zzh
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b0cfa3630e
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添加了kmer_bit，用来检测特定长度的kmer有没有对应的fm-index匹配
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2024-02-13 11:39:25 +08:00 |
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zzh
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45318fc95b
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解决了各种bug，目前mid interval和普通的occ interval合并在一起处理了，通过编译指导语句，进行选择和调试
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2024-02-02 22:18:27 +08:00 |
 zzh
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fe34be5d3a
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解决了创建fmt过程中的bug，把bwt中保存occ的类型从uint64改成了uint32
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2024-01-31 02:19:08 +08:00 |
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zzh
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555e39df94
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验证了fmt-index的正确性，用两种方式进行了实现，第二种记录b1和b2的occ以及大于他们的碱基的occ，更快一些
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2024-01-29 23:14:46 +08:00 |
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zzh
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22b75d335b
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结果正确性没有问题，正在测试速度，稍快一些
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2024-01-28 14:51:40 +08:00 |
Gitea
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51127278f0
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bwa-mem各个部分优化和测试工程，初始化
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2024-01-25 08:57:03 +08:00 |