 zzh
|
fb5279120b
|
hybrid index实现seeding过程的初始代码
|
2025-06-16 10:11:29 +08:00 |
|
zzh
|
b50360bb48
|
整合了ert seeding，结果正确，完善了shm
|
2024-08-06 03:08:10 +08:00 |
|
zzh
|
364ee9756e
|
添加了共享内存支持，成功构建ert索引
|
2024-08-03 17:26:32 +08:00 |
|
zzh
|
9c9502d584
|
clean代码，结果正确
|
2024-07-26 04:15:55 +08:00 |
|
zzh
|
8c2a90e3e2
|
修改了双线程解压读写fastq.gz的bug，修改了一些测试代码
|
2024-06-24 18:11:54 +08:00 |
|
zzh
|
20e072f6af
|
所有代码都合并了，还差一点建立索引的时候，一起都建立了
|
2024-04-02 07:42:37 +08:00 |
|
zzh
|
1e3965cb7d
|
添加了可同时读写的pipeline，优化了时间统计
|
2024-03-24 04:40:09 +08:00 |
zzh
|
6e1dd08fb6
|
将seed和extend部分修改成了batch模式，好像没啥效果
|
2024-02-23 01:09:08 +08:00 |
|
zzh
|
463f7da138
|
将smem1函数用fmt结构实现了，结果基本正确
|
2024-02-07 22:08:51 +08:00 |
|
zzh
|
bf678f4dae
|
实现了用33bit表示sa，间隔为4，释放内存的时候会崩溃
|
2023-12-27 10:42:12 +08:00 |
|
zzh
|
44fe799773
|
添加了一些注释
|
2023-12-24 17:23:14 +08:00 |