diff --git a/Makefile b/Makefile
index 60c2104..9bccbf6 100644
--- a/Makefile
+++ b/Makefile
@@ -40,7 +40,7 @@ depend:
 
 QSufSort.o: QSufSort.h
 bamlite.o: bamlite.h malloc_wrap.h
-bntseq.o: bntseq.h utils.h kseq.h malloc_wrap.h
+bntseq.o: bntseq.h utils.h kseq.h malloc_wrap.h khash.h
 bwa.o: bntseq.h bwa.h bwt.h ksw.h utils.h kstring.h malloc_wrap.h kseq.h
 bwamem.o: kstring.h malloc_wrap.h bwamem.h bwt.h bntseq.h bwa.h ksw.h kvec.h
 bwamem.o: ksort.h utils.h kbtree.h
@@ -66,6 +66,7 @@ bwtsw2_core.o: khash.h ksort.h
 bwtsw2_main.o: bwt.h bwtsw2.h bntseq.h bwt_lite.h utils.h bwa.h
 bwtsw2_pair.o: utils.h bwt.h bntseq.h bwtsw2.h bwt_lite.h kstring.h
 bwtsw2_pair.o: malloc_wrap.h ksw.h
+cutvar.o: bwa.h bntseq.h bwt.h kvec.h malloc_wrap.h
 example.o: bwamem.h bwt.h bntseq.h bwa.h kseq.h malloc_wrap.h
 fastmap.o: bwa.h bntseq.h bwt.h bwamem.h kvec.h malloc_wrap.h utils.h kseq.h
 is.o: malloc_wrap.h
@@ -75,5 +76,4 @@ ksw.o: ksw.h malloc_wrap.h
 main.o: kstring.h malloc_wrap.h utils.h
 malloc_wrap.o: malloc_wrap.h
 pemerge.o: ksw.h kseq.h malloc_wrap.h kstring.h bwa.h bntseq.h bwt.h utils.h
-test-extend.o: ksw.h
 utils.o: utils.h ksort.h malloc_wrap.h kseq.h