 zzh
|
bad3112151
|
在这个基础上修改用于测试fmt消融测试的版本
|
2024-03-25 10:41:02 +08:00 |
zzh
|
b0cfa3630e
|
添加了kmer_bit，用来检测特定长度的kmer有没有对应的fm-index匹配
|
2024-02-13 11:39:25 +08:00 |
|
zzh
|
45318fc95b
|
解决了各种bug，目前mid interval和普通的occ interval合并在一起处理了，通过编译指导语句，进行选择和调试
|
2024-02-02 22:18:27 +08:00 |
|
zzh
|
fe34be5d3a
|
解决了创建fmt过程中的bug，把bwt中保存occ的类型从uint64改成了uint32
|
2024-01-31 02:19:08 +08:00 |
|
zzh
|
555e39df94
|
验证了fmt-index的正确性，用两种方式进行了实现，第二种记录b1和b2的occ以及大于他们的碱基的occ，更快一些
|
2024-01-29 23:14:46 +08:00 |
|
zzh
|
22b75d335b
|
结果正确性没有问题，正在测试速度，稍快一些
|
2024-01-28 14:51:40 +08:00 |
Gitea
|
51127278f0
|
bwa-mem各个部分优化和测试工程，初始化
|
2024-01-25 08:57:03 +08:00 |