zzh
/
bwa_perf
1
0
Fork 0
Code Issues Pull Requests Packages Projects Releases Wiki Activity
对bwa各个部分进行性能测试分析
10 Commits
1 Branch
0 Tags
265 KiB
C++ 91%
C 7.9%
Makefile 1.1%
 
 
 
Go to file
zzh e8ceb3ff58 解决了各种bug，现在结果是准确的，比原始的扩展快了30%，比64间隔的扩展快了20% 2024-02-01 13:04:57 +08:00
.vscode 解决了创建fmt过程中的bug，把bwt中保存occ的类型从uint64改成了uint32 2024-01-31 02:19:08 +08:00
.gitignore 解决了一些bug，目前看来fmt可以正常工作 2024-01-27 00:42:47 +08:00
Makefile 解决了创建fmt时候的bug，获取bwt str地址时候应该用bwt 的 occ-interval计算，而不是fmt的occ interval 2024-01-31 15:50:33 +08:00
README.md Initial commit 2023-08-23 11:32:55 +08:00
bwt.cpp 解决了各种bug，现在结果是准确的，比原始的扩展快了30%，比64间隔的扩展快了20% 2024-02-01 13:04:57 +08:00
bwt.h 解决了各种bug，现在结果是准确的，比原始的扩展快了30%，比64间隔的扩展快了20% 2024-02-01 13:04:57 +08:00
fmt_index.cpp 解决了各种bug，现在结果是准确的，比原始的扩展快了30%，比64间隔的扩展快了20% 2024-02-01 13:04:57 +08:00
fmt_index.h 解决了各种bug，现在结果是准确的，比原始的扩展快了30%，比64间隔的扩展快了20% 2024-02-01 13:04:57 +08:00
main.cpp 对代码进行了重构，基本完成了fmt-index数据结构的建立和序列查找代码，保留着一些调试信息 2024-01-25 15:45:59 +08:00
sa.cpp 对代码进行了重构，基本完成了fmt-index数据结构的建立和序列查找代码，保留着一些调试信息 2024-01-25 15:45:59 +08:00
sa.h 对代码进行了重构，基本完成了fmt-index数据结构的建立和序列查找代码，保留着一些调试信息 2024-01-25 15:45:59 +08:00
util.cpp 解决了一些bug，目前看来fmt可以正常工作 2024-01-27 00:42:47 +08:00
util.h 结果正确性没有问题，正在测试速度，稍快一些 2024-01-28 14:51:40 +08:00

README.md

bwa_perf

对bwa各个部分进行性能测试分析