对bwa各个部分进行性能测试分析

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zzh a500d76eaa 解决了创建fmt时候的bug，获取bwt str地址时候应该用bwt 的 occ-interval计算，而不是fmt的occ interval		2024-01-31 15:50:33 +08:00
.vscode	解决了创建fmt过程中的bug，把bwt中保存occ的类型从uint64改成了uint32	2024-01-31 02:19:08 +08:00
.gitignore	解决了一些bug，目前看来fmt可以正常工作	2024-01-27 00:42:47 +08:00
Makefile	解决了创建fmt时候的bug，获取bwt str地址时候应该用bwt 的 occ-interval计算，而不是fmt的occ interval	2024-01-31 15:50:33 +08:00
README.md	Initial commit	2023-08-23 11:32:55 +08:00
bwt.cpp	解决了创建fmt过程中的bug，把bwt中保存occ的类型从uint64改成了uint32	2024-01-31 02:19:08 +08:00
bwt.h	解决了创建fmt过程中的bug，把bwt中保存occ的类型从uint64改成了uint32	2024-01-31 02:19:08 +08:00
fmt_index.cpp	解决了创建fmt时候的bug，获取bwt str地址时候应该用bwt 的 occ-interval计算，而不是fmt的occ interval	2024-01-31 15:50:33 +08:00
fmt_index.h	解决了创建fmt时候的bug，获取bwt str地址时候应该用bwt 的 occ-interval计算，而不是fmt的occ interval	2024-01-31 15:50:33 +08:00
main.cpp	对代码进行了重构，基本完成了fmt-index数据结构的建立和序列查找代码，保留着一些调试信息	2024-01-25 15:45:59 +08:00
sa.cpp	对代码进行了重构，基本完成了fmt-index数据结构的建立和序列查找代码，保留着一些调试信息	2024-01-25 15:45:59 +08:00
sa.h	对代码进行了重构，基本完成了fmt-index数据结构的建立和序列查找代码，保留着一些调试信息	2024-01-25 15:45:59 +08:00
util.cpp	解决了一些bug，目前看来fmt可以正常工作	2024-01-27 00:42:47 +08:00
util.h	结果正确性没有问题，正在测试速度，稍快一些	2024-01-28 14:51:40 +08:00

README.md

bwa_perf

对bwa各个部分进行性能测试分析