gatk-3.8/public/testdata/exampleGRP.grp

#:GATKReport.v1.1:5
#:GATKTable:2:14::;
#:GATKTable:Arguments:Recalibration argument collection values used in this run
Argument                    Value          
covariate                   null           
default_platform            null           
deletions_context_size      8              
force_platform              null           
insertions_context_size     8              
insertions_default_quality  45             
low_quality_tail            2              
mismatches_context_size     2              
mismatches_default_quality  -1             
no_standard_covs            false           
quantizing_levels           16             
run_without_dbsnp           false          
solid_nocall_strategy       THROW_EXCEPTION
solid_recal_mode            SET_Q_ZERO     

#:GATKTable:3:94:::;
#:GATKTable:Quantized:Quality quantization map
QualityScore  Count  QuantizedScore
0                20               3
1                 0               3
2                 6               3
3              1041               3
4                 8               3
5               190               3
6               102               3
7                28               7
8               795               8
9                 0              93
10                0              93
11                0              93
12                0              93
13                0              93
14                0              93
15                0              93
16                0              93
17                0              93
18                0              93
19                0              93
20                0              93
21                0              93
22                0              93
23                0              93
24                0              93
25                0              93
26                0              93
27                0              93
28                0              93
29                0              93
30                0              93
31                0              93
32                0              93
33                0              93
34                0              93
35                0              93
36                0              93
37                0              93
38                0              93
39                0              93
40                0              93
41                0              93
42                0              93
43                0              93
44                0              93
45                0              93
46                0              93
47                0              93
48                0              93
49                0              93
50                0              93
51                0              93
52                0              93
53                0              93
54                0              93
55                0              93
56                0              93
57                0              93
58                0              93
59                0              93
60                0              93
61                0              93
62                0              93
63                0              93
64                0              93
65                0              93
66                0              93
67                0              93
68                0              93
69                0              93
70                0              93
71                0              93
72                0              93
73                0              93
74                0              93
75                0              93
76                0              93
77                0              93
78                0              93
79                0              93
80                0              93
81                0              93
82                0              82
83                0              83
84                0              84
85                0              85
86                0              86
87                0              87
88                0              88
89                0              89
90                0              90
91                0              91
92                0              92
93                0              93

#:GATKTable:6:3:%s:%s:%.4f:%.4f:%d:%d:;
#:GATKTable:RecalTable0:
ReadGroup           EventType  EmpiricalQuality  EstimatedQReported  Observations  Errors
exampleBAM.bam.bam  D                   25.8092             45.0000           380       0
exampleBAM.bam.bam  M                   14.0483             15.4820           380      14
exampleBAM.bam.bam  I                   25.8092             45.0000           380       0

#:GATKTable:6:32:%s:%s:%s:%.4f:%d:%d:;
#:GATKTable:RecalTable1:
ReadGroup           QualityScore  EventType  EmpiricalQuality  Observations  Errors
exampleBAM.bam.bam            32  M                   15.1851            32       0
exampleBAM.bam.bam            19  M                    9.0309            15       1
exampleBAM.bam.bam            33  M                   15.5630            35       0
exampleBAM.bam.bam            18  M                    6.0206             7       1
exampleBAM.bam.bam            34  M                   15.6820            36       0
exampleBAM.bam.bam            17  M                    5.4407             6       1
exampleBAM.bam.bam            16  M                    7.4036            10       1
exampleBAM.bam.bam            23  M                   12.0412            15       0
exampleBAM.bam.bam             6  M                    4.7712            11       3
exampleBAM.bam.bam            45  I                   25.8092           380       0
exampleBAM.bam.bam            22  M                   10.0000             9       0
exampleBAM.bam.bam             4  M                    4.7712             5       1
exampleBAM.bam.bam            21  M                   12.5527            17       0
exampleBAM.bam.bam             5  M                    4.2597             7       2
exampleBAM.bam.bam            20  M                    4.7712             5       1
exampleBAM.bam.bam            27  M                   13.6173            22       0
exampleBAM.bam.bam            10  M                    3.0103             1       0
exampleBAM.bam.bam            26  M                    8.4510             6       0
exampleBAM.bam.bam            11  M                    1.7609             2       1
exampleBAM.bam.bam             8  M                    6.0206             7       1
exampleBAM.bam.bam            25  M                   12.0412            15       0
exampleBAM.bam.bam             9  M                    6.9897             4       0
exampleBAM.bam.bam            24  M                   10.2119            20       1
exampleBAM.bam.bam            31  M                   14.1497            25       0
exampleBAM.bam.bam            14  M                    3.0103             1       0
exampleBAM.bam.bam            30  M                   13.2222            20       0
exampleBAM.bam.bam            15  M                    7.7815             5       0
exampleBAM.bam.bam            12  M                    6.9897             4       0
exampleBAM.bam.bam            29  M                   13.2222            20       0
exampleBAM.bam.bam            45  D                   25.8092           380       0
exampleBAM.bam.bam            13  M                    6.0206             3       0
exampleBAM.bam.bam            28  M                   12.0412            15       0

#:GATKTable:8:1354:%s:%s:%s:%s:%s:%.4f:%d:%d:;
#:GATKTable:RecalTable2:
ReadGroup           QualityScore  CovariateValue  CovariateName  EventType  EmpiricalQuality  Observations  Errors
exampleBAM.bam.bam            45  TGAAAGTG        Context        D                    3.0103             1       0
exampleBAM.bam.bam            45  TGGTATTA        Context        D                    3.0103             1       0
exampleBAM.bam.bam            45  AGCCTCGT        Context        D                    3.0103             1       0
exampleBAM.bam.bam            45  CTGTGTCT        Context        D                    3.0103             1       0
exampleBAM.bam.bam            45  CTTTGTAT        Context        I                    3.0103             1       0
exampleBAM.bam.bam            45  CTTAAGTG        Context        D                    3.0103             1       0
exampleBAM.bam.bam            45  CTTTATTA        Context        D                    3.0103             1       0
exampleBAM.bam.bam            45  23              Cycle          I                    7.7815             5       0
exampleBAM.bam.bam            45  27              Cycle          D                    7.7815             5       0
exampleBAM.bam.bam            45  ATTCTATT        Context        I                    3.0103             1       0
exampleBAM.bam.bam            45  CTAATCTC        Context        I                    3.0103             1       0
exampleBAM.bam.bam            34  GC              Context        M                    4.7712             2       0
exampleBAM.bam.bam             8  TG              Context        M                    6.0206             3       0
exampleBAM.bam.bam            45  TAGAGTTT        Context        I                    3.0103             1       0
exampleBAM.bam.bam             9  TA              Context        M                    3.0103             1       0
exampleBAM.bam.bam            45  GGTTCGGG        Context        I                    6.0206             3       0
exampleBAM.bam.bam            45  AGTTTCAC        Context        I                    3.0103             1       0
exampleBAM.bam.bam            45  CATTTCAC        Context        I                    3.0103             1       0
exampleBAM.bam.bam            16  7               Cycle          M                    3.0103             1       0
exampleBAM.bam.bam             5  76              Cycle          M                    3.0103             1       0
exampleBAM.bam.bam            45  CATGATAA        Context        D                    3.0103             1       0
exampleBAM.bam.bam            45  53              Cycle          I                    7.7815             5       0
exampleBAM.bam.bam            45  57              Cycle          D                    7.7815             5       0
exampleBAM.bam.bam            25  52              Cycle          M                    3.0103             1       0
exampleBAM.bam.bam            45  TGGCAGCC        Context        D                    3.0103             1       0
exampleBAM.bam.bam            33  CT              Context        M                    8.4510             6       0
exampleBAM.bam.bam            45  AAGTGACA        Context        I                    3.0103             1       0
exampleBAM.bam.bam            45  AGTGACAT        Context        I                    3.0103             1       0
exampleBAM.bam.bam            45  AGAGTTTC        Context        I                    3.0103             1       0
exampleBAM.bam.bam            45  CTCTTTGT        Context        D                    3.0103             1       0
exampleBAM.bam.bam            45  GCCTGAAA        Context        D                    3.0103             1       0
exampleBAM.bam.bam            12  25              Cycle          M                    3.0103             1       0
exampleBAM.bam.bam            34  75              Cycle          M                    3.0103             1       0
exampleBAM.bam.bam            32  41              Cycle          M                    4.7712             2       0
exampleBAM.bam.bam            21  GG              Context        M                    4.7712             2       0
exampleBAM.bam.bam            26  50              Cycle          M                    3.0103             1       0
exampleBAM.bam.bam            45  ACCTGGAG        Context        D                    3.0103             1       0
exampleBAM.bam.bam            45  CACAGCAA        Context        D                    3.0103             1       0
exampleBAM.bam.bam            20  GA              Context        M                    3.0103             1       0
exampleBAM.bam.bam            45  AGGTGGAG        Context        D                    3.0103             1       0
exampleBAM.bam.bam            45  GCAAAATC        Context        I                    3.0103             1       0
exampleBAM.bam.bam            27  TA              Context        M                    6.9897             4       0
exampleBAM.bam.bam            27  18              Cycle          M                    3.0103             1       0
exampleBAM.bam.bam            32  CC              Context        M                    3.0103             1       0
exampleBAM.bam.bam            45  AAAATCTA        Context        I                    3.0103             1       0
exampleBAM.bam.bam            45  22              Cycle          I                    7.7815             5       0
exampleBAM.bam.bam            45  26              Cycle          D                    7.7815             5       0
exampleBAM.bam.bam            33  76              Cycle          M                    3.0103             1       0
exampleBAM.bam.bam            30  24              Cycle          M                    3.0103             1       0
exampleBAM.bam.bam            45  TTCTATTC        Context        D                    3.0103             1       0
exampleBAM.bam.bam            45  GTCAATGT        Context        I                    3.0103             1       0
exampleBAM.bam.bam            21  73              Cycle          M                    3.0103             1       0
exampleBAM.bam.bam            17  4               Cycle          M                    3.0103             1       0
exampleBAM.bam.bam             8  17              Cycle          M                    3.0103             1       0
exampleBAM.bam.bam            34  GA              Context        M                    3.0103             1       0
exampleBAM.bam.bam            45  ATCGTGAG        Context        I                    3.0103             1       0
exampleBAM.bam.bam            45  CCAGATCC        Context        I                    3.0103             1       0
exampleBAM.bam.bam            45  GATCGTGA        Context        D                    3.0103             1       0
exampleBAM.bam.bam            45  52              Cycle          I                    7.7815             5       0
exampleBAM.bam.bam            45  56              Cycle          D                    7.7815             5       0
exampleBAM.bam.bam             9  TC              Context        M                    3.0103             1       0
exampleBAM.bam.bam            23  CT              Context        M                    4.7712             2       0
exampleBAM.bam.bam            31  26              Cycle          M                    4.7712             2       0
exampleBAM.bam.bam            45  ATGTGAAC        Context        D                    3.0103             1       0
exampleBAM.bam.bam            45  ATTACTCT        Context        I                    3.0103             1       0
exampleBAM.bam.bam            45  ACACAGCA        Context        D                    3.0103             1       0
exampleBAM.bam.bam            26  TT              Context        M                    3.0103             1       0
exampleBAM.bam.bam            45  GGGTTTGG        Context        D                    4.7712             2       0
exampleBAM.bam.bam            33  8               Cycle          M                    3.0103             1       0
exampleBAM.bam.bam            21  GT              Context        M                    4.7712             2       0
exampleBAM.bam.bam            34  74              Cycle          M                    3.0103             1       0
exampleBAM.bam.bam            45  ATTCTTAA        Context        I                    3.0103             1       0
exampleBAM.bam.bam            45  GAGCCTTT        Context        D                    3.0103             1       0
exampleBAM.bam.bam            20  GC              Context        M                    3.0103             1       0
exampleBAM.bam.bam            45  GGTTAGGG        Context        D                    4.7712             2       0
exampleBAM.bam.bam            33  42              Cycle          M                    3.0103             1       0
exampleBAM.bam.bam            45  GTGCAAAG        Context        I                    3.0103             1       0
exampleBAM.bam.bam             6  75              Cycle          M                    3.0103             1       0
exampleBAM.bam.bam            27  TC              Context        M                    3.0103             1       0
exampleBAM.bam.bam            32  CA              Context        M                    4.7712             2       0
exampleBAM.bam.bam            29  60              Cycle          M                    3.0103             1       0
exampleBAM.bam.bam            34  13              Cycle          M                    3.0103             1       0
exampleBAM.bam.bam            34  GT              Context        M                    4.7712             2       0
exampleBAM.bam.bam            21  74              Cycle          M                    3.0103             1       0
exampleBAM.bam.bam            45  GTTAATGA        Context        I                    3.0103             1       0
exampleBAM.bam.bam            45  TATTATTG        Context        D                    3.0103             1       0
exampleBAM.bam.bam            24  52              Cycle          M                    3.0103             1       0
exampleBAM.bam.bam            45  CTTTCAGG        Context        I                    3.0103             1       0
exampleBAM.bam.bam            45  GACATGGT        Context        D                    3.0103             1       0
exampleBAM.bam.bam            45  ATCATGGT        Context        D                    3.0103             1       0
exampleBAM.bam.bam            45  21              Cycle          I                    7.7815             5       0
exampleBAM.bam.bam            45  25              Cycle          D                    7.7815             5       0
exampleBAM.bam.bam            34  47              Cycle          M                    3.0103             1       0
exampleBAM.bam.bam            31  25              Cycle          M                    3.0103             1       0
exampleBAM.bam.bam            19  71              Cycle          M                    3.0103             1       0
exampleBAM.bam.bam             6  GG              Context        M                    3.9794             4       1
exampleBAM.bam.bam             9  16              Cycle          M                    3.0103             1       0
exampleBAM.bam.bam            45  TCCAGTTC        Context        I                    3.0103             1       0
exampleBAM.bam.bam            45  TTCACATG        Context        D                    3.0103             1       0
exampleBAM.bam.bam            45  TAAGTGAC        Context        I                    3.0103             1       0
exampleBAM.bam.bam            45  GTGACATG        Context        D                    3.0103             1       0
exampleBAM.bam.bam            45  55              Cycle          I                    7.7815             5       0
exampleBAM.bam.bam            45  59              Cycle          D                    7.7815             5       0
exampleBAM.bam.bam            45  CATGATCG        Context        I                    3.0103             1       0
exampleBAM.bam.bam            16  AT              Context        M                    3.0103             1       0
exampleBAM.bam.bam            32  43              Cycle          M                    6.0206             3       0
exampleBAM.bam.bam            19  33              Cycle          M                    3.0103             1       0
exampleBAM.bam.bam            21  GA              Context        M                    4.7712             2       0
exampleBAM.bam.bam            45  GTATTTGC        Context        D                    3.0103             1       0
exampleBAM.bam.bam            26  TA              Context        M                    3.0103             1       0
exampleBAM.bam.bam            45  TCTTAAGT        Context        D                    3.0103             1       0
exampleBAM.bam.bam            33  CC              Context        M                    3.0103             1       0
exampleBAM.bam.bam            11  20              Cycle          M                    3.0103             1       0
exampleBAM.bam.bam            28  61              Cycle          M                    3.0103             1       0
exampleBAM.bam.bam            18  1               Cycle          M                    3.0103             1       0
exampleBAM.bam.bam            45  ACCCAGAT        Context        I                    3.0103             1       0
exampleBAM.bam.bam            45  AAAGACAC        Context        I                    3.0103             1       0
exampleBAM.bam.bam            45  GCCTTTGC        Context        D                    3.0103             1       0
exampleBAM.bam.bam            27  16              Cycle          M                    3.0103             1       0
exampleBAM.bam.bam            27  TG              Context        M                    4.7712             2       0
exampleBAM.bam.bam            32  CT              Context        M                    3.0103             1       0
exampleBAM.bam.bam            21  44              Cycle          M                    3.0103             1       0
exampleBAM.bam.bam            45  TATTACTC        Context        I                    3.0103             1       0
exampleBAM.bam.bam            45  TGGGCTGG        Context        I                    3.0103             1       0
exampleBAM.bam.bam            16  65              Cycle          M                    3.0103             1       0
exampleBAM.bam.bam            34  GG              Context        M                    4.7712             2       0
exampleBAM.bam.bam            25  21              Cycle          M                    3.0103             1       0
exampleBAM.bam.bam            22  9               Cycle          M                    3.0103             1       0
exampleBAM.bam.bam            45  CAGGCCAC        Context        D                    3.0103             1       0
exampleBAM.bam.bam            45  20              Cycle          I                    7.7815             5       0
exampleBAM.bam.bam            45  24              Cycle          D                    7.7815             5       0
exampleBAM.bam.bam            30  26              Cycle          M                    3.0103             1       0
exampleBAM.bam.bam            45  TTGTATTT        Context        D                    3.0103             1       0
exampleBAM.bam.bam            24  53              Cycle          M                    3.0103             1       0
exampleBAM.bam.bam            23  CC              Context        M                    3.0103             1       0
exampleBAM.bam.bam            19  70              Cycle          M                   -0.0000             1       1
exampleBAM.bam.bam            25  55              Cycle          M                    3.0103             1       0
exampleBAM.bam.bam            45  AGGCCACC        Context        I                    3.0103             1       0
exampleBAM.bam.bam            45  54              Cycle          I                    7.7815             5       0
exampleBAM.bam.bam            45  58              Cycle          D                    7.7815             5       0
exampleBAM.bam.bam            45  ACTTTCAG        Context        I                    3.0103             1       0
exampleBAM.bam.bam            45  AAAGTGCA        Context        D                    3.0103             1       0
exampleBAM.bam.bam            45  ATTGATAT        Context        D                    3.0103             1       0
exampleBAM.bam.bam            45  AATGTGAA        Context        I                    3.0103             1       0
exampleBAM.bam.bam             9  TT              Context        M                    3.0103             1       0
exampleBAM.bam.bam            19  32              Cycle          M                    3.0103             1       0
exampleBAM.bam.bam            29  28              Cycle          M                    3.0103             1       0
exampleBAM.bam.bam            45  CGGGTTTG        Context        I                    4.7712             2       0
exampleBAM.bam.bam            45  TCTTTGTA        Context        I                    3.0103             1       0
exampleBAM.bam.bam            33  10              Cycle          M                    3.0103             1       0
exampleBAM.bam.bam            33  CA              Context        M                    4.7712             2       0
exampleBAM.bam.bam            45  GTTCGGGT        Context        I                    6.0206             3       0
exampleBAM.bam.bam            27  TT              Context        M                    4.7712             2       0
exampleBAM.bam.bam            27  17              Cycle          M                    3.0103             1       0
exampleBAM.bam.bam            45  CAGCAAAA        Context        I                    3.0103             1       0
exampleBAM.bam.bam            45  GGCAGCCT        Context        I                    3.0103             1       0
exampleBAM.bam.bam            20  GT              Context        M                   -0.0000             1       1
exampleBAM.bam.bam            45  TGGAGCCT        Context        I                    3.0103             1       0
exampleBAM.bam.bam            45  TGGTGGCC        Context        I                    3.0103             1       0
exampleBAM.bam.bam            28  30              Cycle          M                    3.0103             1       0
exampleBAM.bam.bam            33  40              Cycle          M                    3.0103             1       0
exampleBAM.bam.bam            24  TG              Context        M                    4.7712             2       0
exampleBAM.bam.bam            45  TGTGTCTT        Context        I                    3.0103             1       0
exampleBAM.bam.bam            45  TCAATAAT        Context        I                    3.0103             1       0
exampleBAM.bam.bam            45  TCTCCAGG        Context        I                    3.0103             1       0
exampleBAM.bam.bam            45  49              Cycle          I                    7.7815             5       0
exampleBAM.bam.bam            45  61              Cycle          D                    7.7815             5       0
exampleBAM.bam.bam            45  CCTCGTCC        Context        D                    3.0103             1       0
exampleBAM.bam.bam            45  GGCACCCA        Context        I                    3.0103             1       0
exampleBAM.bam.bam            22  44              Cycle          M                    4.7712             2       0
exampleBAM.bam.bam            45  AGGTTATC        Context        I                    3.0103             1       0
exampleBAM.bam.bam            34  41              Cycle          M                    3.0103             1       0
exampleBAM.bam.bam            19  65              Cycle          M                    3.0103             1       0
exampleBAM.bam.bam            23  12              Cycle          M                    3.0103             1       0
exampleBAM.bam.bam            23  GG              Context        M                    3.0103             1       0
exampleBAM.bam.bam            45  TTGGGTTC        Context        I                    3.0103             1       0
exampleBAM.bam.bam            45  TTCTGTGT        Context        D                    3.0103             1       0
exampleBAM.bam.bam            45  TGTTGGTT        Context        I                    3.0103             1       0
exampleBAM.bam.bam            24  50              Cycle          M                    3.0103             1       0
exampleBAM.bam.bam            45  GTTTCACA        Context        I                    3.0103             1       0
exampleBAM.bam.bam            45  TCGGGTTC        Context        I                    3.0103             1       0
exampleBAM.bam.bam            45  TAGGGTTC        Context        I                    3.0103             1       0
exampleBAM.bam.bam            33  73              Cycle          M                    3.0103             1       0
exampleBAM.bam.bam             9  52              Cycle          M                    3.0103             1       0
exampleBAM.bam.bam            45  19              Cycle          I                    7.7815             5       0
exampleBAM.bam.bam            45  31              Cycle          D                    7.7815             5       0
exampleBAM.bam.bam            25  TA              Context        M                    6.0206             3       0
exampleBAM.bam.bam            34  11              Cycle          M                    3.0103             1       0
exampleBAM.bam.bam            34  CC              Context        M                    3.0103             1       0
exampleBAM.bam.bam            28  25              Cycle          M                    3.0103             1       0
exampleBAM.bam.bam            45  TAGATTTT        Context        I                    3.0103             1       0
exampleBAM.bam.bam            45  GGTTGGGG        Context        I                    4.7712             2       0
exampleBAM.bam.bam            45  GGCTGGGG        Context        I                    3.0103             1       0
exampleBAM.bam.bam            45  GATTAGAT        Context        I                    3.0103             1       0
exampleBAM.bam.bam             5  GG              Context        M                    3.0103             3       1
exampleBAM.bam.bam            32  15              Cycle          M                    3.0103             1       0
exampleBAM.bam.bam            27  22              Cycle          M                    3.0103             1       0
exampleBAM.bam.bam            21  42              Cycle          M                    3.0103             1       0
exampleBAM.bam.bam            19  5               Cycle          M                    3.0103             1       0
exampleBAM.bam.bam            19  AT              Context        M                    3.0103             1       0
exampleBAM.bam.bam            45  TTTCAGGC        Context        D                    3.0103             1       0
exampleBAM.bam.bam            45  TGCCAGGC        Context        D                    3.0103             1       0
exampleBAM.bam.bam            45  GTCTTTAT        Context        I                    3.0103             1       0
exampleBAM.bam.bam            45  TGAACTGG        Context        I                    3.0103             1       0
exampleBAM.bam.bam            26  20              Cycle          M                    3.0103             1       0
exampleBAM.bam.bam            45  TATTCTTA        Context        D                    3.0103             1       0
exampleBAM.bam.bam            45  TGATAACC        Context        D                    3.0103             1       0
exampleBAM.bam.bam            45  ATTTTTCT        Context        D                    3.0103             1       0
exampleBAM.bam.bam            45  GGCTTTAT        Context        I                    3.0103             1       0
exampleBAM.bam.bam             5  46              Cycle          M                   -0.0000             1       1
exampleBAM.bam.bam            29  27              Cycle          M                    3.0103             1       0
exampleBAM.bam.bam            45  ATCCATTT        Context        D                    3.0103             1       0
exampleBAM.bam.bam            45  48              Cycle          I                    7.7815             5       0
exampleBAM.bam.bam            45  60              Cycle          D                    7.7815             5       0
exampleBAM.bam.bam            45  GATCCAGT        Context        I                    3.0103             1       0
exampleBAM.bam.bam            45  AATGAGTC        Context        D                    3.0103             1       0
exampleBAM.bam.bam            24  TT              Context        M                    3.0103             3       1
exampleBAM.bam.bam            45  TCTTTATA        Context        I                    3.0103             1       0
exampleBAM.bam.bam             6  CC              Context        M                    3.0103             1       0
exampleBAM.bam.bam            23  GT              Context        M                    4.7712             2       0
exampleBAM.bam.bam            34  40              Cycle          M                    3.0103             1       0
exampleBAM.bam.bam            45  18              Cycle          I                    7.7815             5       0
exampleBAM.bam.bam            45  30              Cycle          D                    7.7815             5       0
exampleBAM.bam.bam            45  CAAAATCT        Context        I                    3.0103             1       0
exampleBAM.bam.bam            22  15              Cycle          M                    3.0103             1       0
exampleBAM.bam.bam            45  CCAGGTTA        Context        I                    3.0103             1       0
exampleBAM.bam.bam            45  TCATGGTG        Context        I                    3.0103             1       0
exampleBAM.bam.bam            45  TCTAATCT        Context        I                    3.0103             1       0
exampleBAM.bam.bam            45  TTGGGTTA        Context        I                    3.0103             1       0
exampleBAM.bam.bam            45  TAGGGTTA        Context        I                    3.0103             1       0
exampleBAM.bam.bam            45  GTTGGTTA        Context        I                    3.0103             1       0
exampleBAM.bam.bam            33  72              Cycle          M                    3.0103             1       0
exampleBAM.bam.bam            31  60              Cycle          M                    3.0103             1       0
exampleBAM.bam.bam            34  CA              Context        M                    6.9897             4       0
exampleBAM.bam.bam            45  CCCAGATC        Context        D                    3.0103             1       0
exampleBAM.bam.bam            18  36              Cycle          M                    3.0103             1       0
exampleBAM.bam.bam            16  70              Cycle          M                    3.0103             1       0
exampleBAM.bam.bam            45  TGTATTTG        Context        I                    3.0103             1       0
exampleBAM.bam.bam            33  46              Cycle          M                    3.0103             1       0
exampleBAM.bam.bam            45  GGTTGGGT        Context        I                    3.0103             1       0
exampleBAM.bam.bam            45  GTTTGGGT        Context        I                    3.0103             1       0
exampleBAM.bam.bam            45  TTCTAGAG        Context        I                    3.0103             1       0
exampleBAM.bam.bam            19  AG              Context        M                    3.0103             1       0
exampleBAM.bam.bam            32  GA              Context        M                    4.7712             2       0
exampleBAM.bam.bam            32  14              Cycle          M                    4.7712             2       0
exampleBAM.bam.bam            12  62              Cycle          M                    3.0103             1       0
exampleBAM.bam.bam            33  12              Cycle          M                    3.0103             1       0
exampleBAM.bam.bam            45  GGTGGCCT        Context        I                    3.0103             1       0
exampleBAM.bam.bam             4  GC              Context        M                    3.0103             1       0
exampleBAM.bam.bam            27  53              Cycle          M                    4.7712             2       0
exampleBAM.bam.bam            23  GA              Context        M                    3.0103             1       0
exampleBAM.bam.bam            45  TTATTATT        Context        I                    3.0103             1       0
exampleBAM.bam.bam             5  74              Cycle          M                    3.0103             1       0
exampleBAM.bam.bam            45  ATGATAAC        Context        I                    3.0103             1       0
exampleBAM.bam.bam            45  51              Cycle          I                    7.7815             5       0
exampleBAM.bam.bam            45  63              Cycle          D                    7.7815             5       0
exampleBAM.bam.bam            45  CACCCAGA        Context        I                    3.0103             1       0
exampleBAM.bam.bam            45  CGTGAGTG        Context        D                    3.0103             1       0
exampleBAM.bam.bam            45  GCTTTATT        Context        I                    3.0103             1       0
exampleBAM.bam.bam            45  ATGGTGGC        Context        D                    3.0103             1       0
exampleBAM.bam.bam            34  CT              Context        M                    4.7712             2       0
exampleBAM.bam.bam             4  72              Cycle          M                    3.0103             1       0
exampleBAM.bam.bam            45  TCGGGTTT        Context        I                    4.7712             2       0
exampleBAM.bam.bam            24  48              Cycle          M                    3.0103             1       0
exampleBAM.bam.bam            45  TCCATGAT        Context        I                    3.0103             1       0
exampleBAM.bam.bam            45  CACATGAT        Context        I                    3.0103             1       0
exampleBAM.bam.bam            45  17              Cycle          I                    7.7815             5       0
exampleBAM.bam.bam            45  29              Cycle          D                    7.7815             5       0
exampleBAM.bam.bam            45  ATCAATAA        Context        D                    3.0103             1       0
exampleBAM.bam.bam            45  ACCATGAT        Context        I                    3.0103             1       0
exampleBAM.bam.bam            32  GT              Context        M                    8.4510             6       0
exampleBAM.bam.bam            19  7               Cycle          M                    3.0103             1       0
exampleBAM.bam.bam            33  45              Cycle          M                    3.0103             1       0
exampleBAM.bam.bam            28  27              Cycle          M                    3.0103             1       0
exampleBAM.bam.bam            45  TCCATTTC        Context        I                    3.0103             1       0
exampleBAM.bam.bam            45  GATAACCT        Context        D                    3.0103             1       0
exampleBAM.bam.bam            45  AACTGGGA        Context        I                    3.0103             1       0
exampleBAM.bam.bam             4  GG              Context        M                    3.0103             1       0
exampleBAM.bam.bam            33  GC              Context        M                    3.0103             1       0
exampleBAM.bam.bam            45  TCAGGCCA        Context        I                    3.0103             1       0
exampleBAM.bam.bam            45  TTGCACTT        Context        I                    3.0103             1       0
exampleBAM.bam.bam            45  TTCACTGA        Context        I                    3.0103             1       0
exampleBAM.bam.bam            45  CTCCAGGT        Context        D                    3.0103             1       0
exampleBAM.bam.bam             6  CT              Context        M                    3.0103             1       0
exampleBAM.bam.bam            23  15              Cycle          M                    3.0103             1       0
exampleBAM.bam.bam            25  51              Cycle          M                    3.0103             1       0
exampleBAM.bam.bam            32  72              Cycle          M                    3.0103             1       0
exampleBAM.bam.bam            34  42              Cycle          M                    3.0103             1       0
exampleBAM.bam.bam            45  GATATAAA        Context        I                    3.0103             1       0
exampleBAM.bam.bam            45  CTAGAGTT        Context        D                    3.0103             1       0
exampleBAM.bam.bam            45  50              Cycle          I                    7.7815             5       0
exampleBAM.bam.bam            45  62              Cycle          D                    7.7815             5       0
exampleBAM.bam.bam            45  GCCACCAT        Context        D                    3.0103             1       0
exampleBAM.bam.bam            45  GGGTTCGG        Context        D                    6.0206             3       0
exampleBAM.bam.bam            24  TC              Context        M                    6.0206             3       0
exampleBAM.bam.bam            25  TT              Context        M                    4.7712             2       0
exampleBAM.bam.bam            45  16              Cycle          I                    7.7815             5       0
exampleBAM.bam.bam            45  28              Cycle          D                    7.7815             5       0
exampleBAM.bam.bam            45  ACATGGTA        Context        I                    3.0103             1       0
exampleBAM.bam.bam            16  34              Cycle          M                   -0.0000             1       1
exampleBAM.bam.bam            45  AATCTCCA        Context        D                    3.0103             1       0
exampleBAM.bam.bam            45  ATTTCACT        Context        I                    3.0103             1       0
exampleBAM.bam.bam            22  GT              Context        M                    4.7712             2       0
exampleBAM.bam.bam            45  ATATCAAT        Context        D                    3.0103             1       0
exampleBAM.bam.bam            45  CAATGTGA        Context        D                    3.0103             1       0
exampleBAM.bam.bam            45  GAGTCAAT        Context        D                    3.0103             1       0
exampleBAM.bam.bam            24  49              Cycle          M                    3.0103             1       0
exampleBAM.bam.bam            45  GGGGGTTG        Context        I                    3.0103             1       0
exampleBAM.bam.bam            45  TAGGGTTG        Context        I                    3.0103             1       0
exampleBAM.bam.bam            45  TGCAATCC        Context        I                    3.0103             1       0
exampleBAM.bam.bam            45  TGGGGTTG        Context        I                    3.0103             1       0
exampleBAM.bam.bam            45  TTAATGAG        Context        I                    3.0103             1       0
exampleBAM.bam.bam            30  30              Cycle          M                    3.0103             1       0
exampleBAM.bam.bam            23  75              Cycle          M                    3.0103             1       0
exampleBAM.bam.bam            32  GG              Context        M                    7.7815             5       0
exampleBAM.bam.bam            20  9               Cycle          M                    3.0103             1       0
exampleBAM.bam.bam            20  CT              Context        M                    3.0103             1       0
exampleBAM.bam.bam            45  ATTAGATT        Context        D                    3.0103             1       0
exampleBAM.bam.bam            33  44              Cycle          M                    3.0103             1       0
exampleBAM.bam.bam            45  TTTCTGTG        Context        I                    3.0103             1       0
exampleBAM.bam.bam            45  TGGAGATT        Context        D                    3.0103             1       0
exampleBAM.bam.bam            45  GTTTGGGC        Context        I                    3.0103             1       0
exampleBAM.bam.bam            21  11              Cycle          M                    3.0103             1       0
exampleBAM.bam.bam            29  24              Cycle          M                    3.0103             1       0
exampleBAM.bam.bam            32  46              Cycle          M                    3.0103             1       0
exampleBAM.bam.bam            27  55              Cycle          M                    3.0103             1       0
exampleBAM.bam.bam            45  ATATAAAG        Context        I                    3.0103             1       0
exampleBAM.bam.bam            45  GAGTTTCA        Context        D                    3.0103             1       0
exampleBAM.bam.bam            45  CACTTTCA        Context        D                    3.0103             1       0
exampleBAM.bam.bam            45  CCATTTCA        Context        D                    3.0103             1       0
exampleBAM.bam.bam            45  CCAGGCAC        Context        D                    3.0103             1       0
exampleBAM.bam.bam            11  TT              Context        M                   -0.0000             1       1
exampleBAM.bam.bam            45  TTTCACTG        Context        I                    3.0103             1       0
exampleBAM.bam.bam            33  GA              Context        M                    3.0103             1       0
exampleBAM.bam.bam            45  TCGTGAGT        Context        I                    3.0103             1       0
exampleBAM.bam.bam            45  TACTCTTT        Context        D                    3.0103             1       0
exampleBAM.bam.bam            45  TAATGAGT        Context        I                    3.0103             1       0
exampleBAM.bam.bam            45  GTGTCTTT        Context        D                    3.0103             1       0
exampleBAM.bam.bam            45  GGCTTTAT        Context        D                    3.0103             1       0
exampleBAM.bam.bam            22  70              Cycle          M                    3.0103             1       0
exampleBAM.bam.bam            45  ATTTTTCT        Context        I                    3.0103             1       0
exampleBAM.bam.bam            45  TGCCAGGC        Context        I                    3.0103             1       0
exampleBAM.bam.bam            33  1               Cycle          M                    4.7712             2       0
exampleBAM.bam.bam            45  TTTCAGGC        Context        I                    3.0103             1       0
exampleBAM.bam.bam            45  TATTCTTA        Context        I                    3.0103             1       0
exampleBAM.bam.bam            45  TGATAACC        Context        I                    3.0103             1       0
exampleBAM.bam.bam            45  GTCTTTAT        Context        D                    3.0103             1       0
exampleBAM.bam.bam            45  TGAACTGG        Context        D                    3.0103             1       0
exampleBAM.bam.bam            21  AG              Context        M                    4.7712             2       0
exampleBAM.bam.bam            32  33              Cycle          M                    4.7712             2       0
exampleBAM.bam.bam            27  56              Cycle          M                    3.0103             1       0
exampleBAM.bam.bam            45  GGCTGGGG        Context        D                    3.0103             1       0
exampleBAM.bam.bam            45  GATTAGAT        Context        D                    3.0103             1       0
exampleBAM.bam.bam            33  35              Cycle          M                    3.0103             1       0
exampleBAM.bam.bam            45  TAGATTTT        Context        D                    3.0103             1       0
exampleBAM.bam.bam            45  GGTTGGGG        Context        D                    4.7712             2       0
exampleBAM.bam.bam            19  CT              Context        M                    1.7609             2       1
exampleBAM.bam.bam            45  19              Cycle          D                    7.7815             5       0
exampleBAM.bam.bam            45  31              Cycle          I                    7.7815             5       0
exampleBAM.bam.bam            45  TGTTGGTT        Context        D                    3.0103             1       0
exampleBAM.bam.bam            45  TTCTGTGT        Context        I                    3.0103             1       0
exampleBAM.bam.bam            24  62              Cycle          M                    3.0103             1       0
exampleBAM.bam.bam            45  TCGGGTTC        Context        D                    3.0103             1       0
exampleBAM.bam.bam            45  GTTTCACA        Context        D                    3.0103             1       0
exampleBAM.bam.bam            45  TAGGGTTC        Context        D                    3.0103             1       0
exampleBAM.bam.bam            45  TTGGGTTC        Context        D                    3.0103             1       0
exampleBAM.bam.bam            30  TT              Context        M                    4.7712             2       0
exampleBAM.bam.bam            30  17              Cycle          M                    4.7712             2       0
exampleBAM.bam.bam            33  69              Cycle          M                    3.0103             1       0
exampleBAM.bam.bam             6  36              Cycle          M                    3.0103             1       0
exampleBAM.bam.bam            17  GT              Context        M                    3.0103             1       0
exampleBAM.bam.bam            21  64              Cycle          M                    3.0103             1       0
exampleBAM.bam.bam            34  AC              Context        M                    3.0103             1       0
exampleBAM.bam.bam            16  GC              Context        M                    3.0103             1       0
exampleBAM.bam.bam            45  CCTCGTCC        Context        I                    3.0103             1       0
exampleBAM.bam.bam            45  49              Cycle          D                    7.7815             5       0
exampleBAM.bam.bam            45  61              Cycle          I                    7.7815             5       0
exampleBAM.bam.bam            45  AGGTTATC        Context        D                    3.0103             1       0
exampleBAM.bam.bam            45  GGCACCCA        Context        D                    3.0103             1       0
exampleBAM.bam.bam            45  TGTGTCTT        Context        D                    3.0103             1       0
exampleBAM.bam.bam            45  TCAATAAT        Context        D                    3.0103             1       0
exampleBAM.bam.bam            45  TCTCCAGG        Context        D                    3.0103             1       0
exampleBAM.bam.bam             6  AA              Context        M                    4.7712             2       0
exampleBAM.bam.bam            31  TC              Context        M                    3.0103             1       0
exampleBAM.bam.bam            31  19              Cycle          M                    3.0103             1       0
exampleBAM.bam.bam             8  58              Cycle          M                    3.0103             1       0
exampleBAM.bam.bam            28  54              Cycle          M                    3.0103             1       0
exampleBAM.bam.bam            45  GGTGGCCT        Context        D                    3.0103             1       0
exampleBAM.bam.bam            18  10              Cycle          M                    3.0103             1       0
exampleBAM.bam.bam            18  CA              Context        M                    4.7712             2       0
exampleBAM.bam.bam            27  57              Cycle          M                    3.0103             1       0
exampleBAM.bam.bam            21  AT              Context        M                    3.0103             1       0
exampleBAM.bam.bam            45  TGTATTTG        Context        D                    3.0103             1       0
exampleBAM.bam.bam            45  TTCTAGAG        Context        D                    3.0103             1       0
exampleBAM.bam.bam            45  GGTTGGGT        Context        D                    3.0103             1       0
exampleBAM.bam.bam            45  GTTTGGGT        Context        D                    3.0103             1       0
exampleBAM.bam.bam            13  TA              Context        M                    3.0103             1       0
exampleBAM.bam.bam            20  AC              Context        M                    3.0103             1       0
exampleBAM.bam.bam            45  CCCAGATC        Context        I                    3.0103             1       0
exampleBAM.bam.bam            32  2               Cycle          M                    4.7712             2       0
exampleBAM.bam.bam            27  27              Cycle          M                    3.0103             1       0
exampleBAM.bam.bam             6  67              Cycle          M                    3.0103             1       0
exampleBAM.bam.bam            45  TAGGGTTA        Context        D                    3.0103             1       0
exampleBAM.bam.bam            45  GTTGGTTA        Context        D                    3.0103             1       0
exampleBAM.bam.bam            45  TCATGGTG        Context        D                    3.0103             1       0
exampleBAM.bam.bam            45  TCTAATCT        Context        D                    3.0103             1       0
exampleBAM.bam.bam            45  TTGGGTTA        Context        D                    3.0103             1       0
exampleBAM.bam.bam            30  TG              Context        M                    3.0103             1       0
exampleBAM.bam.bam            45  18              Cycle          D                    7.7815             5       0
exampleBAM.bam.bam            45  30              Cycle          I                    7.7815             5       0
exampleBAM.bam.bam            45  CCAGGTTA        Context        D                    3.0103             1       0
exampleBAM.bam.bam            45  CAAAATCT        Context        D                    3.0103             1       0
exampleBAM.bam.bam            25  31              Cycle          M                    3.0103             1       0
exampleBAM.bam.bam            34  6               Cycle          M                    3.0103             1       0
exampleBAM.bam.bam            34  AA              Context        M                    3.0103             1       0
exampleBAM.bam.bam            17  GG              Context        M                    3.0103             1       0
exampleBAM.bam.bam            23  35              Cycle          M                    3.0103             1       0
exampleBAM.bam.bam            45  TCTTTATA        Context        D                    3.0103             1       0
exampleBAM.bam.bam            45  GATCCAGT        Context        D                    3.0103             1       0
exampleBAM.bam.bam            45  48              Cycle          D                    7.7815             5       0
exampleBAM.bam.bam            45  60              Cycle          I                    7.7815             5       0
exampleBAM.bam.bam            45  ATCCATTT        Context        I                    3.0103             1       0
exampleBAM.bam.bam            45  AATGAGTC        Context        I                    3.0103             1       0
exampleBAM.bam.bam            31  TA              Context        M                    4.7712             2       0
exampleBAM.bam.bam            21  AA              Context        M                    3.0103             1       0
exampleBAM.bam.bam            34  65              Cycle          M                    3.0103             1       0
exampleBAM.bam.bam            45  CTCCAGGT        Context        I                    3.0103             1       0
exampleBAM.bam.bam            18  CT              Context        M                    3.0103             1       0
exampleBAM.bam.bam            33  3               Cycle          M                    3.0103             1       0
exampleBAM.bam.bam            45  TCAGGCCA        Context        D                    3.0103             1       0
exampleBAM.bam.bam            45  TTGCACTT        Context        D                    3.0103             1       0
exampleBAM.bam.bam            28  53              Cycle          M                    3.0103             1       0
exampleBAM.bam.bam            45  TTCACTGA        Context        D                    3.0103             1       0
exampleBAM.bam.bam            19  CC              Context        M                    3.0103             1       0
exampleBAM.bam.bam            32  1               Cycle          M                    3.0103             1       0
exampleBAM.bam.bam            45  GATAACCT        Context        I                    3.0103             1       0
exampleBAM.bam.bam            45  AACTGGGA        Context        D                    3.0103             1       0
exampleBAM.bam.bam            16  73              Cycle          M                    3.0103             1       0
exampleBAM.bam.bam            45  TCCATTTC        Context        D                    3.0103             1       0
exampleBAM.bam.bam            21  66              Cycle          M                    3.0103             1       0
exampleBAM.bam.bam            34  5               Cycle          M                    3.0103             1       0
exampleBAM.bam.bam            34  AT              Context        M                    8.4510             6       0
exampleBAM.bam.bam            16  47              Cycle          M                    3.0103             1       0
exampleBAM.bam.bam            45  CACATGAT        Context        D                    3.0103             1       0
exampleBAM.bam.bam            45  17              Cycle          D                    7.7815             5       0
exampleBAM.bam.bam            45  29              Cycle          I                    7.7815             5       0
exampleBAM.bam.bam            45  ATCAATAA        Context        I                    3.0103             1       0
exampleBAM.bam.bam            45  ACCATGAT        Context        D                    3.0103             1       0
exampleBAM.bam.bam            45  TCGGGTTT        Context        D                    4.7712             2       0
exampleBAM.bam.bam            45  TCCATGAT        Context        D                    3.0103             1       0
exampleBAM.bam.bam             6  AG              Context        M                   -0.0000             1       1
exampleBAM.bam.bam             6  4               Cycle          M                    3.0103             1       0
exampleBAM.bam.bam            31  TT              Context        M                    3.0103             1       0
exampleBAM.bam.bam            45  ATGATAAC        Context        D                    3.0103             1       0
exampleBAM.bam.bam            45  51              Cycle          D                    7.7815             5       0
exampleBAM.bam.bam            45  63              Cycle          I                    7.7815             5       0
exampleBAM.bam.bam            45  CGTGAGTG        Context        I                    3.0103             1       0
exampleBAM.bam.bam            45  CACCCAGA        Context        D                    3.0103             1       0
exampleBAM.bam.bam            16  GT              Context        M                    3.0103             1       0
exampleBAM.bam.bam             5  70              Cycle          M                    3.0103             1       0
exampleBAM.bam.bam            45  GCTTTATT        Context        D                    3.0103             1       0
exampleBAM.bam.bam            45  ATGGTGGC        Context        I                    3.0103             1       0
exampleBAM.bam.bam            45  TTATTATT        Context        D                    3.0103             1       0
exampleBAM.bam.bam            34  64              Cycle          M                    3.0103             1       0
exampleBAM.bam.bam            21  AC              Context        M                    6.0206             3       0
exampleBAM.bam.bam            33  2               Cycle          M                    3.0103             1       0
exampleBAM.bam.bam            45  TTTCACTG        Context        D                    3.0103             1       0
exampleBAM.bam.bam            45  TCGTGAGT        Context        D                    3.0103             1       0
exampleBAM.bam.bam            45  GTGTCTTT        Context        I                    3.0103             1       0
exampleBAM.bam.bam            45  TAATGAGT        Context        D                    3.0103             1       0
exampleBAM.bam.bam            45  TACTCTTT        Context        I                    3.0103             1       0
exampleBAM.bam.bam            45  CACTTTCA        Context        I                    3.0103             1       0
exampleBAM.bam.bam            45  CCATTTCA        Context        I                    3.0103             1       0
exampleBAM.bam.bam            45  ATATAAAG        Context        D                    3.0103             1       0
exampleBAM.bam.bam            45  GAGTTTCA        Context        I                    3.0103             1       0
exampleBAM.bam.bam            45  CCAGGCAC        Context        I                    3.0103             1       0
exampleBAM.bam.bam            29  54              Cycle          M                    3.0103             1       0
exampleBAM.bam.bam             6  65              Cycle          M                    3.0103             1       0
exampleBAM.bam.bam            19  10              Cycle          M                    3.0103             1       0
exampleBAM.bam.bam            19  CA              Context        M                    4.7712             2       0
exampleBAM.bam.bam            45  TTTCTGTG        Context        D                    3.0103             1       0
exampleBAM.bam.bam            33  32              Cycle          M                    3.0103             1       0
exampleBAM.bam.bam            45  GTTTGGGC        Context        D                    3.0103             1       0
exampleBAM.bam.bam            45  TGGAGATT        Context        I                    3.0103             1       0
exampleBAM.bam.bam            45  ATTAGATT        Context        I                    3.0103             1       0
exampleBAM.bam.bam            34  4               Cycle          M                    3.0103             1       0
exampleBAM.bam.bam            21  67              Cycle          M                    3.0103             1       0
exampleBAM.bam.bam            45  TGGGGTTG        Context        D                    3.0103             1       0
exampleBAM.bam.bam            45  TGCAATCC        Context        D                    3.0103             1       0
exampleBAM.bam.bam            45  GGGGGTTG        Context        D                    3.0103             1       0
exampleBAM.bam.bam            45  TAGGGTTG        Context        D                    3.0103             1       0
exampleBAM.bam.bam            45  TTAATGAG        Context        D                    3.0103             1       0
exampleBAM.bam.bam            30  18              Cycle          M                    3.0103             1       0
exampleBAM.bam.bam            30  TA              Context        M                    6.9897             4       0
exampleBAM.bam.bam            45  16              Cycle          D                    7.7815             5       0
exampleBAM.bam.bam            45  28              Cycle          I                    7.7815             5       0
exampleBAM.bam.bam            45  ACATGGTA        Context        D                    3.0103             1       0
exampleBAM.bam.bam            45  GAGTCAAT        Context        I                    3.0103             1       0
exampleBAM.bam.bam            45  CAATGTGA        Context        I                    3.0103             1       0
exampleBAM.bam.bam            45  AATCTCCA        Context        I                    3.0103             1       0
exampleBAM.bam.bam            45  ATTTCACT        Context        D                    3.0103             1       0
exampleBAM.bam.bam            45  ATATCAAT        Context        I                    3.0103             1       0
exampleBAM.bam.bam             8  57              Cycle          M                   -0.0000             1       1
exampleBAM.bam.bam            34  38              Cycle          M                    3.0103             1       0
exampleBAM.bam.bam            31  16              Cycle          M                    3.0103             1       0
exampleBAM.bam.bam            31  TG              Context        M                    6.0206             3       0
exampleBAM.bam.bam            45  GGGTTCGG        Context        I                    6.0206             3       0
exampleBAM.bam.bam            45  CTAGAGTT        Context        I                    3.0103             1       0
exampleBAM.bam.bam            45  50              Cycle          D                    7.7815             5       0
exampleBAM.bam.bam            45  62              Cycle          I                    7.7815             5       0
exampleBAM.bam.bam            45  GATATAAA        Context        D                    3.0103             1       0
exampleBAM.bam.bam            45  GCCACCAT        Context        I                    3.0103             1       0
exampleBAM.bam.bam            45  ACCTGGAG        Context        I                    3.0103             1       0
exampleBAM.bam.bam             5  AG              Context        M                    3.0103             1       0
exampleBAM.bam.bam            45  AGGTGGAG        Context        I                    3.0103             1       0
exampleBAM.bam.bam            45  GCAAAATC        Context        D                    3.0103             1       0
exampleBAM.bam.bam            45  CACAGCAA        Context        I                    3.0103             1       0
exampleBAM.bam.bam            28  TT              Context        M                    3.0103             1       0
exampleBAM.bam.bam            33  39              Cycle          M                    3.0103             1       0
exampleBAM.bam.bam            19  GT              Context        M                    3.0103             1       0
exampleBAM.bam.bam            23  64              Cycle          M                    4.7712             2       0
exampleBAM.bam.bam            27  30              Cycle          M                    3.0103             1       0
exampleBAM.bam.bam            32  AC              Context        M                    3.0103             1       0
exampleBAM.bam.bam            45  AAGTGACA        Context        D                    3.0103             1       0
exampleBAM.bam.bam             5  38              Cycle          M                    3.0103             1       0
exampleBAM.bam.bam            45  AGAGTTTC        Context        D                    3.0103             1       0
exampleBAM.bam.bam            45  AGTGACAT        Context        D                    3.0103             1       0
exampleBAM.bam.bam            45  GCCTGAAA        Context        I                    3.0103             1       0
exampleBAM.bam.bam            45  CTCTTTGT        Context        I                    3.0103             1       0
exampleBAM.bam.bam            33  AT              Context        M                    4.7712             2       0
exampleBAM.bam.bam            45  TGGCAGCC        Context        I                    3.0103             1       0
exampleBAM.bam.bam             4  AA              Context        M                    3.0103             1       0
exampleBAM.bam.bam            29  TC              Context        M                    3.0103             1       0
exampleBAM.bam.bam            34  71              Cycle          M                    3.0103             1       0
exampleBAM.bam.bam            45  AGTTTCAC        Context        D                    3.0103             1       0
exampleBAM.bam.bam            45  CATTTCAC        Context        D                    3.0103             1       0
exampleBAM.bam.bam            45  53              Cycle          D                    7.7815             5       0
exampleBAM.bam.bam            45  57              Cycle          I                    7.7815             5       0
exampleBAM.bam.bam            45  CATGATAA        Context        I                    3.0103             1       0
exampleBAM.bam.bam            45  TAGAGTTT        Context        D                    3.0103             1       0
exampleBAM.bam.bam            45  GGTTCGGG        Context        D                    6.0206             3       0
exampleBAM.bam.bam            45  CTTTATTA        Context        I                    3.0103             1       0
exampleBAM.bam.bam            45  CTTTGTAT        Context        D                    3.0103             1       0
exampleBAM.bam.bam            45  AGCCTCGT        Context        I                    3.0103             1       0
exampleBAM.bam.bam            45  CTGTGTCT        Context        I                    3.0103             1       0
exampleBAM.bam.bam            45  CTTAAGTG        Context        I                    3.0103             1       0
exampleBAM.bam.bam            45  ATTCTATT        Context        D                    3.0103             1       0
exampleBAM.bam.bam            45  CTAATCTC        Context        D                    3.0103             1       0
exampleBAM.bam.bam            45  23              Cycle          D                    7.7815             5       0
exampleBAM.bam.bam            45  27              Cycle          I                    7.7815             5       0
exampleBAM.bam.bam            30  21              Cycle          M                    3.0103             1       0
exampleBAM.bam.bam            45  TGAAAGTG        Context        I                    3.0103             1       0
exampleBAM.bam.bam            45  TGGTATTA        Context        I                    3.0103             1       0
exampleBAM.bam.bam            23  38              Cycle          M                    3.0103             1       0
exampleBAM.bam.bam            34  3               Cycle          M                    3.0103             1       0
exampleBAM.bam.bam            45  GGTTAGGG        Context        I                    4.7712             2       0
exampleBAM.bam.bam            45  GTGCAAAG        Context        D                    3.0103             1       0
exampleBAM.bam.bam            28  TG              Context        M                    6.0206             3       0
exampleBAM.bam.bam            45  ATTCTTAA        Context        D                    3.0103             1       0
exampleBAM.bam.bam            45  GAGCCTTT        Context        I                    3.0103             1       0
exampleBAM.bam.bam            27  31              Cycle          M                    3.0103             1       0
exampleBAM.bam.bam            29  48              Cycle          M                    3.0103             1       0
exampleBAM.bam.bam            32  AA              Context        M                    3.0103             1       0
exampleBAM.bam.bam            19  GG              Context        M                    4.7712             2       0
exampleBAM.bam.bam             4  37              Cycle          M                    3.0103             1       0
exampleBAM.bam.bam            45  GGGTTTGG        Context        I                    4.7712             2       0
exampleBAM.bam.bam            33  AG              Context        M                    6.0206             3       0
exampleBAM.bam.bam            28  50              Cycle          M                    3.0103             1       0
exampleBAM.bam.bam            45  ATTACTCT        Context        D                    3.0103             1       0
exampleBAM.bam.bam            45  ACACAGCA        Context        I                    3.0103             1       0
exampleBAM.bam.bam            45  ATGTGAAC        Context        I                    3.0103             1       0
exampleBAM.bam.bam            32  36              Cycle          M                    4.7712             2       0
exampleBAM.bam.bam            29  TA              Context        M                    4.7712             2       0
exampleBAM.bam.bam            34  70              Cycle          M                    3.0103             1       0
exampleBAM.bam.bam            17  76              Cycle          M                   -0.0000             1       1
exampleBAM.bam.bam            30  54              Cycle          M                    3.0103             1       0
exampleBAM.bam.bam            24  25              Cycle          M                    3.0103             1       0
exampleBAM.bam.bam            45  ATCGTGAG        Context        D                    3.0103             1       0
exampleBAM.bam.bam            45  GATCGTGA        Context        I                    3.0103             1       0
exampleBAM.bam.bam            45  52              Cycle          D                    7.7815             5       0
exampleBAM.bam.bam            45  56              Cycle          I                    7.7815             5       0
exampleBAM.bam.bam            45  CCAGATCC        Context        D                    3.0103             1       0
exampleBAM.bam.bam            16  CA              Context        M                    3.0103             1       0
exampleBAM.bam.bam             8  63              Cycle          M                    3.0103             1       0
exampleBAM.bam.bam            14  TG              Context        M                    3.0103             1       0
exampleBAM.bam.bam            23  AT              Context        M                    6.0206             3       0
exampleBAM.bam.bam            19  72              Cycle          M                    3.0103             1       0
exampleBAM.bam.bam            30  20              Cycle          M                    3.0103             1       0
exampleBAM.bam.bam            45  TTCTATTC        Context        I                    3.0103             1       0
exampleBAM.bam.bam            45  GTCAATGT        Context        D                    3.0103             1       0
exampleBAM.bam.bam            45  AAAATCTA        Context        D                    3.0103             1       0
exampleBAM.bam.bam            45  22              Cycle          D                    7.7815             5       0
exampleBAM.bam.bam            45  26              Cycle          I                    7.7815             5       0
exampleBAM.bam.bam            34  2               Cycle          M                    3.0103             1       0
exampleBAM.bam.bam            19  GC              Context        M                    3.0103             1       0
exampleBAM.bam.bam             6  68              Cycle          M                   -0.0000             1       1
exampleBAM.bam.bam            23  66              Cycle          M                    3.0103             1       0
exampleBAM.bam.bam            27  28              Cycle          M                    3.0103             1       0
exampleBAM.bam.bam            32  AT              Context        M                    4.7712             2       0
exampleBAM.bam.bam             5  AA              Context        M                    3.0103             1       0
exampleBAM.bam.bam            45  TATTACTC        Context        D                    3.0103             1       0
exampleBAM.bam.bam            33  37              Cycle          M                    3.0103             1       0
exampleBAM.bam.bam            45  TGGGCTGG        Context        D                    3.0103             1       0
exampleBAM.bam.bam            28  TC              Context        M                    3.0103             1       0
exampleBAM.bam.bam             4  AG              Context        M                    3.0103             1       0
exampleBAM.bam.bam            29  TT              Context        M                    4.7712             2       0
exampleBAM.bam.bam            18  GT              Context        M                    3.0103             1       0
exampleBAM.bam.bam            45  AAAGACAC        Context        D                    3.0103             1       0
exampleBAM.bam.bam            45  GCCTTTGC        Context        I                    3.0103             1       0
exampleBAM.bam.bam            45  ACCCAGAT        Context        D                    3.0103             1       0
exampleBAM.bam.bam            45  TCTTAAGT        Context        I                    3.0103             1       0
exampleBAM.bam.bam            13  55              Cycle          M                    3.0103             1       0
exampleBAM.bam.bam            45  GTATTTGC        Context        I                    3.0103             1       0
exampleBAM.bam.bam            33  7               Cycle          M                    3.0103             1       0
exampleBAM.bam.bam            33  AC              Context        M                    3.0103             1       0
exampleBAM.bam.bam            23  AA              Context        M                    3.0103             1       0
exampleBAM.bam.bam             8  60              Cycle          M                    3.0103             1       0
exampleBAM.bam.bam            22  38              Cycle          M                    3.0103             1       0
exampleBAM.bam.bam            45  CATGATCG        Context        D                    3.0103             1       0
exampleBAM.bam.bam            45  55              Cycle          D                    7.7815             5       0
exampleBAM.bam.bam            45  59              Cycle          I                    7.7815             5       0
exampleBAM.bam.bam            45  TCCAGTTC        Context        D                    3.0103             1       0
exampleBAM.bam.bam            45  GTGACATG        Context        I                    3.0103             1       0
exampleBAM.bam.bam            45  TTCACATG        Context        I                    3.0103             1       0
exampleBAM.bam.bam            45  TAAGTGAC        Context        D                    3.0103             1       0
exampleBAM.bam.bam             4  64              Cycle          M                   -0.0000             1       1
exampleBAM.bam.bam            25  24              Cycle          M                    3.0103             1       0
exampleBAM.bam.bam            22  AG              Context        M                    4.7712             2       0
exampleBAM.bam.bam            45  CTTTCAGG        Context        D                    3.0103             1       0
exampleBAM.bam.bam            45  ATCATGGT        Context        I                    3.0103             1       0
exampleBAM.bam.bam            45  21              Cycle          D                    7.7815             5       0
exampleBAM.bam.bam            45  25              Cycle          I                    7.7815             5       0
exampleBAM.bam.bam            45  GACATGGT        Context        I                    3.0103             1       0
exampleBAM.bam.bam            30  23              Cycle          M                    3.0103             1       0
exampleBAM.bam.bam            33  67              Cycle          M                    3.0103             1       0
exampleBAM.bam.bam            24  56              Cycle          M                    3.0103             1       0
exampleBAM.bam.bam            45  TATTATTG        Context        I                    3.0103             1       0
exampleBAM.bam.bam            45  GTTAATGA        Context        D                    3.0103             1       0
exampleBAM.bam.bam            32  AG              Context        M                    3.0103             1       0
exampleBAM.bam.bam            23  67              Cycle          M                    3.0103             1       0
exampleBAM.bam.bam            45  TGGAGCCT        Context        D                    3.0103             1       0
exampleBAM.bam.bam            45  TGGTGGCC        Context        D                    3.0103             1       0
exampleBAM.bam.bam            28  TA              Context        M                    3.0103             1       0
exampleBAM.bam.bam            45  CAGCAAAA        Context        D                    3.0103             1       0
exampleBAM.bam.bam            45  GGCAGCCT        Context        D                    3.0103             1       0
exampleBAM.bam.bam            34  68              Cycle          M                    3.0103             1       0
exampleBAM.bam.bam            21  3               Cycle          M                    3.0103             1       0
exampleBAM.bam.bam            45  TCTTTGTA        Context        D                    3.0103             1       0
exampleBAM.bam.bam            45  GTTCGGGT        Context        D                    6.0206             3       0
exampleBAM.bam.bam            28  48              Cycle          M                    3.0103             1       0
exampleBAM.bam.bam            33  AA              Context        M                    3.0103             1       0
exampleBAM.bam.bam            18  GG              Context        M                    3.0103             1       0
exampleBAM.bam.bam            45  CGGGTTTG        Context        D                    4.7712             2       0
exampleBAM.bam.bam            34  34              Cycle          M                    3.0103             1       0
exampleBAM.bam.bam            23  AC              Context        M                    3.0103             1       0
exampleBAM.bam.bam            30  52              Cycle          M                    3.0103             1       0
exampleBAM.bam.bam            24  27              Cycle          M                    3.0103             1       0
exampleBAM.bam.bam            45  AGGCCACC        Context        D                    3.0103             1       0
exampleBAM.bam.bam            20  69              Cycle          M                    3.0103             1       0
exampleBAM.bam.bam            45  AAAGTGCA        Context        I                    3.0103             1       0
exampleBAM.bam.bam            45  ATTGATAT        Context        I                    3.0103             1       0
exampleBAM.bam.bam            45  AATGTGAA        Context        D                    3.0103             1       0
exampleBAM.bam.bam            45  54              Cycle          D                    7.7815             5       0
exampleBAM.bam.bam            45  58              Cycle          I                    7.7815             5       0
exampleBAM.bam.bam            45  ACTTTCAG        Context        D                    3.0103             1       0
exampleBAM.bam.bam            23  37              Cycle          M                    3.0103             1       0
exampleBAM.bam.bam            21  71              Cycle          M                    3.0103             1       0
exampleBAM.bam.bam            33  66              Cycle          M                    3.0103             1       0
exampleBAM.bam.bam            15  TG              Context        M                    3.0103             1       0
exampleBAM.bam.bam            45  TTGTATTT        Context        I                    3.0103             1       0
exampleBAM.bam.bam            45  20              Cycle          D                    7.7815             5       0
exampleBAM.bam.bam            45  24              Cycle          I                    7.7815             5       0
exampleBAM.bam.bam            45  CAGGCCAC        Context        I                    3.0103             1       0
exampleBAM.bam.bam            23  59              Cycle          M                    3.0103             1       0
exampleBAM.bam.bam            17  20              Cycle          M                    3.0103             1       0
exampleBAM.bam.bam            30  CG              Context        M                    3.0103             1       0
exampleBAM.bam.bam            45  TTGATATA        Context        I                    3.0103             1       0
exampleBAM.bam.bam            45  TTCTTAAG        Context        I                    3.0103             1       0
exampleBAM.bam.bam            15  14              Cycle          M                    3.0103             1       0
exampleBAM.bam.bam            45  GAACTGGG        Context        D                    3.0103             1       0
exampleBAM.bam.bam            45  6               Cycle          I                    7.7815             5       0
exampleBAM.bam.bam            45  10              Cycle          D                    7.7815             5       0
exampleBAM.bam.bam            45  GGGCTGGG        Context        D                    3.0103             1       0
exampleBAM.bam.bam            31  10              Cycle          M                    3.0103             1       0
exampleBAM.bam.bam            34  60              Cycle          M                    3.0103             1       0
exampleBAM.bam.bam            25  37              Cycle          M                    3.0103             1       0
exampleBAM.bam.bam             6  31              Cycle          M                   -0.0000             1       1
exampleBAM.bam.bam            30  42              Cycle          M                    3.0103             1       0
exampleBAM.bam.bam            45  GTTCTAGA        Context        D                    3.0103             1       0
exampleBAM.bam.bam            45  TATTTGCA        Context        D                    3.0103             1       0
exampleBAM.bam.bam            24  5               Cycle          M                    3.0103             1       0
exampleBAM.bam.bam            45  CCTTTGCA        Context        D                    3.0103             1       0
exampleBAM.bam.bam            45  CAGGCACC        Context        I                    3.0103             1       0
exampleBAM.bam.bam            45  36              Cycle          I                    7.7815             5       0
exampleBAM.bam.bam            45  40              Cycle          D                    7.7815             5       0
exampleBAM.bam.bam            29  GA              Context        M                    4.7712             2       0
exampleBAM.bam.bam            21  29              Cycle          M                    3.0103             1       0
exampleBAM.bam.bam            45  TAATCTCC        Context        I                    3.0103             1       0
exampleBAM.bam.bam            15  74              Cycle          M                    3.0103             1       0
exampleBAM.bam.bam            45  TTGGGGGT        Context        I                    3.0103             1       0
exampleBAM.bam.bam            33  24              Cycle          M                    3.0103             1       0
exampleBAM.bam.bam            45  GTTGGGGT        Context        I                    3.0103             1       0
exampleBAM.bam.bam            45  GCTGGGGT        Context        I                    3.0103             1       0
exampleBAM.bam.bam            45  66              Cycle          I                    7.7815             5       0
exampleBAM.bam.bam            45  CTTGGCTT        Context        D                    3.0103             1       0
exampleBAM.bam.bam            45  GGCCACCA        Context        D                    3.0103             1       0
exampleBAM.bam.bam            19  TG              Context        M                    4.7712             2       0
exampleBAM.bam.bam            45  TTCAGGCC        Context        I                    3.0103             1       0
exampleBAM.bam.bam            45  GGTTAATG        Context        I                    3.0103             1       0
exampleBAM.bam.bam            45  GGTGGAGC        Context        I                    3.0103             1       0
exampleBAM.bam.bam            28  GG              Context        M                    6.0206             3       0
exampleBAM.bam.bam            45  GAGATTAG        Context        I                    3.0103             1       0
exampleBAM.bam.bam            45  7               Cycle          I                    7.7815             5       0
exampleBAM.bam.bam            45  11              Cycle          D                    7.7815             5       0
exampleBAM.bam.bam            45  TTACTCTT        Context        I                    3.0103             1       0
exampleBAM.bam.bam            30  9               Cycle          M                    3.0103             1       0
exampleBAM.bam.bam            45  TTTATATC        Context        I                    3.0103             1       0
exampleBAM.bam.bam            45  TGGTTAAT        Context        I                    3.0103             1       0
exampleBAM.bam.bam            45  GTATTACT        Context        D                    3.0103             1       0
exampleBAM.bam.bam            31  11              Cycle          M                    3.0103             1       0
exampleBAM.bam.bam            31  CC              Context        M                    3.0103             1       0
exampleBAM.bam.bam            34  61              Cycle          M                    3.0103             1       0
exampleBAM.bam.bam            25  36              Cycle          M                    3.0103             1       0
exampleBAM.bam.bam            45  ACAGCAAA        Context        D                    3.0103             1       0
exampleBAM.bam.bam            45  AGTGCAAA        Context        D                    3.0103             1       0
exampleBAM.bam.bam            45  37              Cycle          I                    7.7815             5       0
exampleBAM.bam.bam            45  41              Cycle          D                    7.7815             5       0
exampleBAM.bam.bam            45  TCCAGGTT        Context        I                    3.0103             1       0
exampleBAM.bam.bam            45  GTGAGTGT        Context        D                    3.0103             1       0
exampleBAM.bam.bam            45  TTATCATG        Context        D                    3.0103             1       0
exampleBAM.bam.bam            24  AG              Context        M                    4.7712             2       0
exampleBAM.bam.bam            29  GC              Context        M                    3.0103             1       0
exampleBAM.bam.bam            32  57              Cycle          M                    3.0103             1       0
exampleBAM.bam.bam            45  67              Cycle          I                    7.7815             5       0
exampleBAM.bam.bam            18  19              Cycle          M                    3.0103             1       0
exampleBAM.bam.bam            45  CTGGAGAT        Context        I                    3.0103             1       0
exampleBAM.bam.bam            45  AGATTTTT        Context        I                    3.0103             1       0
exampleBAM.bam.bam            45  AAATCTAA        Context        D                    3.0103             1       0
exampleBAM.bam.bam            45  CTGAAAGT        Context        D                    3.0103             1       0
exampleBAM.bam.bam            45  AGGCACCC        Context        D                    3.0103             1       0
exampleBAM.bam.bam            45  TCTGTGTC        Context        I                    3.0103             1       0
exampleBAM.bam.bam            45  TTGGGCTG        Context        D                    3.0103             1       0
exampleBAM.bam.bam            28  47              Cycle          M                    3.0103             1       0
exampleBAM.bam.bam            45  GTTGGGGG        Context        I                    3.0103             1       0
exampleBAM.bam.bam            19  TT              Context        M                    4.7712             2       0
exampleBAM.bam.bam            29  45              Cycle          M                    3.0103             1       0
exampleBAM.bam.bam            45  CCTGGAGA        Context        I                    3.0103             1       0
exampleBAM.bam.bam            45  ATGATTCT        Context        D                    3.0103             1       0
exampleBAM.bam.bam            45  GCCAGGCA        Context        I                    3.0103             1       0
exampleBAM.bam.bam            45  TTTATTAT        Context        I                    3.0103             1       0
exampleBAM.bam.bam            33  59              Cycle          M                    3.0103             1       0
exampleBAM.bam.bam            45  TCTATTCT        Context        D                    3.0103             1       0
exampleBAM.bam.bam            45  TAACCTGG        Context        I                    3.0103             1       0
exampleBAM.bam.bam            30  CA              Context        M                    6.0206             3       0
exampleBAM.bam.bam            15  GG              Context        M                    4.7712             2       0
exampleBAM.bam.bam            45  GACACAGC        Context        I                    3.0103             1       0
exampleBAM.bam.bam            45  AACCTGGA        Context        D                    3.0103             1       0
exampleBAM.bam.bam            45  4               Cycle          I                    7.7815             5       0
exampleBAM.bam.bam            45  8               Cycle          D                    7.7815             5       0
exampleBAM.bam.bam            25  AT              Context        M                    4.7712             2       0
exampleBAM.bam.bam             6  63              Cycle          M                    4.7712             2       0
exampleBAM.bam.bam            45  TTTGCAAT        Context        D                    3.0103             1       0
exampleBAM.bam.bam            45  TTTGCACT        Context        I                    3.0103             1       0
exampleBAM.bam.bam            45  TTAAGTGA        Context        D                    3.0103             1       0
exampleBAM.bam.bam            45  TGAGTCAA        Context        I                    3.0103             1       0
exampleBAM.bam.bam            22  59              Cycle          M                    3.0103             1       0
exampleBAM.bam.bam            45  CTCGTCCA        Context        D                    3.0103             1       0
exampleBAM.bam.bam            45  38              Cycle          I                    7.7815             5       0
exampleBAM.bam.bam            45  42              Cycle          D                    7.7815             5       0
exampleBAM.bam.bam            34  62              Cycle          M                    3.0103             1       0
exampleBAM.bam.bam            31  CG              Context        M                    3.0103             1       0
exampleBAM.bam.bam            31  8               Cycle          M                    4.7712             2       0
exampleBAM.bam.bam            27  69              Cycle          M                    3.0103             1       0
exampleBAM.bam.bam            26  3               Cycle          M                    3.0103             1       0
exampleBAM.bam.bam            45  TATAAAGA        Context        D                    3.0103             1       0
exampleBAM.bam.bam            45  GGGGTTGG        Context        D                    4.7712             2       0
exampleBAM.bam.bam            45  64              Cycle          I                    7.7815             5       0
exampleBAM.bam.bam            45  76              Cycle          D                    7.7815             5       0
exampleBAM.bam.bam            45  GATTCTAT        Context        D                    3.0103             1       0
exampleBAM.bam.bam            45  AGACACAG        Context        I                    3.0103             1       0
exampleBAM.bam.bam            45  AGGGTTGG        Context        D                    3.0103             1       0
exampleBAM.bam.bam            45  AGTGTTGG        Context        D                    3.0103             1       0
exampleBAM.bam.bam            29  12              Cycle          M                    3.0103             1       0
exampleBAM.bam.bam            29  GG              Context        M                    6.9897             4       0
exampleBAM.bam.bam             8  71              Cycle          M                    3.0103             1       0
exampleBAM.bam.bam            45  GTGAACTG        Context        I                    3.0103             1       0
exampleBAM.bam.bam            45  TTGGCTTT        Context        D                    3.0103             1       0
exampleBAM.bam.bam             9  69              Cycle          M                    3.0103             1       0
exampleBAM.bam.bam            45  CCTGAAAG        Context        I                    3.0103             1       0
exampleBAM.bam.bam            45  CTTTGCAC        Context        D                    3.0103             1       0
exampleBAM.bam.bam            20  29              Cycle          M                    3.0103             1       0
exampleBAM.bam.bam            12  40              Cycle          M                    3.0103             1       0
exampleBAM.bam.bam            32  24              Cycle          M                    3.0103             1       0
exampleBAM.bam.bam            21  61              Cycle          M                    3.0103             1       0
exampleBAM.bam.bam            45  CATGGTAT        Context        I                    3.0103             1       0
exampleBAM.bam.bam            45  GCACCCAG        Context        D                    3.0103             1       0
exampleBAM.bam.bam            16  55              Cycle          M                    3.0103             1       0
exampleBAM.bam.bam            45  ATGATCGT        Context        D                    3.0103             1       0
exampleBAM.bam.bam            45  5               Cycle          I                    7.7815             5       0
exampleBAM.bam.bam            45  9               Cycle          D                    7.7815             5       0
exampleBAM.bam.bam            30  CC              Context        M                    4.7712             2       0
exampleBAM.bam.bam            23  56              Cycle          M                    3.0103             1       0
exampleBAM.bam.bam             6  62              Cycle          M                    3.0103             1       0
exampleBAM.bam.bam            31  43              Cycle          M                    3.0103             1       0
exampleBAM.bam.bam            25  AG              Context        M                    3.0103             1       0
exampleBAM.bam.bam            45  ATAACCTG        Context        D                    3.0103             1       0
exampleBAM.bam.bam            45  39              Cycle          I                    7.7815             5       0
exampleBAM.bam.bam            45  43              Cycle          D                    7.7815             5       0
exampleBAM.bam.bam            45  GAAAGTGC        Context        D                    3.0103             1       0
exampleBAM.bam.bam            24  AA              Context        M                    3.0103             1       0
exampleBAM.bam.bam            24  6               Cycle          M                    4.7712             2       0
exampleBAM.bam.bam            45  TTATTGAT        Context        I                    3.0103             1       0
exampleBAM.bam.bam            34  63              Cycle          M                    3.0103             1       0
exampleBAM.bam.bam            31  CT              Context        M                    3.0103             1       0
exampleBAM.bam.bam            45  65              Cycle          I                    7.7815             5       0
exampleBAM.bam.bam            18  TT              Context        M                   -0.0000             1       1
exampleBAM.bam.bam            45  GATTTTTC        Context        I                    3.0103             1       0
exampleBAM.bam.bam            45  AGTTCTAG        Context        D                    3.0103             1       0
exampleBAM.bam.bam            45  TAAAGACA        Context        I                    3.0103             1       0
exampleBAM.bam.bam            45  TGAGTGTT        Context        I                    3.0103             1       0
exampleBAM.bam.bam            45  TTTCACAT        Context        I                    3.0103             1       0
exampleBAM.bam.bam            45  GTGGAGCC        Context        D                    3.0103             1       0
exampleBAM.bam.bam            19  49              Cycle          M                    3.0103             1       0
exampleBAM.bam.bam            29  GT              Context        M                    4.7712             2       0
exampleBAM.bam.bam             5  26              Cycle          M                   -0.0000             1       1
exampleBAM.bam.bam            45  AAGTGCAA        Context        D                    3.0103             1       0
exampleBAM.bam.bam            45  ATTTGCAA        Context        D                    3.0103             1       0
exampleBAM.bam.bam            45  ATCTAATC        Context        I                    3.0103             1       0
exampleBAM.bam.bam            20  28              Cycle          M                   -0.0000             1       1
exampleBAM.bam.bam            45  GGTATTAC        Context        I                    3.0103             1       0
exampleBAM.bam.bam            45  TGTGAACT        Context        D                    3.0103             1       0
exampleBAM.bam.bam            45  TGGCCTGA        Context        I                    3.0103             1       0
exampleBAM.bam.bam            33  57              Cycle          M                    3.0103             1       0
exampleBAM.bam.bam            21  60              Cycle          M                    3.0103             1       0
exampleBAM.bam.bam            29  47              Cycle          M                    3.0103             1       0
exampleBAM.bam.bam            34  56              Cycle          M                    3.0103             1       0
exampleBAM.bam.bam            31  GA              Context        M                    4.7712             2       0
exampleBAM.bam.bam            45  TCGTCCAT        Context        D                    3.0103             1       0
exampleBAM.bam.bam            45  TGATTCTA        Context        I                    3.0103             1       0
exampleBAM.bam.bam            45  ATCCAGTT        Context        D                    3.0103             1       0
exampleBAM.bam.bam            45  32              Cycle          I                    7.7815             5       0
exampleBAM.bam.bam            45  44              Cycle          D                    7.7815             5       0
exampleBAM.bam.bam            45  CATGATTC        Context        D                    3.0103             1       0
exampleBAM.bam.bam            45  CAATCCAT        Context        D                    3.0103             1       0
exampleBAM.bam.bam            45  CAGTTCTA        Context        I                    3.0103             1       0
exampleBAM.bam.bam            34  26              Cycle          M                    3.0103             1       0
exampleBAM.bam.bam             8  AT              Context        M                   -0.0000             1       1
exampleBAM.bam.bam            45  GGGTTAGG        Context        D                    4.7712             2       0
exampleBAM.bam.bam            30  12              Cycle          M                    3.0103             1       0
exampleBAM.bam.bam            45  TATATCAA        Context        I                    3.0103             1       0
exampleBAM.bam.bam            45  GCAATCCA        Context        D                    3.0103             1       0
exampleBAM.bam.bam            45  GGAGCCTT        Context        D                    3.0103             1       0
exampleBAM.bam.bam            45  CAGATCCA        Context        D                    3.0103             1       0
exampleBAM.bam.bam            45  2               Cycle          I                    7.7815             5       0
exampleBAM.bam.bam            45  14              Cycle          D                    7.7815             5       0
exampleBAM.bam.bam            45  GAGTGTTG        Context        I                    3.0103             1       0
exampleBAM.bam.bam            32  30              Cycle          M                    3.0103             1       0
exampleBAM.bam.bam            27  AC              Context        M                    3.0103             1       0
exampleBAM.bam.bam            21  59              Cycle          M                    3.0103             1       0
exampleBAM.bam.bam            45  TGTCTTTA        Context        I                    3.0103             1       0
exampleBAM.bam.bam            45  TCAATGTG        Context        I                    3.0103             1       0
exampleBAM.bam.bam            45  TGGCTTTA        Context        I                    3.0103             1       0
exampleBAM.bam.bam            13  GA              Context        M                    3.0103             1       0
exampleBAM.bam.bam            45  CCATGATT        Context        D                    3.0103             1       0
exampleBAM.bam.bam            29  CA              Context        M                    3.0103             1       0
exampleBAM.bam.bam            19  54              Cycle          M                    3.0103             1       0
exampleBAM.bam.bam            45  TATCAATA        Context        I                    3.0103             1       0
exampleBAM.bam.bam            45  TTTGGGCT        Context        I                    3.0103             1       0
exampleBAM.bam.bam            45  TTGGTTAA        Context        I                    3.0103             1       0
exampleBAM.bam.bam            45  TGCACTTT        Context        D                    3.0103             1       0
exampleBAM.bam.bam            45  TCTAGAGT        Context        I                    3.0103             1       0
exampleBAM.bam.bam            26  AT              Context        M                    3.0103             1       0
exampleBAM.bam.bam            20  57              Cycle          M                    3.0103             1       0
exampleBAM.bam.bam            45  GCCTCGTC        Context        D                    3.0103             1       0
exampleBAM.bam.bam            45  70              Cycle          I                    7.7815             5       0
exampleBAM.bam.bam            45  74              Cycle          D                    7.7815             5       0
exampleBAM.bam.bam            18  22              Cycle          M                    3.0103             1       0
exampleBAM.bam.bam            25  32              Cycle          M                    3.0103             1       0
exampleBAM.bam.bam            27  66              Cycle          M                    3.0103             1       0
exampleBAM.bam.bam            31  15              Cycle          M                    4.7712             2       0
exampleBAM.bam.bam            31  GC              Context        M                    6.0206             3       0
exampleBAM.bam.bam            45  33              Cycle          I                    7.7815             5       0
exampleBAM.bam.bam            45  45              Cycle          D                    7.7815             5       0
exampleBAM.bam.bam            45  GGAGATTA        Context        D                    3.0103             1       0
exampleBAM.bam.bam            45  AGATCCAG        Context        D                    3.0103             1       0
exampleBAM.bam.bam            16  19              Cycle          M                    3.0103             1       0
exampleBAM.bam.bam            45  ATGGTATT        Context        I                    3.0103             1       0
exampleBAM.bam.bam            45  ATCTCCAG        Context        D                    3.0103             1       0
exampleBAM.bam.bam            13  75              Cycle          M                    3.0103             1       0
exampleBAM.bam.bam            45  TTTGTATT        Context        I                    3.0103             1       0
exampleBAM.bam.bam            45  TATCATGG        Context        I                    3.0103             1       0
exampleBAM.bam.bam            45  TGACATGG        Context        I                    3.0103             1       0
exampleBAM.bam.bam            17  TT              Context        M                    3.0103             3       1
exampleBAM.bam.bam            31  45              Cycle          M                    3.0103             1       0
exampleBAM.bam.bam             8  AG              Context        M                    4.7712             2       0
exampleBAM.bam.bam            34  27              Cycle          M                    3.0103             1       0
exampleBAM.bam.bam            45  3               Cycle          I                    7.7815             5       0
exampleBAM.bam.bam            45  15              Cycle          D                    7.7815             5       0
exampleBAM.bam.bam            45  TTATATCA        Context        I                    3.0103             1       0
exampleBAM.bam.bam            45  TGATATAA        Context        D                    3.0103             1       0
exampleBAM.bam.bam            45  GGTTATCA        Context        I                    3.0103             1       0
exampleBAM.bam.bam            45  TCACTGAT        Context        I                    3.0103             1       0
exampleBAM.bam.bam            45  GTGGCCTG        Context        D                    3.0103             1       0
exampleBAM.bam.bam            19  21              Cycle          M                    4.7712             2       0
exampleBAM.bam.bam            32  31              Cycle          M                    3.0103             1       0
exampleBAM.bam.bam            27  AA              Context        M                    3.0103             1       0
exampleBAM.bam.bam            45  CACTGATG        Context        D                    3.0103             1       0
exampleBAM.bam.bam            45  ATAAAGAC        Context        I                    3.0103             1       0
exampleBAM.bam.bam            45  GCACTTTC        Context        I                    3.0103             1       0
exampleBAM.bam.bam            45  CAGCCTCG        Context        I                    3.0103             1       0
exampleBAM.bam.bam            28  CT              Context        M                    4.7712             2       0
exampleBAM.bam.bam            45  71              Cycle          I                    7.7815             5       0
exampleBAM.bam.bam            45  75              Cycle          D                    7.7815             5       0
exampleBAM.bam.bam            45  AGCAAAAT        Context        I                    3.0103             1       0
exampleBAM.bam.bam            45  TTGCAATC        Context        I                    3.0103             1       0
exampleBAM.bam.bam            33  29              Cycle          M                    4.7712             2       0
exampleBAM.bam.bam            26  AG              Context        M                    3.0103             1       0
exampleBAM.bam.bam            45  GGTTTGGG        Context        D                    4.7712             2       0
exampleBAM.bam.bam            45  GGGTTGGG        Context        D                    6.0206             3       0
exampleBAM.bam.bam            24  3               Cycle          M                    3.0103             1       0
exampleBAM.bam.bam            45  TTTTTCTG        Context        I                    3.0103             1       0
exampleBAM.bam.bam            45  TTAGATTT        Context        D                    3.0103             1       0
exampleBAM.bam.bam            16  TG              Context        M                    4.7712             2       0
exampleBAM.bam.bam            45  34              Cycle          I                    7.7815             5       0
exampleBAM.bam.bam            45  46              Cycle          D                    7.7815             5       0
exampleBAM.bam.bam            45  ATGAGTCA        Context        D                    3.0103             1       0
exampleBAM.bam.bam            27  65              Cycle          M                    3.0103             1       0
exampleBAM.bam.bam            31  12              Cycle          M                    3.0103             1       0
exampleBAM.bam.bam            31  GG              Context        M                    6.9897             4       0
exampleBAM.bam.bam            34  58              Cycle          M                    3.0103             1       0
exampleBAM.bam.bam            24  33              Cycle          M                    3.0103             1       0
exampleBAM.bam.bam            15  8               Cycle          M                    3.0103             1       0
exampleBAM.bam.bam            26  67              Cycle          M                    3.0103             1       0
exampleBAM.bam.bam            30  GA              Context        M                    4.7712             2       0
exampleBAM.bam.bam            45  12              Cycle          D                    7.7815             5       0
exampleBAM.bam.bam            45  GGCCTGAA        Context        I                    3.0103             1       0
exampleBAM.bam.bam            45  AGATTAGA        Context        D                    3.0103             1       0
exampleBAM.bam.bam            45  GCAGCCTC        Context        D                    3.0103             1       0
exampleBAM.bam.bam            45  CATGGTGG        Context        D                    3.0103             1       0
exampleBAM.bam.bam            45  AATCCATT        Context        D                    3.0103             1       0
exampleBAM.bam.bam            45  CTTTATAT        Context        D                    3.0103             1       0
exampleBAM.bam.bam            29  76              Cycle          M                    3.0103             1       0
exampleBAM.bam.bam            23  61              Cycle          M                    3.0103             1       0
exampleBAM.bam.bam            28  CA              Context        M                    4.7712             2       0
exampleBAM.bam.bam            45  GTTAGGGT        Context        I                    6.0206             3       0
exampleBAM.bam.bam            45  ACTCTTTG        Context        I                    3.0103             1       0
exampleBAM.bam.bam            45  AGCCTTTG        Context        I                    3.0103             1       0
exampleBAM.bam.bam            45  ACATGATC        Context        D                    3.0103             1       0
exampleBAM.bam.bam            45  ATTATTGA        Context        D                    3.0103             1       0
exampleBAM.bam.bam            32  28              Cycle          M                    4.7712             2       0
exampleBAM.bam.bam            29  42              Cycle          M                    3.0103             1       0
exampleBAM.bam.bam            27  AT              Context        M                    6.9897             4       0
exampleBAM.bam.bam            45  TGGGTTAG        Context        I                    3.0103             1       0
exampleBAM.bam.bam            45  TGGGTTCG        Context        D                    3.0103             1       0
exampleBAM.bam.bam            26  7               Cycle          M                    3.0103             1       0
exampleBAM.bam.bam            45  TTTTCTGT        Context        I                    3.0103             1       0
exampleBAM.bam.bam            45  AGGGTTAG        Context        I                    3.0103             1       0
exampleBAM.bam.bam            45  AGGGTTCG        Context        D                    3.0103             1       0
exampleBAM.bam.bam            45  CGGGTTCG        Context        D                    3.0103             1       0
exampleBAM.bam.bam            45  68              Cycle          I                    7.7815             5       0
exampleBAM.bam.bam            45  72              Cycle          D                    7.7815             5       0
exampleBAM.bam.bam            45  AGTCAATG        Context        I                    3.0103             1       0
exampleBAM.bam.bam            29  8               Cycle          M                    3.0103             1       0
exampleBAM.bam.bam            29  CG              Context        M                    4.7712             2       0
exampleBAM.bam.bam             4  29              Cycle          M                    3.0103             1       0
exampleBAM.bam.bam            16  TT              Context        M                    3.9794             4       1
exampleBAM.bam.bam            45  CACCATGA        Context        I                    3.0103             1       0
exampleBAM.bam.bam            45  35              Cycle          I                    7.7815             5       0
exampleBAM.bam.bam            45  47              Cycle          D                    7.7815             5       0
exampleBAM.bam.bam            45  CTATTCTT        Context        I                    3.0103             1       0
exampleBAM.bam.bam            45  AATCTAAT        Context        I                    3.0103             1       0
exampleBAM.bam.bam            45  GTGTTGGT        Context        D                    3.0103             1       0
exampleBAM.bam.bam            30  45              Cycle          M                    3.0103             1       0
exampleBAM.bam.bam            45  TCACATGA        Context        I                    3.0103             1       0
exampleBAM.bam.bam             9  AG              Context        M                    3.0103             1       0
exampleBAM.bam.bam            45  GTCCATGA        Context        I                    3.0103             1       0
exampleBAM.bam.bam            31  13              Cycle          M                    3.0103             1       0
exampleBAM.bam.bam            31  GT              Context        M                    3.0103             1       0
exampleBAM.bam.bam            34  59              Cycle          M                    3.0103             1       0
exampleBAM.bam.bam            45  AAGACACA        Context        I                    3.0103             1       0
exampleBAM.bam.bam            45  CCACCATG        Context        D                    3.0103             1       0
exampleBAM.bam.bam            45  1               Cycle          I                    7.7815             5       0
exampleBAM.bam.bam            45  13              Cycle          D                    7.7815             5       0
exampleBAM.bam.bam            16  51              Cycle          M                    3.0103             1       0
exampleBAM.bam.bam            45  CGTCCATG        Context        D                    3.0103             1       0
exampleBAM.bam.bam            45  CTGGGGTT        Context        I                    3.0103             1       0
exampleBAM.bam.bam            45  GTTGGGTT        Context        I                    3.0103             1       0
exampleBAM.bam.bam            45  TTCGGGTT        Context        I                    6.0206             3       0
exampleBAM.bam.bam            45  TTAGGGTT        Context        I                    6.0206             3       0
exampleBAM.bam.bam            45  TGGGGGTT        Context        I                    3.0103             1       0
exampleBAM.bam.bam            45  TTTGGGTT        Context        I                    3.0103             1       0
exampleBAM.bam.bam            45  TTGGGGTT        Context        I                    3.0103             1       0
exampleBAM.bam.bam             9  38              Cycle          M                    3.0103             1       0
exampleBAM.bam.bam            45  GTTATCAT        Context        I                    3.0103             1       0
exampleBAM.bam.bam            30  GC              Context        M                    3.0103             1       0
exampleBAM.bam.bam            17  TC              Context        M                    3.0103             1       0
exampleBAM.bam.bam            34  25              Cycle          M                    3.0103             1       0
exampleBAM.bam.bam            45  CCATGATA        Context        D                    3.0103             1       0
exampleBAM.bam.bam            28  11              Cycle          M                    3.0103             1       0
exampleBAM.bam.bam            45  TATTGATA        Context        D                    3.0103             1       0
exampleBAM.bam.bam            29  43              Cycle          M                    3.0103             1       0
exampleBAM.bam.bam            45  CCAGTTCT        Context        D                    3.0103             1       0
exampleBAM.bam.bam            45  CAGGTTAT        Context        I                    3.0103             1       0
exampleBAM.bam.bam            45  69              Cycle          I                    7.7815             5       0
exampleBAM.bam.bam            45  73              Cycle          D                    7.7815             5       0
exampleBAM.bam.bam            28  41              Cycle          M                    3.0103             1       0
exampleBAM.bam.bam            33  31              Cycle          M                    3.0103             1       0
exampleBAM.bam.bam            45  TGATCGTG        Context        D                    3.0103             1       0
exampleBAM.bam.bam            29  9               Cycle          M                    3.0103             1       0
exampleBAM.bam.bam            12  GC              Context        M                    3.0103             1       0
exampleBAM.bam.bam            29  6               Cycle          M                    3.0103             1       0
exampleBAM.bam.bam            45  GCCTCGTC        Context        I                    3.0103             1       0
exampleBAM.bam.bam            45  70              Cycle          D                    7.7815             5       0
exampleBAM.bam.bam            45  74              Cycle          I                    7.7815             5       0
exampleBAM.bam.bam            45  TTTGGGCT        Context        D                    3.0103             1       0
exampleBAM.bam.bam            45  TATCAATA        Context        D                    3.0103             1       0
exampleBAM.bam.bam            33  TG              Context        M                    6.0206             3       0
exampleBAM.bam.bam            45  TTGGTTAA        Context        D                    3.0103             1       0
exampleBAM.bam.bam            45  TCTAGAGT        Context        D                    3.0103             1       0
exampleBAM.bam.bam            45  TGCACTTT        Context        I                    3.0103             1       0
exampleBAM.bam.bam             4  49              Cycle          M                    3.0103             1       0
exampleBAM.bam.bam            32  18              Cycle          M                    3.0103             1       0
exampleBAM.bam.bam            10  GT              Context        M                    3.0103             1       0
exampleBAM.bam.bam            27  11              Cycle          M                    3.0103             1       0
exampleBAM.bam.bam            27  CC              Context        M                    3.0103             1       0
exampleBAM.bam.bam            45  CCATGATT        Context        I                    3.0103             1       0
exampleBAM.bam.bam             5  TT              Context        M                    1.7609             2       1
exampleBAM.bam.bam            18  56              Cycle          M                    3.0103             1       0
exampleBAM.bam.bam            45  TGGCTTTA        Context        D                    3.0103             1       0
exampleBAM.bam.bam            45  TGTCTTTA        Context        D                    3.0103             1       0
exampleBAM.bam.bam            45  TCAATGTG        Context        D                    3.0103             1       0
exampleBAM.bam.bam            12  68              Cycle          M                    3.0103             1       0
exampleBAM.bam.bam            31  32              Cycle          M                    3.0103             1       0
exampleBAM.bam.bam            45  GGAGCCTT        Context        I                    3.0103             1       0
exampleBAM.bam.bam            45  CAGATCCA        Context        I                    3.0103             1       0
exampleBAM.bam.bam            45  2               Cycle          D                    7.7815             5       0
exampleBAM.bam.bam            45  14              Cycle          I                    7.7815             5       0
exampleBAM.bam.bam            45  GCAATCCA        Context        I                    3.0103             1       0
exampleBAM.bam.bam            22  TC              Context        M                    3.0103             1       0
exampleBAM.bam.bam            45  GAGTGTTG        Context        D                    3.0103             1       0
exampleBAM.bam.bam            15  AA              Context        M                    4.7712             2       0
exampleBAM.bam.bam            45  GGGTTAGG        Context        I                    4.7712             2       0
exampleBAM.bam.bam            45  TATATCAA        Context        D                    3.0103             1       0
exampleBAM.bam.bam            17  62              Cycle          M                    3.0103             1       0
exampleBAM.bam.bam            23  TT              Context        M                    3.0103             1       0
exampleBAM.bam.bam            45  CATGATTC        Context        I                    3.0103             1       0
exampleBAM.bam.bam            45  32              Cycle          D                    7.7815             5       0
exampleBAM.bam.bam            45  44              Cycle          I                    7.7815             5       0
exampleBAM.bam.bam            45  ATCCAGTT        Context        I                    3.0103             1       0
exampleBAM.bam.bam            45  CAGTTCTA        Context        D                    3.0103             1       0
exampleBAM.bam.bam            45  CAATCCAT        Context        I                    3.0103             1       0
exampleBAM.bam.bam            45  TGATTCTA        Context        D                    3.0103             1       0
exampleBAM.bam.bam            45  TCGTCCAT        Context        I                    3.0103             1       0
exampleBAM.bam.bam            24  GT              Context        M                    4.7712             2       0
exampleBAM.bam.bam            24  13              Cycle          M                    6.0206             3       0
exampleBAM.bam.bam            30  34              Cycle          M                    3.0103             1       0
exampleBAM.bam.bam            29  AC              Context        M                    3.0103             1       0
exampleBAM.bam.bam            29  7               Cycle          M                    3.0103             1       0
exampleBAM.bam.bam            32  49              Cycle          M                    3.0103             1       0
exampleBAM.bam.bam            25  74              Cycle          M                    3.0103             1       0
exampleBAM.bam.bam            27  40              Cycle          M                    3.0103             1       0
exampleBAM.bam.bam            28  39              Cycle          M                    3.0103             1       0
exampleBAM.bam.bam            45  TTGCAATC        Context        D                    3.0103             1       0
exampleBAM.bam.bam            33  TT              Context        M                    6.9897             4       0
exampleBAM.bam.bam            30  69              Cycle          M                    3.0103             1       0
exampleBAM.bam.bam            45  71              Cycle          D                    7.7815             5       0
exampleBAM.bam.bam            45  75              Cycle          I                    7.7815             5       0
exampleBAM.bam.bam            45  AGCAAAAT        Context        D                    3.0103             1       0
exampleBAM.bam.bam            32  19              Cycle          M                    3.0103             1       0
exampleBAM.bam.bam            32  TC              Context        M                    6.0206             3       0
exampleBAM.bam.bam            29  37              Cycle          M                    3.0103             1       0
exampleBAM.bam.bam            27  CA              Context        M                    4.7712             2       0
exampleBAM.bam.bam            45  ATAAAGAC        Context        D                    3.0103             1       0
exampleBAM.bam.bam            45  CACTGATG        Context        I                    3.0103             1       0
exampleBAM.bam.bam            45  CAGCCTCG        Context        D                    3.0103             1       0
exampleBAM.bam.bam            45  GCACTTTC        Context        D                    3.0103             1       0
exampleBAM.bam.bam            25  14              Cycle          M                    3.0103             1       0
exampleBAM.bam.bam            34  23              Cycle          M                    3.0103             1       0
exampleBAM.bam.bam             6  52              Cycle          M                   -0.0000             1       1
exampleBAM.bam.bam            45  TGATATAA        Context        I                    3.0103             1       0
exampleBAM.bam.bam            45  GGTTATCA        Context        D                    3.0103             1       0
exampleBAM.bam.bam            45  TTATATCA        Context        D                    3.0103             1       0
exampleBAM.bam.bam            45  TCACTGAT        Context        D                    3.0103             1       0
exampleBAM.bam.bam            45  GTGGCCTG        Context        I                    3.0103             1       0
exampleBAM.bam.bam            45  3               Cycle          D                    7.7815             5       0
exampleBAM.bam.bam            45  15              Cycle          I                    7.7815             5       0
exampleBAM.bam.bam            17  63              Cycle          M                    3.0103             1       0
exampleBAM.bam.bam            23  TG              Context        M                    3.0103             1       0
exampleBAM.bam.bam            45  TTTGTATT        Context        D                    3.0103             1       0
exampleBAM.bam.bam            24  GG              Context        M                    4.7712             2       0
exampleBAM.bam.bam            30  35              Cycle          M                    4.7712             2       0
exampleBAM.bam.bam            45  TATCATGG        Context        D                    3.0103             1       0
exampleBAM.bam.bam            45  TGACATGG        Context        D                    3.0103             1       0
exampleBAM.bam.bam            45  AGATCCAG        Context        I                    3.0103             1       0
exampleBAM.bam.bam            45  33              Cycle          D                    7.7815             5       0
exampleBAM.bam.bam            45  45              Cycle          I                    7.7815             5       0
exampleBAM.bam.bam            45  GGAGATTA        Context        I                    3.0103             1       0
exampleBAM.bam.bam            45  ATGGTATT        Context        D                    3.0103             1       0
exampleBAM.bam.bam            45  ATCTCCAG        Context        I                    3.0103             1       0
exampleBAM.bam.bam            45  CGGGTTCG        Context        I                    3.0103             1       0
exampleBAM.bam.bam            45  AGGGTTAG        Context        D                    3.0103             1       0
exampleBAM.bam.bam            45  AGGGTTCG        Context        I                    3.0103             1       0
exampleBAM.bam.bam            45  68              Cycle          D                    7.7815             5       0
exampleBAM.bam.bam            45  72              Cycle          I                    7.7815             5       0
exampleBAM.bam.bam            45  AGTCAATG        Context        D                    3.0103             1       0
exampleBAM.bam.bam            33  18              Cycle          M                    3.0103             1       0
exampleBAM.bam.bam            33  TA              Context        M                    3.0103             1       0
exampleBAM.bam.bam            45  TGGGTTAG        Context        D                    3.0103             1       0
exampleBAM.bam.bam            45  TGGGTTCG        Context        I                    3.0103             1       0
exampleBAM.bam.bam            45  TTTTCTGT        Context        D                    3.0103             1       0
exampleBAM.bam.bam             4  TT              Context        M                   -0.0000             1       1
exampleBAM.bam.bam            29  4               Cycle          M                    3.0103             1       0
exampleBAM.bam.bam            25  73              Cycle          M                    3.0103             1       0
exampleBAM.bam.bam            45  AGCCTTTG        Context        D                    3.0103             1       0
exampleBAM.bam.bam            45  ACTCTTTG        Context        D                    3.0103             1       0
exampleBAM.bam.bam            18  58              Cycle          M                   -0.0000             1       1
exampleBAM.bam.bam            45  ATTATTGA        Context        I                    3.0103             1       0
exampleBAM.bam.bam            45  ACATGATC        Context        I                    3.0103             1       0
exampleBAM.bam.bam            28  AA              Context        M                    3.0103             1       0
exampleBAM.bam.bam            33  48              Cycle          M                    3.0103             1       0
exampleBAM.bam.bam            45  GTTAGGGT        Context        D                    6.0206             3       0
exampleBAM.bam.bam            32  16              Cycle          M                    4.7712             2       0
exampleBAM.bam.bam            32  TG              Context        M                    4.7712             2       0
exampleBAM.bam.bam            45  GGCCTGAA        Context        D                    3.0103             1       0
exampleBAM.bam.bam            45  12              Cycle          I                    7.7815             5       0
exampleBAM.bam.bam            45  AGATTAGA        Context        I                    3.0103             1       0
exampleBAM.bam.bam            45  GCAGCCTC        Context        I                    3.0103             1       0
exampleBAM.bam.bam            45  AATCCATT        Context        I                    3.0103             1       0
exampleBAM.bam.bam            45  CTTTATAT        Context        I                    3.0103             1       0
exampleBAM.bam.bam            45  CATGGTGG        Context        I                    3.0103             1       0
exampleBAM.bam.bam            22  TT              Context        M                    3.0103             1       0
exampleBAM.bam.bam            24  45              Cycle          M                    3.0103             1       0
exampleBAM.bam.bam            25  GT              Context        M                    6.0206             3       0
exampleBAM.bam.bam            31  34              Cycle          M                    3.0103             1       0
exampleBAM.bam.bam            34  20              Cycle          M                    3.0103             1       0
exampleBAM.bam.bam            45  34              Cycle          D                    7.7815             5       0
exampleBAM.bam.bam            45  46              Cycle          I                    7.7815             5       0
exampleBAM.bam.bam            45  ATGAGTCA        Context        I                    3.0103             1       0
exampleBAM.bam.bam            22  51              Cycle          M                    3.0103             1       0
exampleBAM.bam.bam            45  TTTTTCTG        Context        D                    3.0103             1       0
exampleBAM.bam.bam            45  GGGTTGGG        Context        I                    6.0206             3       0
exampleBAM.bam.bam            45  GGTTTGGG        Context        I                    4.7712             2       0
exampleBAM.bam.bam            45  TTAGATTT        Context        I                    3.0103             1       0
exampleBAM.bam.bam            30  32              Cycle          M                    3.0103             1       0
exampleBAM.bam.bam            23  19              Cycle          M                    3.0103             1       0
exampleBAM.bam.bam            23  TC              Context        M                    3.0103             1       0
exampleBAM.bam.bam            25  47              Cycle          M                    3.0103             1       0
exampleBAM.bam.bam            10  75              Cycle          M                    3.0103             1       0
exampleBAM.bam.bam            11  GG              Context        M                    3.0103             1       0
exampleBAM.bam.bam            33  TC              Context        M                    8.4510             6       0
exampleBAM.bam.bam            45  TGATCGTG        Context        I                    3.0103             1       0
exampleBAM.bam.bam            45  CAGGTTAT        Context        D                    3.0103             1       0
exampleBAM.bam.bam            45  CCAGTTCT        Context        I                    3.0103             1       0
exampleBAM.bam.bam            45  69              Cycle          D                    7.7815             5       0
exampleBAM.bam.bam            45  73              Cycle          I                    7.7815             5       0
exampleBAM.bam.bam            32  51              Cycle          M                    3.0103             1       0
exampleBAM.bam.bam            29  AT              Context        M                    4.7712             2       0
exampleBAM.bam.bam            29  5               Cycle          M                    3.0103             1       0
exampleBAM.bam.bam            33  49              Cycle          M                    3.0103             1       0
exampleBAM.bam.bam            45  TATTGATA        Context        I                    3.0103             1       0
exampleBAM.bam.bam            45  CCATGATA        Context        I                    3.0103             1       0
exampleBAM.bam.bam            32  TT              Context        M                    4.7712             2       0
exampleBAM.bam.bam            45  TGGGGGTT        Context        D                    3.0103             1       0
exampleBAM.bam.bam            45  TTAGGGTT        Context        D                    6.0206             3       0
exampleBAM.bam.bam            45  TTCGGGTT        Context        D                    6.0206             3       0
exampleBAM.bam.bam            45  TTGGGGTT        Context        D                    3.0103             1       0
exampleBAM.bam.bam            45  TTTGGGTT        Context        D                    3.0103             1       0
exampleBAM.bam.bam            45  GTTGGGTT        Context        D                    3.0103             1       0
exampleBAM.bam.bam            45  GTTATCAT        Context        D                    3.0103             1       0
exampleBAM.bam.bam            45  CGTCCATG        Context        I                    3.0103             1       0
exampleBAM.bam.bam            45  CCACCATG        Context        I                    3.0103             1       0
exampleBAM.bam.bam            45  AAGACACA        Context        D                    3.0103             1       0
exampleBAM.bam.bam            45  1               Cycle          D                    7.7815             5       0
exampleBAM.bam.bam            45  13              Cycle          I                    7.7815             5       0
exampleBAM.bam.bam            45  CTGGGGTT        Context        D                    3.0103             1       0
exampleBAM.bam.bam            22  TG              Context        M                    6.0206             3       0
exampleBAM.bam.bam            25  GG              Context        M                    4.7712             2       0
exampleBAM.bam.bam             8  CA              Context        M                    3.0103             1       0
exampleBAM.bam.bam            34  21              Cycle          M                    3.0103             1       0
exampleBAM.bam.bam            24  GA              Context        M                    3.0103             1       0
exampleBAM.bam.bam            45  GTGTTGGT        Context        I                    3.0103             1       0
exampleBAM.bam.bam            45  TCACATGA        Context        D                    3.0103             1       0
exampleBAM.bam.bam            45  GTCCATGA        Context        D                    3.0103             1       0
exampleBAM.bam.bam            45  CACCATGA        Context        D                    3.0103             1       0
exampleBAM.bam.bam            45  35              Cycle          D                    7.7815             5       0
exampleBAM.bam.bam            45  47              Cycle          I                    7.7815             5       0
exampleBAM.bam.bam            45  CTATTCTT        Context        D                    3.0103             1       0
exampleBAM.bam.bam            45  AATCTAAT        Context        D                    3.0103             1       0
exampleBAM.bam.bam            25  46              Cycle          M                    3.0103             1       0
exampleBAM.bam.bam            27  76              Cycle          M                    3.0103             1       0
exampleBAM.bam.bam            34  55              Cycle          M                    3.0103             1       0
exampleBAM.bam.bam            31  1               Cycle          M                    3.0103             1       0
exampleBAM.bam.bam            23  18              Cycle          M                    3.0103             1       0
exampleBAM.bam.bam            31  66              Cycle          M                    3.0103             1       0
exampleBAM.bam.bam            45  GAGATTAG        Context        D                    3.0103             1       0
exampleBAM.bam.bam            45  TTCAGGCC        Context        D                    3.0103             1       0
exampleBAM.bam.bam            13  AA              Context        M                    3.0103             1       0
exampleBAM.bam.bam            45  GGTTAATG        Context        D                    3.0103             1       0
exampleBAM.bam.bam            45  GGTGGAGC        Context        D                    3.0103             1       0
exampleBAM.bam.bam            21  TT              Context        M                    3.0103             1       0
exampleBAM.bam.bam            21  17              Cycle          M                    3.0103             1       0
exampleBAM.bam.bam            12  AG              Context        M                    3.0103             1       0
exampleBAM.bam.bam            45  GGCCACCA        Context        I                    3.0103             1       0
exampleBAM.bam.bam            45  GCTGGGGT        Context        D                    3.0103             1       0
exampleBAM.bam.bam            45  CTTGGCTT        Context        I                    3.0103             1       0
exampleBAM.bam.bam            45  66              Cycle          D                    7.7815             5       0
exampleBAM.bam.bam            26  GT              Context        M                    3.0103             1       0
exampleBAM.bam.bam            45  TAATCTCC        Context        D                    3.0103             1       0
exampleBAM.bam.bam            45  GTTGGGGT        Context        D                    3.0103             1       0
exampleBAM.bam.bam            28  34              Cycle          M                    3.0103             1       0
exampleBAM.bam.bam            45  TTGGGGGT        Context        D                    3.0103             1       0
exampleBAM.bam.bam            17  58              Cycle          M                    3.0103             1       0
exampleBAM.bam.bam            31  6               Cycle          M                    3.0103             1       0
exampleBAM.bam.bam            45  CCTTTGCA        Context        I                    3.0103             1       0
exampleBAM.bam.bam            45  36              Cycle          D                    7.7815             5       0
exampleBAM.bam.bam            45  40              Cycle          I                    7.7815             5       0
exampleBAM.bam.bam            45  CAGGCACC        Context        D                    3.0103             1       0
exampleBAM.bam.bam            45  GTTCTAGA        Context        I                    3.0103             1       0
exampleBAM.bam.bam            45  TATTTGCA        Context        I                    3.0103             1       0
exampleBAM.bam.bam            34  TA              Context        M                    3.0103             1       0
exampleBAM.bam.bam            25  CC              Context        M                    3.0103             1       0
exampleBAM.bam.bam            22  23              Cycle          M                    3.0103             1       0
exampleBAM.bam.bam            45  GAACTGGG        Context        I                    3.0103             1       0
exampleBAM.bam.bam            45  6               Cycle          D                    7.7815             5       0
exampleBAM.bam.bam            45  10              Cycle          I                    7.7815             5       0
exampleBAM.bam.bam            45  GGGCTGGG        Context        I                    3.0103             1       0
exampleBAM.bam.bam            45  TTGATATA        Context        D                    3.0103             1       0
exampleBAM.bam.bam            45  TTCTTAAG        Context        D                    3.0103             1       0
exampleBAM.bam.bam            27  GA              Context        M                    4.7712             2       0
exampleBAM.bam.bam            27  14              Cycle          M                    3.0103             1       0
exampleBAM.bam.bam            32  23              Cycle          M                    3.0103             1       0
exampleBAM.bam.bam            21  50              Cycle          M                    3.0103             1       0
exampleBAM.bam.bam            45  TAACCTGG        Context        D                    3.0103             1       0
exampleBAM.bam.bam            45  TCTATTCT        Context        I                    3.0103             1       0
exampleBAM.bam.bam            11  40              Cycle          M                   -0.0000             1       1
exampleBAM.bam.bam            45  TTTATTAT        Context        D                    3.0103             1       0
exampleBAM.bam.bam            45  ATGATTCT        Context        I                    3.0103             1       0
exampleBAM.bam.bam            45  CCTGGAGA        Context        D                    3.0103             1       0
exampleBAM.bam.bam            45  GCCAGGCA        Context        D                    3.0103             1       0
exampleBAM.bam.bam            12  AT              Context        M                    3.0103             1       0
exampleBAM.bam.bam            32  53              Cycle          M                    3.0103             1       0
exampleBAM.bam.bam            21  TG              Context        M                    6.0206             3       0
exampleBAM.bam.bam            26  GG              Context        M                    3.0103             1       0
exampleBAM.bam.bam            45  TCTGTGTC        Context        D                    3.0103             1       0
exampleBAM.bam.bam            45  GTTGGGGG        Context        D                    3.0103             1       0
exampleBAM.bam.bam            45  TTGGGCTG        Context        I                    3.0103             1       0
exampleBAM.bam.bam            45  AAATCTAA        Context        I                    3.0103             1       0
exampleBAM.bam.bam            45  67              Cycle          D                    7.7815             5       0
exampleBAM.bam.bam            45  CTGGAGAT        Context        D                    3.0103             1       0
exampleBAM.bam.bam            45  AGATTTTT        Context        D                    3.0103             1       0
exampleBAM.bam.bam            45  AGGCACCC        Context        I                    3.0103             1       0
exampleBAM.bam.bam            45  CTGAAAGT        Context        I                    3.0103             1       0
exampleBAM.bam.bam             8  46              Cycle          M                    3.0103             1       0
exampleBAM.bam.bam            45  TCCAGGTT        Context        D                    3.0103             1       0
exampleBAM.bam.bam            45  GTGAGTGT        Context        I                    3.0103             1       0
exampleBAM.bam.bam            24  CG              Context        M                    3.0103             1       0
exampleBAM.bam.bam            45  TTATCATG        Context        I                    3.0103             1       0
exampleBAM.bam.bam            45  ACAGCAAA        Context        I                    3.0103             1       0
exampleBAM.bam.bam            45  37              Cycle          D                    7.7815             5       0
exampleBAM.bam.bam            45  41              Cycle          I                    7.7815             5       0
exampleBAM.bam.bam            45  AGTGCAAA        Context        I                    3.0103             1       0
exampleBAM.bam.bam            34  TC              Context        M                    6.0206             3       0
exampleBAM.bam.bam            25  CA              Context        M                    3.0103             1       0
exampleBAM.bam.bam            30  AT              Context        M                    3.0103             1       0
exampleBAM.bam.bam            45  TTTATATC        Context        D                    3.0103             1       0
exampleBAM.bam.bam            45  TTACTCTT        Context        D                    3.0103             1       0
exampleBAM.bam.bam            45  GTATTACT        Context        I                    3.0103             1       0
exampleBAM.bam.bam            45  TGGTTAAT        Context        D                    3.0103             1       0
exampleBAM.bam.bam            45  7               Cycle          D                    7.7815             5       0
exampleBAM.bam.bam            45  11              Cycle          I                    7.7815             5       0
exampleBAM.bam.bam            45  CCTGAAAG        Context        D                    3.0103             1       0
exampleBAM.bam.bam            45  CTTTGCAC        Context        I                    3.0103             1       0
exampleBAM.bam.bam            45  GTGAACTG        Context        D                    3.0103             1       0
exampleBAM.bam.bam            45  TTGGCTTT        Context        I                    3.0103             1       0
exampleBAM.bam.bam            28  2               Cycle          M                    3.0103             1       0
exampleBAM.bam.bam            19  30              Cycle          M                    3.0103             1       0
exampleBAM.bam.bam            27  GT              Context        M                    3.0103             1       0
exampleBAM.bam.bam            45  64              Cycle          D                    7.7815             5       0
exampleBAM.bam.bam            45  76              Cycle          I                    7.7815             5       0
exampleBAM.bam.bam            45  AGTGTTGG        Context        I                    3.0103             1       0
exampleBAM.bam.bam            45  AGGGTTGG        Context        I                    3.0103             1       0
exampleBAM.bam.bam            45  GATTCTAT        Context        I                    3.0103             1       0
exampleBAM.bam.bam            45  AGACACAG        Context        D                    3.0103             1       0
exampleBAM.bam.bam            45  GGGGTTGG        Context        I                    4.7712             2       0
exampleBAM.bam.bam            15  68              Cycle          M                    3.0103             1       0
exampleBAM.bam.bam            45  TATAAAGA        Context        I                    3.0103             1       0
exampleBAM.bam.bam            33  22              Cycle          M                    4.7712             2       0
exampleBAM.bam.bam            12  AA              Context        M                    3.0103             1       0
exampleBAM.bam.bam            32  54              Cycle          M                    3.0103             1       0
exampleBAM.bam.bam            45  CTCGTCCA        Context        I                    3.0103             1       0
exampleBAM.bam.bam            45  38              Cycle          D                    7.7815             5       0
exampleBAM.bam.bam            45  42              Cycle          I                    7.7815             5       0
exampleBAM.bam.bam            45  TTAAGTGA        Context        I                    3.0103             1       0
exampleBAM.bam.bam            45  TTTGCAAT        Context        I                    3.0103             1       0
exampleBAM.bam.bam            45  TTTGCACT        Context        D                    3.0103             1       0
exampleBAM.bam.bam            24  CC              Context        M                    4.7712             2       0
exampleBAM.bam.bam            45  TGAGTCAA        Context        D                    3.0103             1       0
exampleBAM.bam.bam             6  TT              Context        M                    1.7609             2       1
exampleBAM.bam.bam            31  4               Cycle          M                    3.0103             1       0
exampleBAM.bam.bam            31  AG              Context        M                    4.7712             2       0
exampleBAM.bam.bam            34  50              Cycle          M                    3.0103             1       0
exampleBAM.bam.bam            27  73              Cycle          M                    3.0103             1       0
exampleBAM.bam.bam            45  GACACAGC        Context        D                    3.0103             1       0
exampleBAM.bam.bam            45  AACCTGGA        Context        I                    3.0103             1       0
exampleBAM.bam.bam            45  4               Cycle          D                    7.7815             5       0
exampleBAM.bam.bam            45  8               Cycle          I                    7.7815             5       0
exampleBAM.bam.bam            16  58              Cycle          M                    3.0103             1       0
exampleBAM.bam.bam            30  AA              Context        M                    4.7712             2       0
exampleBAM.bam.bam            24  41              Cycle          M                    3.0103             1       0
exampleBAM.bam.bam            34  TG              Context        M                    6.0206             3       0
exampleBAM.bam.bam            29  68              Cycle          M                    3.0103             1       0
exampleBAM.bam.bam            25  9               Cycle          M                    3.0103             1       0
exampleBAM.bam.bam            26  44              Cycle          M                    3.0103             1       0
exampleBAM.bam.bam            45  GGTATTAC        Context        D                    3.0103             1       0
exampleBAM.bam.bam            45  TGTGAACT        Context        I                    3.0103             1       0
exampleBAM.bam.bam            45  TGGCCTGA        Context        D                    3.0103             1       0
exampleBAM.bam.bam             5  22              Cycle          M                    3.0103             1       0
exampleBAM.bam.bam            45  AAGTGCAA        Context        I                    3.0103             1       0
exampleBAM.bam.bam            45  ATTTGCAA        Context        I                    3.0103             1       0
exampleBAM.bam.bam            45  ATCTAATC        Context        D                    3.0103             1       0
exampleBAM.bam.bam            27  GG              Context        M                    3.0103             1       0
exampleBAM.bam.bam            21  48              Cycle          M                    3.0103             1       0
exampleBAM.bam.bam            45  TGAGTGTT        Context        D                    3.0103             1       0
exampleBAM.bam.bam            13  39              Cycle          M                    3.0103             1       0
exampleBAM.bam.bam            45  TAAAGACA        Context        D                    3.0103             1       0
exampleBAM.bam.bam            33  23              Cycle          M                    3.0103             1       0
exampleBAM.bam.bam            45  GTGGAGCC        Context        I                    3.0103             1       0
exampleBAM.bam.bam            45  TTTCACAT        Context        D                    3.0103             1       0
exampleBAM.bam.bam            45  65              Cycle          D                    7.7815             5       0
exampleBAM.bam.bam            45  GATTTTTC        Context        D                    3.0103             1       0
exampleBAM.bam.bam            45  AGTTCTAG        Context        I                    3.0103             1       0
exampleBAM.bam.bam            19  61              Cycle          M                    3.0103             1       0
exampleBAM.bam.bam            28  71              Cycle          M                    3.0103             1       0
exampleBAM.bam.bam            15  35              Cycle          M                    3.0103             1       0
exampleBAM.bam.bam            24  CA              Context        M                    3.0103             1       0
exampleBAM.bam.bam            24  10              Cycle          M                   -0.0000             1       1
exampleBAM.bam.bam            45  TTATTGAT        Context        D                    3.0103             1       0
exampleBAM.bam.bam            45  ATAACCTG        Context        I                    3.0103             1       0
exampleBAM.bam.bam            45  GAAAGTGC        Context        I                    3.0103             1       0
exampleBAM.bam.bam            45  39              Cycle          D                    7.7815             5       0
exampleBAM.bam.bam            45  43              Cycle          I                    7.7815             5       0
exampleBAM.bam.bam            31  AT              Context        M                    4.7712             2       0
exampleBAM.bam.bam            31  5               Cycle          M                    3.0103             1       0
exampleBAM.bam.bam            34  51              Cycle          M                    3.0103             1       0
exampleBAM.bam.bam            27  72              Cycle          M                    3.0103             1       0
exampleBAM.bam.bam            30  AC              Context        M                    3.0103             1       0
exampleBAM.bam.bam            45  CATGGTAT        Context        D                    3.0103             1       0
exampleBAM.bam.bam            45  ATGATCGT        Context        I                    3.0103             1       0
exampleBAM.bam.bam            45  5               Cycle          D                    7.7815             5       0
exampleBAM.bam.bam            45  9               Cycle          I                    7.7815             5       0
exampleBAM.bam.bam            45  GCACCCAG        Context        I                    3.0103             1       0
exampleBAM.bam.bam            34  TT              Context        M                    8.4510             6       0
exampleBAM.bam.bam            31  39              Cycle          M                    4.7712             2       0
exampleBAM.bam.bam            14  33              Cycle          M                    3.0103             1       0