对bwa各个部分进行性能测试分析

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zzh 555e39df94 验证了fmt-index的正确性，用两种方式进行了实现，第二种记录b1和b2的occ以及大于他们的碱基的occ，更快一些		2024-01-29 23:14:46 +08:00
.vscode	验证了fmt-index的正确性，用两种方式进行了实现，第二种记录b1和b2的occ以及大于他们的碱基的occ，更快一些	2024-01-29 23:14:46 +08:00
.gitignore	解决了一些bug，目前看来fmt可以正常工作	2024-01-27 00:42:47 +08:00
Makefile	验证了fmt-index的正确性，用两种方式进行了实现，第二种记录b1和b2的occ以及大于他们的碱基的occ，更快一些	2024-01-29 23:14:46 +08:00
README.md	Initial commit	2023-08-23 11:32:55 +08:00
bwt.cpp	验证了fmt-index的正确性，用两种方式进行了实现，第二种记录b1和b2的occ以及大于他们的碱基的occ，更快一些	2024-01-29 23:14:46 +08:00
bwt.h	结果正确性没有问题，正在测试速度，稍快一些	2024-01-28 14:51:40 +08:00
fmt_index.cpp	验证了fmt-index的正确性，用两种方式进行了实现，第二种记录b1和b2的occ以及大于他们的碱基的occ，更快一些	2024-01-29 23:14:46 +08:00
fmt_index.h	验证了fmt-index的正确性，用两种方式进行了实现，第二种记录b1和b2的occ以及大于他们的碱基的occ，更快一些	2024-01-29 23:14:46 +08:00
main.cpp	对代码进行了重构，基本完成了fmt-index数据结构的建立和序列查找代码，保留着一些调试信息	2024-01-25 15:45:59 +08:00
sa.cpp	对代码进行了重构，基本完成了fmt-index数据结构的建立和序列查找代码，保留着一些调试信息	2024-01-25 15:45:59 +08:00
sa.h	对代码进行了重构，基本完成了fmt-index数据结构的建立和序列查找代码，保留着一些调试信息	2024-01-25 15:45:59 +08:00
util.cpp	解决了一些bug，目前看来fmt可以正常工作	2024-01-27 00:42:47 +08:00
util.h	结果正确性没有问题，正在测试速度，稍快一些	2024-01-28 14:51:40 +08:00

README.md

bwa_perf

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