zzh
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e8ceb3ff58
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解决了各种bug,现在结果是准确的,比原始的扩展快了30%,比64间隔的扩展快了20%
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2024-02-01 13:04:57 +08:00 |
zzh
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a500d76eaa
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解决了创建fmt时候的bug,获取bwt str地址时候应该用bwt 的 occ-interval计算,而不是fmt的occ interval
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2024-01-31 15:50:33 +08:00 |
zzh
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fe34be5d3a
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解决了创建fmt过程中的bug,把bwt中保存occ的类型从uint64改成了uint32
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2024-01-31 02:19:08 +08:00 |
zzh
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555e39df94
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验证了fmt-index的正确性,用两种方式进行了实现,第二种记录b1和b2的occ以及大于他们的碱基的occ,更快一些
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2024-01-29 23:14:46 +08:00 |
Gitea
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c69cb901bb
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解决了一些bug,目前看来fmt可以正常工作
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2024-01-27 00:42:47 +08:00 |
Gitea
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8e1576a2cd
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对代码进行了重构,基本完成了fmt-index数据结构的建立和序列查找代码,保留着一些调试信息
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2024-01-25 15:45:59 +08:00 |