000 3 0.00 +exampleBAM.bam 45 59 Cycle I 45.0000 2 0.00 +exampleBAM.bam 45 59 Cycle D 45.0000 2 0.00 +exampleBAM.bam 45 -59 Cycle I 45.0000 3 0.00 +exampleBAM.bam 45 -59 Cycle D 45.0000 3 0.00 +exampleBAM.bam 45 60 Cycle I 45.0000 2 0.00 +exampleBAM.bam 45 60 Cycle D 45.0000 2 0.00 +exampleBAM.bam 45 -60 Cycle I 45.0000 3 0.00 +exampleBAM.bam 45 -60 Cycle D 45.0000 3 0.00 +exampleBAM.bam 45 61 Cycle I 45.0000 2 0.00 +exampleBAM.bam 45 61 Cycle D 45.0000 2 0.00 +exampleBAM.bam 45 -61 Cycle I 45.0000 3 0.00 +exampleBAM.bam 45 -61 Cycle D 45.0000 3 0.00 +exampleBAM.bam 45 62 Cycle I 45.0000 2 0.00 +exampleBAM.bam 45 62 Cycle D 45.0000 2 0.00 +exampleBAM.bam 45 -62 Cycle I 45.0000 3 0.00 +exampleBAM.bam 45 -62 Cycle D 45.0000 3 0.00 +exampleBAM.bam 45 63 Cycle I 45.0000 2 0.00 +exampleBAM.bam 45 63 Cycle D 45.0000 2 0.00 +exampleBAM.bam 45 -63 Cycle I 45.0000 3 0.00 +exampleBAM.bam 45 -63 Cycle D 45.0000 3 0.00 +exampleBAM.bam 45 64 Cycle I 45.0000 2 0.00 +exampleBAM.bam 45 64 Cycle D 45.0000 2 0.00 +exampleBAM.bam 45 -64 Cycle I 45.0000 2 0.00 +exampleBAM.bam 45 -64 Cycle D 45.0000 2 0.00 +exampleBAM.bam 45 65 Cycle I 45.0000 2 0.00 +exampleBAM.bam 45 65 Cycle D 45.0000 2 0.00 +exampleBAM.bam 45 -65 Cycle I 45.0000 3 0.00 +exampleBAM.bam 45 -65 Cycle D 45.0000 3 0.00 +exampleBAM.bam 45 66 Cycle I 45.0000 2 0.00 +exampleBAM.bam 45 66 Cycle D 45.0000 2 0.00 +exampleBAM.bam 45 -66 Cycle I 45.0000 3 0.00 +exampleBAM.bam 45 -66 Cycle D 45.0000 3 0.00 +exampleBAM.bam 45 67 Cycle I 45.0000 2 0.00 +exampleBAM.bam 45 67 Cycle D 45.0000 2 0.00 +exampleBAM.bam 45 -67 Cycle I 45.0000 3 0.00 +exampleBAM.bam 45 -67 Cycle D 45.0000 3 0.00 +exampleBAM.bam 45 68 Cycle I 45.0000 2 0.00 +exampleBAM.bam 45 68 Cycle D 45.0000 2 0.00 +exampleBAM.bam 45 -68 Cycle I 45.0000 3 0.00 +exampleBAM.bam 45 -68 Cycle D 45.0000 3 0.00 +exampleBAM.bam 45 69 Cycle I 45.0000 2 0.00 +exampleBAM.bam 45 69 Cycle D 45.0000 2 0.00 +exampleBAM.bam 45 -69 Cycle I 45.0000 3 0.00 +exampleBAM.bam 45 -69 Cycle D 45.0000 3 0.00 +exampleBAM.bam 45 70 Cycle I 45.0000 1 0.00 +exampleBAM.bam 45 70 Cycle D 45.0000 1 0.00 +exampleBAM.bam 45 -70 Cycle I 45.0000 3 0.00 +exampleBAM.bam 45 -70 Cycle D 45.0000 3 0.00 +exampleBAM.bam 45 71 Cycle I 45.0000 2 0.00 +exampleBAM.bam 45 71 Cycle D 45.0000 2 0.00 +exampleBAM.bam 45 -71 Cycle I 45.0000 3 0.00 +exampleBAM.bam 45 -71 Cycle D 45.0000 3 0.00 +exampleBAM.bam 45 72 Cycle I 45.0000 1 0.00 +exampleBAM.bam 45 72 Cycle D 45.0000 1 0.00 +exampleBAM.bam 45 -72 Cycle I 45.0000 3 0.00 +exampleBAM.bam 45 -72 Cycle D 45.0000 3 0.00