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FastBQSR
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对GATK bqsr部分进行并行优化
10 Commits
1 Branch
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6.3 MiB
C 66.7%
C++ 26.2%
Shell 3.9%
Makefile 1.2%
M4 0.8%
Other 1.2%
 
 
 
 
 
 
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zzh 1cd1a72760 修复了一个bug，把结果代码移除round循环，对于大文件(5G的fastdup-mini)结果不对，差挺多 2025-12-28 23:43:58 +08:00
ext FastBQSR Init 2025-11-23 23:03:37 +08:00
src 修复了一个bug，把结果代码移除round循环，对于大文件(5G的fastdup-mini)结果不对，差挺多 2025-12-28 23:43:58 +08:00
test 在小数据集上结果与gatk一致（版本gatk-package-4.6.2.0-17） 2025-12-28 23:04:45 +08:00
.gitignore bqsr第一阶段完成了，结果还有点错误，得调试一下 2025-12-28 14:33:45 +08:00
CMakeLists.txt FastBQSR Init 2025-11-23 23:03:37 +08:00
README.md FastBQSR Init and Merge 2025-11-23 23:07:13 +08:00

README.md

FastBQSR

对GATK bqsr部分进行并行优化

Implement the same functions as GATK for BaseRecalibrator and ApplyBQSR