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.vscode
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在这个基础上修改用于测试fmt消融测试的版本
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2024-03-25 10:41:02 +08:00 |
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.gitignore
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清理了一下代码，目前比较纯净，无bug，方便各种设置和测试
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2024-02-03 02:31:00 +08:00 |
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Makefile
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清理了一下代码，目前比较纯净，无bug，方便各种设置和测试
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2024-02-03 02:31:00 +08:00 |
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README.md
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Initial commit
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2023-08-23 11:32:55 +08:00 |
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bwt.cpp
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消融实验测试版本
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2024-04-01 21:32:48 +08:00 |
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bwt.h
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消融实验测试版本
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2024-04-01 21:32:48 +08:00 |
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fmt_index.cpp
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消融实验测试版本
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2024-04-01 21:32:48 +08:00 |
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fmt_index.h
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消融实验测试版本
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2024-04-01 21:32:48 +08:00 |
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main.cpp
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清理了一下代码，目前比较纯净，无bug，方便各种设置和测试
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2024-02-03 02:31:00 +08:00 |
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sa.cpp
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清理了一下代码，目前比较纯净，无bug，方便各种设置和测试
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2024-02-03 02:31:00 +08:00 |
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sa.h
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对代码进行了重构，基本完成了fmt-index数据结构的建立和序列查找代码，保留着一些调试信息
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2024-01-25 15:45:59 +08:00 |
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util.cpp
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添加了kmer index，有效果，但是不明显，有可能是随着序列的边长，后边的扩展更耗时
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2024-02-03 10:06:51 +08:00 |
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util.h
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消融实验测试版本
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2024-04-01 21:32:48 +08:00 |
zzh
98ae5bb779