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bwa_perf
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对bwa各个部分进行性能测试分析
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265 KiB
C++ 91%
C 7.9%
Makefile 1.1%
 
 
 
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zzh 5a055625c3 清理了一下代码，目前比较纯净，无bug，方便各种设置和测试 2024-02-03 02:31:00 +08:00
.vscode 解决了各种bug，目前mid interval和普通的occ interval合并在一起处理了，通过编译指导语句，进行选择和调试 2024-02-02 22:18:27 +08:00
.gitignore 清理了一下代码，目前比较纯净，无bug，方便各种设置和测试 2024-02-03 02:31:00 +08:00
Makefile 清理了一下代码，目前比较纯净，无bug，方便各种设置和测试 2024-02-03 02:31:00 +08:00
README.md Initial commit 2023-08-23 11:32:55 +08:00
bwt.cpp 清理了一下代码，目前比较纯净，无bug，方便各种设置和测试 2024-02-03 02:31:00 +08:00
bwt.h 清理了一下代码，目前比较纯净，无bug，方便各种设置和测试 2024-02-03 02:31:00 +08:00
fmt_index.cpp 清理了一下代码，目前比较纯净，无bug，方便各种设置和测试 2024-02-03 02:31:00 +08:00
fmt_index.h 清理了一下代码，目前比较纯净，无bug，方便各种设置和测试 2024-02-03 02:31:00 +08:00
main.cpp 清理了一下代码，目前比较纯净，无bug，方便各种设置和测试 2024-02-03 02:31:00 +08:00
sa.cpp 清理了一下代码，目前比较纯净，无bug，方便各种设置和测试 2024-02-03 02:31:00 +08:00
sa.h 对代码进行了重构，基本完成了fmt-index数据结构的建立和序列查找代码，保留着一些调试信息 2024-01-25 15:45:59 +08:00
util.cpp 解决了一些bug，目前看来fmt可以正常工作 2024-01-27 00:42:47 +08:00
util.h 结果正确性没有问题，正在测试速度，稍快一些 2024-01-28 14:51:40 +08:00

README.md

bwa_perf

对bwa各个部分进行性能测试分析