Commit Graph

24 Commits (main)

Author SHA1 Message Date
zzh 62538d512d update some annotations 2025-04-23 15:07:26 +08:00
zzh 6175ce9a83 Merge branch 'main' of https://github.com/zzhofict/FastDup 2025-04-23 15:02:54 +08:00
zzh ab7da8a7d7 Change some annotations 2025-04-23 14:59:40 +08:00
liyewen521 8cbff0ff69 update readme 2025-04-16 14:38:56 +00:00
liyewen521 49ecf7ae5f update readme 2025-04-16 14:38:43 +00:00
zzh b0b9efdc66 Add test files and script 2025-04-16 22:20:21 +08:00
zzh 32920ffe64 注释了一些调试代码 2025-04-14 13:56:45 +08:00
zzh ee45166765 定稿版本,在论文投出之前不改了 2025-03-05 10:24:52 +08:00
zzh 62708dda77 删除不需要的文件 2025-03-04 01:30:33 +08:00
zzh f13c875a5e 删除了一些调试信息,可以发布的版本了 2025-03-04 01:29:19 +08:00
zzh 3606562de9 完美解决了所有问题,基本都是由排序带来的,排序过程涉及的变量太多,导致范围跟预想的不一致,现在都解决了 2025-03-04 00:40:57 +08:00
zzh 64d23b3f2d 解决了一些bug,但是还有问题,保留了一些调试代码 2025-02-28 03:06:21 +08:00
zzh fb8c7755f5 改用了三数据块处理方式,解决了之前的问题,代码还没整理完全,有注释和调试信息 2025-02-24 17:27:52 +08:00
zzh 670d777824 测试代码,不输出bam文件 2025-02-17 22:37:37 +08:00
zzh ed27b0387f 更新readme 2024-12-18 22:22:10 +08:00
zzh f3dc2c30f8 在README中添加Usage 2024-12-16 15:44:02 +08:00
zzh 52c5610f1c 添加README内容 2024-12-16 15:38:26 +08:00
zzh 01d14d539f 去掉了一些调试信息,把cout等输出都换成了spdlog,可以作为开源代码发布了,README还需要详细写一写 2024-12-16 02:55:11 +08:00
zzh 5d9a52e90b 重构完毕,正确运行,加了一些性能统计数据 2024-12-15 17:18:07 +08:00
zzh e8b5b4405a 代码重构基本完成,还差markdup里的一些调用和处理代码 2024-12-15 03:20:35 +08:00
zzh 27e0af955e 添加log,argparse等第三方库,修改代码 2024-12-14 12:24:19 +08:00
zzh 1c35dafbf8 创建所有相关代码文件,正确的命名 2024-12-14 01:41:08 +08:00
zzh 4e78bf294c 添加htslib 2024-12-14 01:05:52 +08:00
zzh 37165ff24f Initial commit 2023-10-21 00:28:08 +08:00