 zzh
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3815a67618
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修改多维数组实现方式，更有利于连续访存，修改reclatable的索引次序
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2025-12-30 01:21:13 +08:00 |
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zzh
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b526306e87
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继续重构，小数据结果一致，大数据还是有问题
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2025-12-29 23:18:46 +08:00 |
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zzh
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1e5a291eb7
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重构了一下，大数据问题还没解决
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2025-12-29 19:36:38 +08:00 |
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zzh
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1864736509
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改了一些问题，小数据集结果没问题，但是对于5G的稍微大一些的数据集还是错误
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2025-12-29 16:48:55 +08:00 |
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1cd1a72760
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修复了一个bug，把结果代码移除round循环，对于大文件(5G的fastdup-mini)结果不对，差挺多
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2025-12-28 23:43:58 +08:00 |
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6662435948
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上一个commit为啥没有包含所有更改文件
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2025-12-28 23:06:03 +08:00 |
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8e3388a494
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在小数据集上结果与gatk一致（版本gatk-package-4.6.2.0-17）
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2025-12-28 23:04:45 +08:00 |
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146055fc01
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bqsr第一阶段完成了，结果还有点错误，得调试一下
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2025-12-28 14:33:45 +08:00 |
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zzh
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25f079b936
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串行版本还差最后一步，将信息合并到数据汇总表中
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2025-12-24 12:47:26 +08:00 |
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zzh
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1e9b58fac1
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到了读取和解析known vcf部分了，性能还需优化
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2025-12-20 16:35:45 +08:00 |
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zzh
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0fca937fab
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搭建串行框架
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2025-12-04 22:26:13 +08:00 |
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zzh
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14f1611ab6
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FastBQSR Init and Merge
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2025-11-23 23:07:13 +08:00 |
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zzh
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e4d26486ef
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FastBQSR Init
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2025-11-23 23:03:37 +08:00 |
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zzh
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f496edb5be
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Initial commit
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2025-04-15 16:48:36 +08:00 |